205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0104 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0104  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 406 aa  834    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.010788  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  37.74 
 
 		 637 aa  249  9e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  36.56 
 
 		 603 aa  242  7.999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  37.57 
 
 		 681 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  36.39 
 
 		 583 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 		 636 aa  192  9e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  33.96 
 
 		 653 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  33.96 
 
 		 653 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  33.87 
 
 		 473 aa  189  8e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 		 935 aa  189  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  30.64 
 
 		 1677 aa  188  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  32.45 
 
 		 546 aa  186  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4127  TPR repeat-containing protein  32.06 
 
 		 655 aa  177  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248641  normal  0.206732 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  31.13 
 
 		 387 aa  176  7e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  31.02 
 
 		 472 aa  172  6.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  27.47 
 
 		 457 aa  169  7e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 		 1038 aa  169  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 		 955 aa  168  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  31.61 
 
 		 578 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  30.13 
 
 		 542 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  28.61 
 
 		 740 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 		 615 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 		 523 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 		 520 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  30.64 
 
 		 1827 aa  161  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 		 612 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 602 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 		 574 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  28.75 
 
 		 577 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 3145 aa  158  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  28.31 
 
 		 1005 aa  158  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  30.71 
 
 		 872 aa  158  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 		 688 aa  157  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 601 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 		 636 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 556 aa  157  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.78 
 
 		 1034 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  30.42 
 
 		 747 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2921  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 		 389 aa  155  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  28.34 
 
 		 620 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 		 1212 aa  152  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  26.98 
 
 		 620 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 608 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  29.49 
 
 		 1077 aa  152  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  29.18 
 
 		 529 aa  152  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1212  hypothetical protein  29.95 
 
 		 385 aa  151  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 		 662 aa  151  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 		 592 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 		 637 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 780 aa  150  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  26.68 
 
 		 558 aa  150  5e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 		 1450 aa  150  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  31.8 
 
 		 595 aa  149  6e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 		 639 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  27.85 
 
 		 1764 aa  144  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.27 
 
 		 689 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  27.82 
 
 		 703 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4266  hypothetical protein  29.73 
 
 		 389 aa  142  9e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 		 593 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 		 611 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  28.88 
 
 		 747 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  26.2 
 
 		 626 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 		 527 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 		 635 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 		 635 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  27.47 
 
 		 646 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 505 aa  140  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  26.29 
 
 		 626 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1568  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 		 487 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 		 611 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 		 614 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  26.29 
 
 		 614 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  26.29 
 
 		 614 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  26.58 
 
 		 626 aa  140  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 		 614 aa  140  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  27.44 
 
 		 438 aa  139  7.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.73 
 
 		 760 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 		 767 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 		 649 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 		 649 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 588 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  26.02 
 
 		 614 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1361  hypothetical protein  25.93 
 
 		 499 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.995153  normal  0.533699 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  26.86 
 
 		 540 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  26.43 
 
 		 496 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  26.96 
 
 		 714 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  25.73 
 
 		 412 aa  137  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  26.43 
 
 		 600 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  28.34 
 
 		 503 aa  136  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  27.2 
 
 		 648 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.34 
 
 		 454 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 		 714 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.85 
 
 		 604 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  25.75 
 
 		 545 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 		 545 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.26 
 
 		 545 aa  133  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1856  hypothetical protein  31.17 
 
 		 360 aa  133  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  25.65 
 
 		 484 aa  132  7.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  26.74 
 
 		 546 aa  132  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 		 571 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>