222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1361 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2766  Tetratricopeptide TPR_4  89.07 
 
 
492 aa  838    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392213  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1361  hypothetical protein  100 
 
 
499 aa  1003    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.995153  normal  0.533699 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1568  TPR repeat-containing protein  66.05 
 
 
487 aa  623  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1218  hypothetical protein  39.07 
 
 
602 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3327  hypothetical protein  38.66 
 
 
602 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.65009 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
611 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  36.42 
 
 
545 aa  200  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  35.56 
 
 
592 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  35.7 
 
 
545 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  35.98 
 
 
546 aa  196  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  34.9 
 
 
545 aa  196  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.39 
 
 
545 aa  195  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  38.5 
 
 
496 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  38.5 
 
 
600 aa  193  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4231  TPR repeat-containing protein  36.71 
 
 
536 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  35.43 
 
 
602 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  36.95 
 
 
473 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  34.24 
 
 
607 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  38.15 
 
 
571 aa  191  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 
559 aa  188  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  34.51 
 
 
588 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  38.5 
 
 
573 aa  187  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  35.13 
 
 
601 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0955  TPR domain-containing protein  36.59 
 
 
705 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497218  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  35.93 
 
 
593 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  34.51 
 
 
1450 aa  184  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  36.14 
 
 
608 aa  183  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  32.26 
 
 
653 aa  182  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 
653 aa  182  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  34.79 
 
 
1077 aa  178  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 
542 aa  176  8e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1949  TPR repeat-containing protein  35.26 
 
 
598 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.411479  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  34.44 
 
 
472 aa  173  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2044  TPR domain-containing protein  35.26 
 
 
598 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0462  TPR domain-containing protein  35.26 
 
 
711 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317996  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  34.33 
 
 
556 aa  169  9e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1856  hypothetical protein  32.38 
 
 
360 aa  166  9e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  34.96 
 
 
558 aa  163  6e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  31.21 
 
 
1005 aa  163  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 
505 aa  163  8.000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  32.51 
 
 
527 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 
1212 aa  160  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  32.53 
 
 
387 aa  160  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 
1038 aa  159  9e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.63 
 
 
1034 aa  159  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.06 
 
 
604 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4266  hypothetical protein  31.38 
 
 
389 aa  156  7e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 
578 aa  156  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 
546 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 
714 aa  155  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 
648 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  31.61 
 
 
574 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3326  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 
607 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  32.77 
 
 
740 aa  154  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0045  TPR repeat-containing protein  30.73 
 
 
451 aa  152  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717523  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  32.15 
 
 
502 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  32.15 
 
 
502 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  30.16 
 
 
1677 aa  151  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 
3145 aa  150  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  32.16 
 
 
502 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  26.68 
 
 
1764 aa  149  8e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.8 
 
 
760 aa  149  8e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 
688 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  32.1 
 
 
595 aa  149  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 
955 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  30.99 
 
 
714 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 
484 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2618  hypothetical protein  28.2 
 
 
630 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.34 
 
 
689 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  31.1 
 
 
649 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  31.1 
 
 
649 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  32.29 
 
 
872 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1212  hypothetical protein  32.11 
 
 
385 aa  147  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  33.56 
 
 
636 aa  147  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 
520 aa  147  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 
1454 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 
1451 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  30.86 
 
 
646 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  34.59 
 
 
615 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  30.13 
 
 
503 aa  144  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  32.28 
 
 
577 aa  144  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.29 
 
 
454 aa  143  6e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 
935 aa  143  7e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  29.64 
 
 
703 aa  143  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  34.73 
 
 
620 aa  143  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  34.81 
 
 
620 aa  142  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1511  TPR domain-containing protein  28.75 
 
 
525 aa  139  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000212111  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 
457 aa  139  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 
767 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0104  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 
406 aa  137  4e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.010788  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0551  TPR domain-containing protein  33.87 
 
 
541 aa  136  8e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.475712  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0842  TPR domain-containing protein  32.74 
 
 
509 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1752  TPR domain-containing protein  32.74 
 
 
509 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2193  hypothetical protein  34.41 
 
 
552 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.257846  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0645  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 
509 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  25.39 
 
 
780 aa  135  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1363  TPR domain-containing protein  32.74 
 
 
509 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.134471  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0511  TPR domain-containing protein  32.74 
 
 
509 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.893562  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2057  hypothetical protein  34.41 
 
 
541 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  31.02 
 
 
540 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.186285 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>