171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3327 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1218  hypothetical protein  85.05 
 
 		 602 aa  978    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3327  hypothetical protein  100 
 
 		 602 aa  1188    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.65009 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1568  TPR repeat-containing protein  42.11 
 
 		 487 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1361  hypothetical protein  39.22 
 
 		 499 aa  300  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.995153  normal  0.533699 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2766  Tetratricopeptide TPR_4  40.91 
 
 		 492 aa  297  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  34.65 
 
 		 545 aa  206  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 		 607 aa  206  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  37 
 
 		 601 aa  197  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  35.23 
 
 		 559 aa  195  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  32.81 
 
 		 611 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.92 
 
 		 545 aa  194  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  37.53 
 
 		 602 aa  194  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  36.18 
 
 		 545 aa  190  8e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  34.5 
 
 		 588 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 		 545 aa  187  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  32.68 
 
 		 546 aa  184  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  36.68 
 
 		 600 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0955  TPR domain-containing protein  35.85 
 
 		 705 aa  182  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497218  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  36.68 
 
 		 496 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 571 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4231  TPR repeat-containing protein  34.63 
 
 		 536 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  37.02 
 
 		 573 aa  177  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  36.46 
 
 		 593 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  36.26 
 
 		 608 aa  174  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  31.38 
 
 		 1677 aa  170  8e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  36.46 
 
 		 502 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  36.2 
 
 		 502 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  36.2 
 
 		 502 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2044  TPR domain-containing protein  35.35 
 
 		 598 aa  163  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0462  TPR domain-containing protein  36.22 
 
 		 711 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317996  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  33.05 
 
 		 592 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  35 
 
 		 387 aa  162  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  31.16 
 
 		 546 aa  162  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1949  TPR repeat-containing protein  35.35 
 
 		 598 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.411479  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  29.68 
 
 		 653 aa  159  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  29.68 
 
 		 653 aa  159  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  38.24 
 
 		 639 aa  159  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  35.91 
 
 		 747 aa  157  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  37.76 
 
 		 635 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  28.27 
 
 		 780 aa  157  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  37.76 
 
 		 635 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  32.59 
 
 		 556 aa  155  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  38.01 
 
 		 636 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  34.52 
 
 		 615 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  37.46 
 
 		 611 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  31.78 
 
 		 473 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  34.67 
 
 		 1005 aa  153  7e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  37.83 
 
 		 637 aa  153  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  36.98 
 
 		 615 aa  153  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  31.43 
 
 		 648 aa  153  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  34.12 
 
 		 740 aa  152  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  36.09 
 
 		 620 aa  152  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 		 1038 aa  152  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  32.81 
 
 		 574 aa  150  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  37.72 
 
 		 612 aa  150  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 527 aa  150  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1516  TPR domain-containing protein  32.26 
 
 		 360 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  34.59 
 
 		 747 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  30.24 
 
 		 505 aa  149  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 		 484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 		 578 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  32.7 
 
 		 472 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  32.16 
 
 		 1212 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  30.42 
 
 		 703 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  31.44 
 
 		 872 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  32.55 
 
 		 636 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 		 542 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  31.07 
 
 		 1077 aa  149  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.43 
 
 		 454 aa  149  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  36.39 
 
 		 620 aa  148  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  33.53 
 
 		 457 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4266  hypothetical protein  31.55 
 
 		 389 aa  147  7.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 		 520 aa  146  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  29.53 
 
 		 955 aa  145  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  30.98 
 
 		 767 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1856  hypothetical protein  31.96 
 
 		 360 aa  145  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  36.95 
 
 		 626 aa  144  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  32.53 
 
 		 558 aa  144  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 3145 aa  144  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1212  hypothetical protein  32.94 
 
 		 385 aa  144  7e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  31.36 
 
 		 503 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 		 637 aa  142  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.3 
 
 		 1034 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  30.44 
 
 		 1450 aa  141  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  28.86 
 
 		 688 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 523 aa  140  7e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  36.58 
 
 		 626 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.23 
 
 		 689 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  36.66 
 
 		 614 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  36.39 
 
 		 614 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  36.39 
 
 		 626 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  36.39 
 
 		 614 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  36.39 
 
 		 614 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  36.39 
 
 		 614 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  24.71 
 
 		 583 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  26.75 
 
 		 603 aa  134  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  30.91 
 
 		 550 aa  133  9e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0045  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 		 451 aa  133  9e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  32.79 
 
 		 577 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2618  hypothetical protein  32.19 
 
 		 630 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>