More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0462 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A1949  TPR repeat-containing protein  99.67 
 
 
598 aa  1169    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.411479  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2044  TPR domain-containing protein  99.83 
 
 
598 aa  1170    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0462  TPR domain-containing protein  100 
 
 
711 aa  1400    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317996  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0955  TPR domain-containing protein  89.18 
 
 
705 aa  993    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497218  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  44.07 
 
 
607 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  41.79 
 
 
611 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  45.95 
 
 
546 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  45.78 
 
 
545 aa  396  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  47.08 
 
 
545 aa  395  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  50 
 
 
593 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  44.74 
 
 
588 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  47.29 
 
 
545 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  46.95 
 
 
559 aa  365  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  47.07 
 
 
496 aa  364  4e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  47.09 
 
 
545 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  47.07 
 
 
600 aa  363  6e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  47.03 
 
 
571 aa  360  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  46.65 
 
 
573 aa  353  7e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5711  Tetratricopeptide TPR_2 domain-containing protein  46.88 
 
 
488 aa  323  7e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4231  TPR repeat-containing protein  43.2 
 
 
536 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  33.81 
 
 
648 aa  244  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  36.33 
 
 
767 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  37.48 
 
 
608 aa  230  6e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  36.98 
 
 
703 aa  229  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  35.92 
 
 
740 aa  228  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 
1827 aa  226  8e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  34.8 
 
 
1005 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  31.86 
 
 
523 aa  219  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  33.63 
 
 
662 aa  219  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.6 
 
 
1034 aa  219  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  37.53 
 
 
574 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  32.3 
 
 
1450 aa  217  5.9999999999999996e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  32.74 
 
 
615 aa  216  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 
3145 aa  216  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  36.17 
 
 
556 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.62 
 
 
689 aa  213  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  35.73 
 
 
484 aa  213  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  31.66 
 
 
747 aa  213  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 
688 aa  213  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  36.76 
 
 
577 aa  209  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  35.24 
 
 
578 aa  207  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  32.06 
 
 
1038 aa  204  6e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 
955 aa  201  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  37.29 
 
 
529 aa  201  3.9999999999999996e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.42 
 
 
454 aa  201  5e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  34.49 
 
 
542 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  35.01 
 
 
747 aa  196  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1568  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 
487 aa  194  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  34.53 
 
 
558 aa  194  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  33.91 
 
 
473 aa  194  6e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 
620 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  29.12 
 
 
653 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  29.12 
 
 
653 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  33.13 
 
 
602 aa  191  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  33.46 
 
 
601 aa  191  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  32.52 
 
 
1764 aa  191  4e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  34.19 
 
 
649 aa  190  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  34.19 
 
 
649 aa  190  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  34.22 
 
 
520 aa  190  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 
780 aa  190  8e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  37.47 
 
 
636 aa  190  9e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  33.55 
 
 
472 aa  190  9e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  35 
 
 
412 aa  189  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  33.82 
 
 
505 aa  190  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1361  hypothetical protein  33.47 
 
 
499 aa  190  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.995153  normal  0.533699 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  34.84 
 
 
646 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  33.18 
 
 
438 aa  188  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  33.57 
 
 
872 aa  188  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 
592 aa  188  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  32.98 
 
 
550 aa  187  4e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  31.64 
 
 
620 aa  188  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 
615 aa  187  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2766  Tetratricopeptide TPR_4  36.07 
 
 
492 aa  187  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392213  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.38 
 
 
760 aa  182  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1218  hypothetical protein  36.38 
 
 
602 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  32.06 
 
 
1677 aa  181  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  35.6 
 
 
626 aa  181  5.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 
714 aa  179  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  32.87 
 
 
935 aa  180  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0842  TPR domain-containing protein  34.45 
 
 
509 aa  179  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0645  TPR repeat-containing protein  34.45 
 
 
509 aa  179  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1363  TPR domain-containing protein  34.45 
 
 
509 aa  179  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.134471  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0511  TPR domain-containing protein  34.45 
 
 
509 aa  179  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.893562  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1752  TPR domain-containing protein  34.45 
 
 
509 aa  178  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  25.85 
 
 
681 aa  177  6e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1567  TPR repeat-containing protein  34.24 
 
 
509 aa  177  7e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.085115  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 
566 aa  177  7e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 
457 aa  176  9e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  32.59 
 
 
527 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1592  TPR repeat-containing protein  34.24 
 
 
509 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0865529  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  30.42 
 
 
1454 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  30.42 
 
 
1451 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  31.26 
 
 
595 aa  175  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 
639 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  34.58 
 
 
387 aa  174  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1516  TPR domain-containing protein  33.88 
 
 
360 aa  172  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  34.98 
 
 
1212 aa  172  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  25.73 
 
 
637 aa  171  4e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1511  TPR domain-containing protein  29.96 
 
 
525 aa  170  7e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000212111  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.6 
 
 
604 aa  170  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>