More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4384 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  100 
 
 
546 aa  1099    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  83.58 
 
 
545 aa  896    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  60.26 
 
 
545 aa  621  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  58.87 
 
 
545 aa  589  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  58.68 
 
 
545 aa  587  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  61.69 
 
 
571 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  57.56 
 
 
559 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  61.48 
 
 
593 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  55.41 
 
 
588 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  60.08 
 
 
600 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  60.66 
 
 
496 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  59.88 
 
 
573 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4231  TPR repeat-containing protein  56.18 
 
 
536 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  45.27 
 
 
607 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  45.32 
 
 
611 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0955  TPR domain-containing protein  44.27 
 
 
705 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497218  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0462  TPR domain-containing protein  46.03 
 
 
711 aa  352  7e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317996  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2044  TPR domain-containing protein  46.03 
 
 
598 aa  352  8e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1949  TPR repeat-containing protein  45.83 
 
 
598 aa  350  5e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.411479  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  37.45 
 
 
703 aa  246  8e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  33.27 
 
 
574 aa  244  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  33.81 
 
 
578 aa  240  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  36 
 
 
740 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  34.63 
 
 
577 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
1827 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  34.17 
 
 
767 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  35.26 
 
 
601 aa  226  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  33.21 
 
 
1450 aa  224  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  33.77 
 
 
1764 aa  224  4e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  35.74 
 
 
608 aa  223  8e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  33.12 
 
 
1038 aa  222  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  30.92 
 
 
523 aa  222  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  33.47 
 
 
747 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  32.4 
 
 
688 aa  221  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  34.41 
 
 
602 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  35.82 
 
 
542 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  34.95 
 
 
473 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 
3145 aa  216  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  34.68 
 
 
520 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  32.61 
 
 
648 aa  208  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  35.66 
 
 
556 aa  208  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  35.47 
 
 
472 aa  205  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  34.11 
 
 
872 aa  206  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.62 
 
 
1034 aa  205  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  40.85 
 
 
747 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.29 
 
 
689 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  31.78 
 
 
653 aa  202  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 
653 aa  202  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  32.27 
 
 
1077 aa  201  3.9999999999999996e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1568  TPR repeat-containing protein  35.31 
 
 
487 aa  200  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  32.11 
 
 
592 aa  199  9e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  32.28 
 
 
955 aa  199  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  33.75 
 
 
1005 aa  197  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  32.03 
 
 
1677 aa  197  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  33.52 
 
 
615 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1361  hypothetical protein  35.98 
 
 
499 aa  196  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.995153  normal  0.533699 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  34.18 
 
 
529 aa  195  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  32.7 
 
 
484 aa  195  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 
780 aa  195  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 
935 aa  194  5e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  34.35 
 
 
527 aa  193  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5711  Tetratricopeptide TPR_2 domain-containing protein  33.5 
 
 
488 aa  193  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1218  hypothetical protein  36.54 
 
 
602 aa  192  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  35.34 
 
 
387 aa  191  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  34.12 
 
 
620 aa  190  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  30 
 
 
615 aa  190  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2766  Tetratricopeptide TPR_4  35.41 
 
 
492 aa  189  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392213  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 
620 aa  189  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  35.65 
 
 
649 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  35.65 
 
 
649 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  35.23 
 
 
1212 aa  187  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  32.16 
 
 
457 aa  187  5e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 
662 aa  186  8e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  34.75 
 
 
646 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  33.66 
 
 
626 aa  184  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  32.75 
 
 
714 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  32.3 
 
 
637 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3326  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 
607 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.04 
 
 
760 aa  179  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 
438 aa  179  9e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  32.6 
 
 
505 aa  178  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  31.22 
 
 
546 aa  178  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  29.72 
 
 
614 aa  177  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  29.72 
 
 
614 aa  177  5e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  29.72 
 
 
614 aa  177  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  29.72 
 
 
626 aa  177  6e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1856  hypothetical protein  34.6 
 
 
360 aa  177  6e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  32.75 
 
 
639 aa  177  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  29.87 
 
 
626 aa  176  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  29.87 
 
 
614 aa  176  9e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.74 
 
 
454 aa  176  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 
637 aa  176  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  32.82 
 
 
412 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  32.28 
 
 
502 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  32.85 
 
 
612 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  32.82 
 
 
714 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  32.28 
 
 
502 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  32.28 
 
 
502 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0486  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 
481 aa  174  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 
614 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>