More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0911 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  59.08 
 
 		 649 aa  664    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  83.33 
 
 		 714 aa  1207    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  57.92 
 
 		 646 aa  660    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 714 aa  1442    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  59.08 
 
 		 649 aa  664    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  46.88 
 
 		 556 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  38.37 
 
 		 681 aa  402  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  46.45 
 
 		 473 aa  368  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  44 
 
 		 472 aa  352  1e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  37.28 
 
 		 637 aa  343  5.999999999999999e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  33.54 
 
 		 3145 aa  338  9.999999999999999e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  35.48 
 
 		 603 aa  336  9e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  43.09 
 
 		 542 aa  330  7e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  38.92 
 
 		 688 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  38.04 
 
 		 1450 aa  315  2.9999999999999996e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 		 546 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  32.81 
 
 		 955 aa  312  1e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  38.4 
 
 		 608 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  36.13 
 
 		 740 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  36.18 
 
 		 601 aa  307  5.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  36.14 
 
 		 935 aa  306  7e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  38.11 
 
 		 653 aa  306  7e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  38.11 
 
 		 653 aa  306  7e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  34.3 
 
 		 1827 aa  302  1e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  41.9 
 
 		 909 aa  298  3e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  36.57 
 
 		 574 aa  293  8e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  41.5 
 
 		 502 aa  292  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  41.5 
 
 		 502 aa  292  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  36.24 
 
 		 662 aa  290  7e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  41.28 
 
 		 502 aa  290  9e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.09 
 
 		 689 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  36.21 
 
 		 602 aa  288  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 578 aa  288  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  36.53 
 
 		 577 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 767 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  35.52 
 
 		 703 aa  282  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  34.48 
 
 		 620 aa  277  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  32.41 
 
 		 1077 aa  277  5e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  36.35 
 
 		 615 aa  277  6e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 		 747 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 		 620 aa  270  7e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  34.29 
 
 		 648 aa  267  5.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  33.71 
 
 		 592 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  36.54 
 
 		 1677 aa  260  6e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  38 
 
 		 1005 aa  256  7e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  34.41 
 
 		 614 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  34.41 
 
 		 614 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  34.34 
 
 		 612 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  34.41 
 
 		 614 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  34.41 
 
 		 626 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  34.36 
 
 		 614 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  34.17 
 
 		 639 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  34.36 
 
 		 626 aa  255  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  33.44 
 
 		 637 aa  253  7e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  35.77 
 
 		 626 aa  253  7e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.47 
 
 		 760 aa  253  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  42.95 
 
 		 685 aa  251  3e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.08 
 
 		 1034 aa  251  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  33.92 
 
 		 636 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  31.6 
 
 		 583 aa  247  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  34.41 
 
 		 614 aa  246  9e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  33.49 
 
 		 611 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  33.65 
 
 		 635 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  33.65 
 
 		 635 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  34.98 
 
 		 747 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  38.51 
 
 		 816 aa  241  4e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 		 780 aa  239  9e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  36.72 
 
 		 1038 aa  239  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  35.38 
 
 		 878 aa  237  7e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  37.61 
 
 		 484 aa  237  7e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 		 523 aa  234  5e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2618  hypothetical protein  30.1 
 
 		 630 aa  233  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 		 520 aa  230  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  33.78 
 
 		 615 aa  230  9e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  33.91 
 
 		 1454 aa  226  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.93 
 
 		 454 aa  226  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  33.91 
 
 		 1451 aa  226  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  33.4 
 
 		 550 aa  225  3e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  42.81 
 
 		 362 aa  223  8e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  45.53 
 
 		 865 aa  222  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.46 
 
 		 604 aa  221  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  25.45 
 
 		 733 aa  221  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  34.14 
 
 		 457 aa  220  8.999999999999998e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.08 
 
 		 810 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3326  TPR repeat-containing protein  31.42 
 
 		 607 aa  213  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  36.9 
 
 		 1694 aa  211  6e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  32.77 
 
 		 595 aa  206  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  34.11 
 
 		 1764 aa  204  4e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  34.11 
 
 		 527 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  33.46 
 
 		 529 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  35.98 
 
 		 540 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  33.5 
 
 		 1276 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  34.06 
 
 		 505 aa  199  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.76 
 
 		 632 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  33.41 
 
 		 438 aa  197  5.000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  40.07 
 
 		 387 aa  196  9e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  35.8 
 
 		 872 aa  196  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 		 607 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  33.69 
 
 		 611 aa  195  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1856  hypothetical protein  38.82 
 
 		 360 aa  194  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>