More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1094 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
685 aa  1380    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  64.17 
 
 
529 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  64.04 
 
 
514 aa  551  1e-155  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00421  hypothetical protein  66.83 
 
 
484 aa  537  1e-151  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.391795  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  74.65 
 
 
681 aa  532  1e-150  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15821  hypothetical protein  59.95 
 
 
482 aa  511  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  50.09 
 
 
594 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  55.21 
 
 
502 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  56.28 
 
 
494 aa  484  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  64.23 
 
 
909 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  68.01 
 
 
362 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  65.63 
 
 
816 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  68.38 
 
 
865 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  70.25 
 
 
637 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  63.88 
 
 
612 aa  392  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  67.73 
 
 
603 aa  382  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  59.87 
 
 
750 aa  379  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  61.87 
 
 
739 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  62.96 
 
 
583 aa  316  9e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  50.48 
 
 
878 aa  290  9e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12261  TPR repeat-containing sulfotransferase  35.36 
 
 
614 aa  280  4e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
697 aa  270  7e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  50.53 
 
 
810 aa  267  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  64.9 
 
 
430 aa  256  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  42.95 
 
 
714 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  28.93 
 
 
725 aa  251  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  44.67 
 
 
725 aa  249  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  43.77 
 
 
714 aa  243  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  45.69 
 
 
632 aa  243  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 
1406 aa  239  9e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18191  hypothetical protein  62.11 
 
 
425 aa  236  8e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.888115 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  65.93 
 
 
437 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  42.77 
 
 
1676 aa  229  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0815  TPR repeat-containing protein  63.87 
 
 
235 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0605859  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  35.83 
 
 
795 aa  224  3e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  27.42 
 
 
1764 aa  224  3e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  38.37 
 
 
1094 aa  224  4e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00431  hypothetical protein  54.72 
 
 
435 aa  224  6e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  39.07 
 
 
764 aa  222  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  25.38 
 
 
762 aa  218  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  25.38 
 
 
762 aa  218  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  38.82 
 
 
622 aa  216  9e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  25.49 
 
 
695 aa  215  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  35.24 
 
 
4489 aa  212  1e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  39.49 
 
 
1276 aa  210  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  43.7 
 
 
323 aa  204  3e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  40.68 
 
 
3145 aa  204  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  37.47 
 
 
1694 aa  204  4e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  26.33 
 
 
700 aa  201  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  37.43 
 
 
837 aa  201  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  27.14 
 
 
648 aa  200  7e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  37.54 
 
 
732 aa  200  7.999999999999999e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  26.35 
 
 
673 aa  199  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  35.46 
 
 
3035 aa  198  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  42.41 
 
 
936 aa  198  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16741  hypothetical protein  53.81 
 
 
467 aa  197  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  39.85 
 
 
505 aa  195  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  33.86 
 
 
646 aa  194  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  32.13 
 
 
649 aa  193  7e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  32.13 
 
 
649 aa  193  7e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  42.69 
 
 
780 aa  193  7e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  34.79 
 
 
3172 aa  193  9e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  36.47 
 
 
1737 aa  191  5e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  37.82 
 
 
847 aa  189  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  38.49 
 
 
828 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  35.47 
 
 
594 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  44.62 
 
 
1007 aa  188  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 
718 aa  188  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  34.27 
 
 
828 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1366  TPR repeat-containing protein  56.68 
 
 
402 aa  187  7e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.104941  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  37.42 
 
 
397 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  36.21 
 
 
608 aa  185  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  37.75 
 
 
3560 aa  184  7e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  34.81 
 
 
875 aa  183  9.000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  39.36 
 
 
462 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3132  sulfotransferase  27.79 
 
 
720 aa  180  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.915715  hitchhiker  0.000116891 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3684  sulfotransferase  27.89 
 
 
542 aa  178  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  38.31 
 
 
573 aa  178  4e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  32.18 
 
 
620 aa  177  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  33.78 
 
 
3301 aa  177  6e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 
620 aa  177  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3035  sulfotransferase  24.96 
 
 
677 aa  177  8e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  35.97 
 
 
543 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  25.37 
 
 
656 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  39.25 
 
 
824 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  36.06 
 
 
395 aa  172  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  31.66 
 
 
615 aa  172  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02385  TPR domain protein  26.42 
 
 
652 aa  172  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7095  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.84 
 
 
354 aa  172  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.524118  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  39.29 
 
 
311 aa  171  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  24.22 
 
 
637 aa  171  5e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  31.46 
 
 
626 aa  171  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  32.42 
 
 
649 aa  170  9e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3169  tetratricopeptide TPR_2  25.53 
 
 
604 aa  169  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.120053  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  35.45 
 
 
733 aa  168  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  36 
 
 
833 aa  167  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2649  sulfotransferase  24.57 
 
 
669 aa  167  5e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  34.8 
 
 
486 aa  167  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2501  sulfotransferase  27.34 
 
 
717 aa  167  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  32.09 
 
 
612 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>