More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_18191 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_18191  hypothetical protein  100 
 
 
425 aa  862    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.888115 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  62.5 
 
 
865 aa  244  3e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  62.11 
 
 
685 aa  237  4e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  60.39 
 
 
583 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  59.07 
 
 
637 aa  226  8e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  58.33 
 
 
681 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  53.06 
 
 
362 aa  217  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  57.29 
 
 
612 aa  215  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  59.9 
 
 
430 aa  212  9e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  57.53 
 
 
816 aa  211  3e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00431  hypothetical protein  60.69 
 
 
435 aa  209  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  54.01 
 
 
750 aa  206  5e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  49.75 
 
 
909 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  49.75 
 
 
739 aa  198  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  50.27 
 
 
603 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1366  TPR repeat-containing protein  57.65 
 
 
402 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.104941  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16741  hypothetical protein  50.54 
 
 
467 aa  179  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  51.83 
 
 
514 aa  169  6e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0815  TPR repeat-containing protein  57.72 
 
 
235 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0605859  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  57.33 
 
 
437 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00421  hypothetical protein  55.19 
 
 
484 aa  162  9e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.391795  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0817  TPR repeat-containing protein  50.34 
 
 
661 aa  140  6e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.975986  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  54.36 
 
 
529 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00441  hypothetical protein  50.78 
 
 
653 aa  129  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15821  hypothetical protein  47.06 
 
 
482 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.13 
 
 
810 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  39.13 
 
 
878 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  37.79 
 
 
323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  41.26 
 
 
502 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  39.86 
 
 
494 aa  109  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.13 
 
 
632 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  36.09 
 
 
594 aa  106  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  37.23 
 
 
780 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  36.05 
 
 
594 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  37.31 
 
 
1094 aa  97.1  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  35.46 
 
 
622 aa  97.1  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  33.71 
 
 
837 aa  95.9  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  32.93 
 
 
3145 aa  96.3  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  34.81 
 
 
764 aa  92.8  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  33.58 
 
 
795 aa  92  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  29.19 
 
 
725 aa  90.9  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  38.16 
 
 
1276 aa  90.1  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16401  hypothetical protein  31.95 
 
 
779 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  42.73 
 
 
1676 aa  89  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  36.05 
 
 
750 aa  88.2  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  33.75 
 
 
217 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  27.47 
 
 
875 aa  87.8  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 
828 aa  87  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  33.13 
 
 
1005 aa  87.4  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
833 aa  87  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  32.85 
 
 
754 aa  86.3  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.67 
 
 
1034 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  35.34 
 
 
4489 aa  85.9  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  35.51 
 
 
828 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  40 
 
 
864 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 
754 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 
543 aa  84.3  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  32.28 
 
 
550 aa  83.6  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  29.87 
 
 
646 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  32.57 
 
 
732 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  38.52 
 
 
824 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  36.43 
 
 
762 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  36.04 
 
 
542 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  36.92 
 
 
3035 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 
573 aa  82  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  29.3 
 
 
608 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  33.33 
 
 
535 aa  80.9  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 
833 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  32.58 
 
 
545 aa  80.5  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  38.24 
 
 
936 aa  80.1  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  39.25 
 
 
714 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
636 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 
715 aa  80.1  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  31.11 
 
 
714 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  29.93 
 
 
725 aa  79  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 
649 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  27.57 
 
 
732 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  33.56 
 
 
612 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 
718 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 
649 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  34.53 
 
 
566 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  32.68 
 
 
639 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  33.82 
 
 
620 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  37.17 
 
 
661 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2853  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.21 
 
 
441 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0260503 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  31.87 
 
 
1737 aa  78.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3268  TPR repeat-containing protein  31.21 
 
 
441 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  31.17 
 
 
1694 aa  78.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  30.15 
 
 
395 aa  78.2  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 
615 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  33.11 
 
 
733 aa  78.2  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 
1085 aa  78.2  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  29.19 
 
 
585 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 
789 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  32.75 
 
 
686 aa  77.4  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  34.51 
 
 
3301 aa  77.4  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0788  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
779 aa  76.6  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.156743  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  32.19 
 
 
626 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  32.19 
 
 
614 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  32.19 
 
 
614 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>