More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_24191 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  100 
 
 
545 aa  1127    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  64.86 
 
 
587 aa  756    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  61.73 
 
 
725 aa  665    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  45.68 
 
 
622 aa  534  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  34.43 
 
 
764 aa  156  8e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  35.27 
 
 
661 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  38.5 
 
 
878 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  36.32 
 
 
875 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.03 
 
 
810 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  38.16 
 
 
685 aa  137  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  30.5 
 
 
909 aa  133  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  32.02 
 
 
750 aa  133  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  33.69 
 
 
739 aa  127  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  36.06 
 
 
681 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  32.27 
 
 
362 aa  124  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  34.3 
 
 
865 aa  124  5e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  32.35 
 
 
816 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.31 
 
 
632 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  36.81 
 
 
603 aa  120  7e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  33.63 
 
 
1676 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  32.73 
 
 
4489 aa  118  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  33.95 
 
 
505 aa  116  8.999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  32.41 
 
 
795 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  36.45 
 
 
637 aa  115  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 
620 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 
612 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 
615 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  29.69 
 
 
626 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 
614 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
639 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  28.98 
 
 
754 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  29.88 
 
 
620 aa  109  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  29.3 
 
 
614 aa  108  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  29.3 
 
 
614 aa  108  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  29.3 
 
 
614 aa  108  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  30.09 
 
 
1094 aa  108  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  29.3 
 
 
626 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  32.39 
 
 
626 aa  107  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 
583 aa  107  7e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 
824 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  28.51 
 
 
594 aa  106  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  30.45 
 
 
3145 aa  106  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  29.71 
 
 
887 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  29.75 
 
 
837 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 
828 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
1406 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  31.28 
 
 
833 aa  105  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  33.5 
 
 
936 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  28.84 
 
 
602 aa  104  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 
968 aa  104  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  30.39 
 
 
733 aa  104  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 
700 aa  104  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 
543 aa  103  8e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  29.88 
 
 
754 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 
637 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.66 
 
 
1022 aa  101  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 
611 aa  101  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 
1737 aa  101  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 
1827 aa  100  5e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 
635 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
828 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  30.45 
 
 
833 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 
635 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  29.47 
 
 
732 aa  100  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  26.85 
 
 
780 aa  100  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 
374 aa  100  7e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  30.52 
 
 
636 aa  100  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 
612 aa  100  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  31.96 
 
 
340 aa  100  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  32.78 
 
 
437 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  39.07 
 
 
217 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  34 
 
 
430 aa  98.6  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 
927 aa  97.8  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 
3560 aa  97.8  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  30.13 
 
 
708 aa  97.8  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 
714 aa  97.4  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 
761 aa  97.4  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 
808 aa  97.1  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
828 aa  97.1  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 
750 aa  96.7  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 
573 aa  96.7  9e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  26.18 
 
 
594 aa  96.3  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 
523 aa  96.3  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  27.44 
 
 
601 aa  96.3  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 
718 aa  95.9  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  35.95 
 
 
762 aa  96.3  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 
542 aa  95.9  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 
1005 aa  95.5  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  30.73 
 
 
714 aa  95.9  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  28.64 
 
 
3301 aa  95.5  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  30.45 
 
 
3035 aa  95.1  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 
402 aa  95.1  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  33.33 
 
 
864 aa  94.7  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  34.22 
 
 
556 aa  94.4  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  24.55 
 
 
789 aa  94  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 
614 aa  94  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.06 
 
 
1056 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 
732 aa  92.8  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.02 
 
 
1034 aa  93.2  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
3172 aa  92.8  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>