More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4728 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
718 aa  1474    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  37.4 
 
 
708 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  33.55 
 
 
754 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 
754 aa  366  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  31.04 
 
 
828 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  30.8 
 
 
828 aa  345  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  32.6 
 
 
732 aa  345  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.22 
 
 
1106 aa  335  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  34.57 
 
 
828 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  35.35 
 
 
1106 aa  323  6e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  35.88 
 
 
585 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 
3035 aa  314  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  32.11 
 
 
824 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.1 
 
 
589 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 
717 aa  312  1e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  30.86 
 
 
717 aa  312  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 
789 aa  311  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  30.52 
 
 
713 aa  310  5e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  30.64 
 
 
3560 aa  307  4.0000000000000004e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.69 
 
 
589 aa  306  6e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  35.65 
 
 
598 aa  301  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  35.45 
 
 
619 aa  301  4e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 
833 aa  299  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 
1094 aa  293  8e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 
909 aa  291  3e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 
968 aa  291  4e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  30.07 
 
 
833 aa  291  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 
4489 aa  290  9e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  33.22 
 
 
626 aa  288  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  32.52 
 
 
627 aa  286  5.999999999999999e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  29.97 
 
 
789 aa  283  1e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  26.17 
 
 
816 aa  279  2e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  28.96 
 
 
708 aa  278  2e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.14 
 
 
723 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  29.04 
 
 
699 aa  272  2e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  31.27 
 
 
595 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  29.3 
 
 
700 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  28.96 
 
 
715 aa  270  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  25.94 
 
 
750 aa  267  4e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 
1714 aa  267  4e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  26.66 
 
 
739 aa  261  4e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.22 
 
 
739 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 
1085 aa  259  2e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  28.28 
 
 
937 aa  254  3e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.37 
 
 
742 aa  251  5e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 
693 aa  245  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  28.61 
 
 
796 aa  243  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  26.69 
 
 
761 aa  243  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.28 
 
 
790 aa  242  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.33 
 
 
739 aa  239  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.75 
 
 
739 aa  238  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.14 
 
 
529 aa  236  8e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 
633 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  27.15 
 
 
790 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.71 
 
 
667 aa  231  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  25.38 
 
 
732 aa  231  4e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  31.41 
 
 
667 aa  230  6e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  30.12 
 
 
776 aa  230  9e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  30.12 
 
 
821 aa  229  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  30.12 
 
 
821 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  29.97 
 
 
654 aa  228  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  30.12 
 
 
776 aa  228  3e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  30.12 
 
 
776 aa  228  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  30.12 
 
 
776 aa  228  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 
776 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  28.73 
 
 
647 aa  227  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  29 
 
 
1221 aa  227  8e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 
633 aa  226  1e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 
822 aa  225  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 
727 aa  224  4.9999999999999996e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.94 
 
 
740 aa  223  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  29.48 
 
 
797 aa  223  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 
750 aa  223  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  39.94 
 
 
875 aa  221  3e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 
734 aa  220  6e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 
808 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  26.89 
 
 
1415 aa  213  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  29.41 
 
 
596 aa  211  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  28.83 
 
 
1144 aa  211  5e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  27.9 
 
 
974 aa  207  6e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  26.82 
 
 
779 aa  207  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  39.31 
 
 
878 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 
780 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  25.68 
 
 
1116 aa  205  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  26.54 
 
 
780 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.26 
 
 
810 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  31.34 
 
 
552 aa  201  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  24.71 
 
 
706 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  25.97 
 
 
1143 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  25.11 
 
 
750 aa  199  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 
740 aa  198  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 
618 aa  198  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 
660 aa  197  6e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  37.69 
 
 
681 aa  193  7e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  27.17 
 
 
837 aa  194  7e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 
647 aa  193  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0114  TPR repeat-containing protein  24.14 
 
 
724 aa  192  2e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.029745  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 
3145 aa  189  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 
685 aa  188  3e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 
574 aa  188  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>