More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3037 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  98.46 
 
 		 717 aa  1429    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  68.46 
 
 		 723 aa  910    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 717 aa  1452    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.52 
 
 		 1106 aa  359  9.999999999999999e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  37.72 
 
 		 1106 aa  345  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  39.65 
 
 		 796 aa  337  5e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  38.77 
 
 		 585 aa  333  4e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  31.99 
 
 		 821 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  31.99 
 
 		 776 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  31.99 
 
 		 776 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  31.99 
 
 		 776 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  31.72 
 
 		 776 aa  330  8e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  31.72 
 
 		 821 aa  329  8e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  31.59 
 
 		 776 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  34.61 
 
 		 627 aa  325  1e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  37.91 
 
 		 708 aa  324  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  35.85 
 
 		 626 aa  323  5e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  33.6 
 
 		 754 aa  323  9.000000000000001e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  37.81 
 
 		 633 aa  320  7e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 		 754 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  31.09 
 
 		 718 aa  316  8e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.8 
 
 		 667 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.27 
 
 		 589 aa  312  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  32.26 
 
 		 790 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.22 
 
 		 589 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  33 
 
 		 828 aa  305  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.03 
 
 		 790 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 		 828 aa  303  9e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  35.07 
 
 		 619 aa  303  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  33.19 
 
 		 828 aa  302  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  31.04 
 
 		 699 aa  301  3e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  34.72 
 
 		 598 aa  300  8e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 		 824 aa  300  9e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  29.97 
 
 		 779 aa  297  6e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.87 
 
 		 529 aa  296  7e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 		 732 aa  296  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  34.66 
 
 		 595 aa  293  8e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  31.59 
 
 		 708 aa  290  4e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 		 833 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.06 
 
 		 739 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  35.32 
 
 		 833 aa  287  5e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  33.67 
 
 		 781 aa  287  5.999999999999999e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 		 968 aa  284  3.0000000000000004e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 713 aa  281  3e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  32.22 
 
 		 789 aa  280  5e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  31.83 
 
 		 715 aa  280  7e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 		 647 aa  278  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  28.67 
 
 		 780 aa  277  5e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  35.24 
 
 		 789 aa  277  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 		 780 aa  277  5e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 		 1714 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.19 
 
 		 742 aa  269  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  29.65 
 
 		 1143 aa  270  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  37.34 
 
 		 552 aa  268  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  33.55 
 
 		 937 aa  267  5.999999999999999e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  32.73 
 
 		 797 aa  266  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.42 
 
 		 739 aa  264  4.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.77 
 
 		 739 aa  263  8.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0605  tetratricopeptide domain-containing protein  31.63 
 
 		 553 aa  262  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.335277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  33.52 
 
 		 727 aa  260  7e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 		 1085 aa  259  1e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  30.16 
 
 		 1415 aa  259  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  29.54 
 
 		 693 aa  258  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  31.89 
 
 		 822 aa  256  1.0000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  30.84 
 
 		 1221 aa  253  6e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 		 734 aa  253  8.000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.8 
 
 		 740 aa  250  7e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  32.11 
 
 		 1116 aa  244  3.9999999999999997e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  31.86 
 
 		 1144 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 		 3035 aa  228  3e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 3560 aa  228  4e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  26.1 
 
 		 4489 aa  226  1e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  25.45 
 
 		 816 aa  219  1e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  28.99 
 
 		 596 aa  219  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  25.34 
 
 		 633 aa  214  2.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 667 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 		 700 aa  212  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  32.44 
 
 		 921 aa  211  4e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 974 aa  211  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  26.34 
 
 		 1094 aa  207  4e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 		 909 aa  207  5e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  22.84 
 
 		 750 aa  206  8e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  24.89 
 
 		 761 aa  202  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 		 611 aa  203  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 654 aa  200  9e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 		 740 aa  197  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 		 739 aa  193  8e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0103  TPR repeat-containing protein  34.83 
 
 		 733 aa  193  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467133  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  20.12 
 
 		 632 aa  190  8e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  26.44 
 
 		 808 aa  189  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 		 618 aa  188  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 		 750 aa  186  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  32.64 
 
 		 492 aa  183  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  27.51 
 
 		 706 aa  183  1e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 		 616 aa  179  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0114  TPR repeat-containing protein  24.33 
 
 		 724 aa  177  6e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.029745  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  32.92 
 
 		 637 aa  176  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7846  hypothetical protein  32.6 
 
 		 452 aa  171  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346388 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  33.15 
 
 		 672 aa  170  9e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  30.85 
 
 		 459 aa  167  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>