More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5618 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  68.16 
 
 		 739 aa  1032    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  77.13 
 
 		 739 aa  1126    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  100 
 
 		 739 aa  1496    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  60.08 
 
 		 742 aa  848    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  54.2 
 
 		 740 aa  771    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  41.26 
 
 		 713 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  39.19 
 
 		 715 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 		 732 aa  321  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  31.7 
 
 		 828 aa  317  5e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  31.7 
 
 		 828 aa  317  5e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  30.75 
 
 		 824 aa  312  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  31.55 
 
 		 699 aa  308  3e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 		 754 aa  308  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  30.78 
 
 		 828 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.3 
 
 		 1106 aa  303  8.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 		 754 aa  300  5e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  32.01 
 
 		 708 aa  291  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 734 aa  289  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  33.38 
 
 		 1106 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  31.8 
 
 		 937 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  30.76 
 
 		 789 aa  280  7e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  31.07 
 
 		 833 aa  277  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  31.22 
 
 		 833 aa  277  7e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  31.92 
 
 		 717 aa  275  3e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  30.04 
 
 		 717 aa  274  5.000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 693 aa  271  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  30.56 
 
 		 821 aa  270  5e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  30.56 
 
 		 776 aa  270  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  30.56 
 
 		 776 aa  270  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  30.56 
 
 		 776 aa  270  5e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  30.56 
 
 		 821 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  36.13 
 
 		 776 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 776 aa  268  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  32.39 
 
 		 822 aa  267  5e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 		 718 aa  266  8e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  28.8 
 
 		 708 aa  266  1e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 		 3035 aa  263  6.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  33.05 
 
 		 598 aa  263  8.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 		 789 aa  262  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 619 aa  263  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 968 aa  259  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  34.06 
 
 		 790 aa  258  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 		 4489 aa  257  4e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  33.02 
 
 		 633 aa  256  8e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.88 
 
 		 790 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 		 627 aa  254  4.0000000000000004e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  30.09 
 
 		 1714 aa  254  5.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  25.75 
 
 		 816 aa  253  7e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 3560 aa  251  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 		 909 aa  250  7e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 626 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  29.31 
 
 		 1221 aa  244  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 		 1094 aa  243  1e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  29.18 
 
 		 1085 aa  241  4e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  25.43 
 
 		 761 aa  240  5.999999999999999e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.67 
 
 		 589 aa  240  9e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.36 
 
 		 529 aa  238  4e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  33.21 
 
 		 585 aa  237  7e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  31.01 
 
 		 797 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.3 
 
 		 723 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  33.12 
 
 		 781 aa  235  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 595 aa  234  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 780 aa  234  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  29.75 
 
 		 780 aa  234  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.98 
 
 		 667 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  27.95 
 
 		 647 aa  233  7.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  23.28 
 
 		 750 aa  224  3e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  26.41 
 
 		 808 aa  225  3e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.66 
 
 		 589 aa  224  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  28.65 
 
 		 596 aa  225  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 		 732 aa  223  8e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 974 aa  223  9e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  31.83 
 
 		 779 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  28.94 
 
 		 796 aa  222  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  27.01 
 
 		 1415 aa  219  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 740 aa  218  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  31.53 
 
 		 1143 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  32.82 
 
 		 921 aa  212  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0605  tetratricopeptide domain-containing protein  29.53 
 
 		 553 aa  211  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.335277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  34.14 
 
 		 633 aa  207  6e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  29.93 
 
 		 552 aa  204  4e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  23.82 
 
 		 739 aa  203  8e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  32.51 
 
 		 727 aa  202  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  31.13 
 
 		 1116 aa  201  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 		 667 aa  196  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  28.74 
 
 		 1144 aa  189  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  25.22 
 
 		 706 aa  189  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0114  TPR repeat-containing protein  24.52 
 
 		 724 aa  186  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.029745  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1874  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29 
 
 		 793 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0103  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 733 aa  177  7e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467133  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 		 700 aa  177  9e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  26.5 
 
 		 616 aa  174  7.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  36.13 
 
 		 1694 aa  172  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  34.34 
 
 		 1276 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  31.01 
 
 		 633 aa  162  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 654 aa  161  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.67 
 
 		 632 aa  161  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.69 
 
 		 810 aa  160  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  29.6 
 
 		 630 aa  159  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  30.59 
 
 		 637 aa  158  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>