More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0161 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 598 aa  1209    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  80.55 
 
 		 595 aa  948    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  62.87 
 
 		 626 aa  758    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  97.66 
 
 		 619 aa  1169    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  46.83 
 
 		 708 aa  537  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  50.52 
 
 		 828 aa  530  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  51.91 
 
 		 833 aa  508  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  49.65 
 
 		 828 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  49.65 
 
 		 828 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  51.16 
 
 		 833 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  47.84 
 
 		 789 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  47.35 
 
 		 732 aa  488  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  43.22 
 
 		 824 aa  474  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  44.15 
 
 		 754 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  44.85 
 
 		 754 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  40.96 
 
 		 789 aa  411  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  41.1 
 
 		 585 aa  330  6e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  35.53 
 
 		 717 aa  311  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  35.65 
 
 		 718 aa  310  5.9999999999999995e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  34.42 
 
 		 627 aa  307  4.0000000000000004e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  34.72 
 
 		 717 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  35.58 
 
 		 596 aa  302  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  33.33 
 
 		 1221 aa  302  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 		 1714 aa  300  6e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.51 
 
 		 589 aa  300  7e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  34.04 
 
 		 1415 aa  296  5e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.91 
 
 		 1106 aa  290  7e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.89 
 
 		 723 aa  289  8e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.87 
 
 		 589 aa  289  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  35.31 
 
 		 1106 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  33.1 
 
 		 797 aa  283  6.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  34.92 
 
 		 780 aa  280  8e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  34.92 
 
 		 780 aa  280  8e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  34.75 
 
 		 779 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  34.3 
 
 		 776 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  34.13 
 
 		 821 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  34.47 
 
 		 821 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  34.47 
 
 		 776 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  34.47 
 
 		 776 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  34.47 
 
 		 776 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  32.36 
 
 		 790 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  33.96 
 
 		 776 aa  269  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.36 
 
 		 790 aa  269  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  31.02 
 
 		 708 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  30.24 
 
 		 968 aa  267  4e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 796 aa  266  8e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  35.67 
 
 		 781 aa  265  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  33.21 
 
 		 822 aa  261  3e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  31.35 
 
 		 633 aa  259  8e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.92 
 
 		 740 aa  259  9e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.93 
 
 		 529 aa  259  1e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  31.68 
 
 		 699 aa  257  3e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.53 
 
 		 667 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  31.55 
 
 		 3035 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.57 
 
 		 739 aa  253  6e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  33.05 
 
 		 739 aa  252  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 		 633 aa  250  4e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  26.99 
 
 		 909 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 		 3560 aa  246  6.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  28.55 
 
 		 1085 aa  246  9e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.33 
 
 		 739 aa  245  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 		 734 aa  244  3e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28.9 
 
 		 4489 aa  244  3e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  30.63 
 
 		 715 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  31.83 
 
 		 713 aa  240  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 1143 aa  239  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0103  TPR repeat-containing protein  31.61 
 
 		 733 aa  238  3e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467133  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 693 aa  237  6e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 		 750 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  35.64 
 
 		 937 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 		 700 aa  234  3e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.46 
 
 		 742 aa  233  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  31.27 
 
 		 727 aa  232  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  31.03 
 
 		 1144 aa  231  3e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 		 1094 aa  231  4e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  26.43 
 
 		 816 aa  230  6e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 		 667 aa  226  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  29.5 
 
 		 647 aa  223  7e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 		 761 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  31.4 
 
 		 921 aa  218  2.9999999999999998e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  31.89 
 
 		 654 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 		 739 aa  214  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  34.36 
 
 		 1116 aa  213  9e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  31.29 
 
 		 808 aa  211  3e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 611 aa  200  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  32.11 
 
 		 574 aa  200  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 		 618 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  29.84 
 
 		 552 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  21.92 
 
 		 632 aa  198  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0605  tetratricopeptide domain-containing protein  27.82 
 
 		 553 aa  196  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.335277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 647 aa  192  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  28.11 
 
 		 974 aa  189  9e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  28.52 
 
 		 680 aa  188  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 		 750 aa  187  6e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0113  O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.73 
 
 		 726 aa  186  8e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0423432  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  32.63 
 
 		 630 aa  181  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  24.81 
 
 		 732 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  32.22 
 
 		 657 aa  181  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  33.51 
 
 		 566 aa  181  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1874  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.52 
 
 		 793 aa  179  9e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>