More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3361 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 750 aa  1517    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  38.17 
 
 		 700 aa  393  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  32.55 
 
 		 4489 aa  357  5.999999999999999e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  34.26 
 
 		 1094 aa  354  4e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  30.13 
 
 		 3560 aa  345  1e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  36.38 
 
 		 1085 aa  342  2e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 		 3035 aa  332  1e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  43.44 
 
 		 492 aa  331  3e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  36.13 
 
 		 654 aa  328  3e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 		 732 aa  325  2e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 909 aa  324  4e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  27.66 
 
 		 816 aa  310  5e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  32.8 
 
 		 740 aa  310  5e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 750 aa  309  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  36.29 
 
 		 618 aa  308  2.0000000000000002e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  40.82 
 
 		 459 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 		 739 aa  294  4e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7846  hypothetical protein  40.63 
 
 		 452 aa  293  9e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346388 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  38.27 
 
 		 569 aa  291  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  28.01 
 
 		 761 aa  284  3.0000000000000004e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  28.96 
 
 		 808 aa  283  1e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  34.63 
 
 		 574 aa  281  4e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  33.24 
 
 		 667 aa  281  4e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 		 706 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  41.89 
 
 		 672 aa  272  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  30.37 
 
 		 611 aa  265  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  41.9 
 
 		 637 aa  265  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 		 616 aa  264  4.999999999999999e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  40.91 
 
 		 566 aa  264  4.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  42.22 
 
 		 632 aa  261  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 		 647 aa  249  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  37.91 
 
 		 633 aa  246  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 		 660 aa  246  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  23.06 
 
 		 632 aa  243  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2410  hypothetical protein  35.68 
 
 		 624 aa  243  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  38.05 
 
 		 680 aa  241  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 828 aa  241  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  29.97 
 
 		 718 aa  239  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.91 
 
 		 589 aa  239  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 		 754 aa  238  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  29.97 
 
 		 754 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 828 aa  235  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2579  hypothetical protein  36.9 
 
 		 588 aa  231  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385383  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  29.15 
 
 		 828 aa  231  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.55 
 
 		 570 aa  231  4e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 		 789 aa  230  7e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  33.05 
 
 		 560 aa  229  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  36.46 
 
 		 657 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  32.27 
 
 		 568 aa  229  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  30.03 
 
 		 732 aa  228  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.09 
 
 		 589 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.63 
 
 		 1106 aa  226  9e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0359  hypothetical protein  36.56 
 
 		 657 aa  224  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224796  normal  0.0716049 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  28.69 
 
 		 968 aa  221  5e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2411  hypothetical protein  38.54 
 
 		 582 aa  221  5e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100681  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 824 aa  221  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  30.79 
 
 		 708 aa  220  7e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3853  O-linked acetylglucosamine transferase  39.83 
 
 		 590 aa  220  7e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1319  TPR repeat-containing protein  40.85 
 
 		 295 aa  219  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000490816  hitchhiker  8.5993e-22 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  30.55 
 
 		 1714 aa  219  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4069  TPR repeat-containing protein  39.54 
 
 		 590 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00017793  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 789 aa  215  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  36.63 
 
 		 630 aa  214  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20301  hypothetical protein  34.25 
 
 		 395 aa  214  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.236649 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 		 833 aa  213  9e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  37.16 
 
 		 1106 aa  213  9e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 		 717 aa  205  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  30.52 
 
 		 717 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 		 833 aa  202  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  24.52 
 
 		 708 aa  201  5e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  31.12 
 
 		 627 aa  201  5e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  32.03 
 
 		 1221 aa  200  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 619 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.24 
 
 		 739 aa  196  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0934  TPR repeat-containing protein  33.78 
 
 		 739 aa  196  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.897718 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  31.28 
 
 		 699 aa  194  5e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  28.48 
 
 		 585 aa  192  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  28.31 
 
 		 598 aa  190  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.4 
 
 		 667 aa  187  7e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  30.45 
 
 		 633 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  25.55 
 
 		 821 aa  185  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  25.55 
 
 		 776 aa  185  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.78 
 
 		 742 aa  185  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  25.55 
 
 		 776 aa  185  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  25.55 
 
 		 776 aa  185  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  26.6 
 
 		 713 aa  184  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  30.02 
 
 		 595 aa  183  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.94 
 
 		 529 aa  182  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 		 776 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  25.21 
 
 		 821 aa  181  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.79 
 
 		 739 aa  181  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 		 776 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  29.4 
 
 		 626 aa  179  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 		 734 aa  176  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0256  hypothetical protein  26.75 
 
 		 719 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 		 633 aa  176  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  34.11 
 
 		 937 aa  174  5.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  26.15 
 
 		 596 aa  173  7.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2387  tetratricopeptide TPR_2  28.53 
 
 		 745 aa  172  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.625245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  29.35 
 
 		 552 aa  171  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>