161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_20301 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_20301  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  811    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.236649 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  53.18 
 
 		 909 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  51.4 
 
 		 750 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  50.13 
 
 		 816 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  48.9 
 
 		 3560 aa  366  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  49.58 
 
 		 4489 aa  363  4e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  44.78 
 
 		 654 aa  360  3e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  50.56 
 
 		 3035 aa  350  2e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  49.72 
 
 		 1094 aa  349  4e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  45.21 
 
 		 1085 aa  333  3e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  47.25 
 
 		 618 aa  332  6e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  47.29 
 
 		 616 aa  330  2e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  45.01 
 
 		 740 aa  327  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  45.9 
 
 		 732 aa  327  3e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  45.04 
 
 		 739 aa  324  2e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  45.79 
 
 		 761 aa  315  9e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  41.88 
 
 		 611 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  42.03 
 
 		 700 aa  311  9e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  42.56 
 
 		 660 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  40.41 
 
 		 647 aa  300  4e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  37.66 
 
 		 560 aa  291  2e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  39.9 
 
 		 569 aa  289  5.0000000000000004e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  39.8 
 
 		 574 aa  288  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  38.83 
 
 		 667 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  41.18 
 
 		 492 aa  285  8e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7846  hypothetical protein  41.26 
 
 		 452 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346388 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  38.68 
 
 		 632 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  40.56 
 
 		 459 aa  272  7e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1319  TPR repeat-containing protein  47.16 
 
 		 295 aa  268  1e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000490816  hitchhiker  8.5993e-22 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  36.96 
 
 		 680 aa  265  8e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  36.91 
 
 		 657 aa  262  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0359  hypothetical protein  36.09 
 
 		 657 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224796  normal  0.0716049 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  37.82 
 
 		 706 aa  249  8e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  39.55 
 
 		 632 aa  245  9e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3853  O-linked acetylglucosamine transferase  36.41 
 
 		 590 aa  239  5e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4069  TPR repeat-containing protein  36.13 
 
 		 590 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00017793  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  37.46 
 
 		 808 aa  238  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  35.16 
 
 		 566 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  33.52 
 
 		 672 aa  233  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  34.89 
 
 		 633 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  35.41 
 
 		 637 aa  226  8e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  34.25 
 
 		 750 aa  217  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  34.56 
 
 		 568 aa  216  5e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.06 
 
 		 570 aa  211  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2579  hypothetical protein  34.58 
 
 		 588 aa  208  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385383  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  32.48 
 
 		 630 aa  204  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.22 
 
 		 1106 aa  202  6e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  33.61 
 
 		 1106 aa  190  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2410  hypothetical protein  31.52 
 
 		 624 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00265  UDP-N-acetylglucosaminyltransferase (AFU_orthologue; AFUA_1G03380)  31.59 
 
 		 1596 aa  182  7e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0115382 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.42 
 
 		 589 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2411  hypothetical protein  30.52 
 
 		 582 aa  177  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100681  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.51 
 
 		 589 aa  176  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  31.69 
 
 		 1714 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  29.9 
 
 		 585 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0256  hypothetical protein  28.43 
 
 		 719 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  32.1 
 
 		 647 aa  169  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.54 
 
 		 529 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 633 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.38 
 
 		 667 aa  164  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  31.44 
 
 		 1143 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2387  tetratricopeptide TPR_2  29.09 
 
 		 745 aa  161  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.625245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0346  TPR repeat-containing protein  29.48 
 
 		 739 aa  159  8e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110262  normal  0.110805 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 		 754 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 968 aa  158  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  30.63 
 
 		 937 aa  157  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0934  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 		 739 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.897718 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 		 789 aa  154  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  31.1 
 
 		 627 aa  154  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 		 727 aa  154  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2394  hypothetical protein  27.27 
 
 		 740 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000509541  hitchhiker  0.0000624153 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  30.87 
 
 		 633 aa  151  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  30.17 
 
 		 754 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  31.45 
 
 		 789 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0933  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 738 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.450791  normal  0.93664 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4067  hypothetical protein  28.34 
 
 		 747 aa  149  8e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  29.09 
 
 		 708 aa  147  3e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  28.89 
 
 		 821 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  28.89 
 
 		 776 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  28.89 
 
 		 776 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  28.89 
 
 		 776 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  28.46 
 
 		 596 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  28.61 
 
 		 776 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  28.61 
 
 		 821 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  28.61 
 
 		 776 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 717 aa  145  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  26.94 
 
 		 699 aa  144  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 708 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 		 796 aa  144  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 833 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 		 717 aa  144  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  27.69 
 
 		 552 aa  144  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  29.04 
 
 		 780 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  29.04 
 
 		 780 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4222  glycosyltransferase TPR domain-containing protein  30.03 
 
 		 594 aa  143  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  28.94 
 
 		 1221 aa  143  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  28.73 
 
 		 734 aa  140  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 		 833 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 		 713 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  26.02 
 
 		 718 aa  138  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>