More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2993 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  51.27 
 
 		 828 aa  778    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  49.62 
 
 		 732 aa  697    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  51.95 
 
 		 828 aa  778    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  54.22 
 
 		 824 aa  804    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 789 aa  1596    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  49.16 
 
 		 833 aa  721    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  49.7 
 
 		 833 aa  732    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  51.39 
 
 		 828 aa  780    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  45.02 
 
 		 754 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  45.28 
 
 		 754 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  46.58 
 
 		 626 aa  525  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  45.18 
 
 		 708 aa  512  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  49.72 
 
 		 619 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  48.01 
 
 		 598 aa  498  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  47.59 
 
 		 595 aa  486  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  38.42 
 
 		 789 aa  411  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  29.87 
 
 		 909 aa  359  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.65 
 
 		 1106 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.89 
 
 		 589 aa  340  7e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.64 
 
 		 589 aa  334  3e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  32.91 
 
 		 781 aa  334  4e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  38.99 
 
 		 585 aa  333  7.000000000000001e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  37.58 
 
 		 1106 aa  330  8e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 		 4489 aa  320  7e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 		 1094 aa  319  1e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.48 
 
 		 3035 aa  317  5e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  31.56 
 
 		 718 aa  317  7e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  29.01 
 
 		 816 aa  316  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  32.05 
 
 		 968 aa  311  2.9999999999999997e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.89 
 
 		 739 aa  311  4e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  33.24 
 
 		 776 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  33.24 
 
 		 776 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  31.7 
 
 		 790 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  33.24 
 
 		 776 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  33.24 
 
 		 821 aa  309  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  29.72 
 
 		 715 aa  308  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 		 776 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  32.31 
 
 		 821 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 		 776 aa  305  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  36.67 
 
 		 633 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  33.52 
 
 		 1714 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.72 
 
 		 790 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  32.98 
 
 		 1221 aa  303  8.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  31.31 
 
 		 708 aa  302  2e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  31.39 
 
 		 780 aa  301  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  31.39 
 
 		 780 aa  301  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 		 779 aa  301  4e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  31.7 
 
 		 734 aa  300  5e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  29.16 
 
 		 808 aa  299  1e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  29.85 
 
 		 713 aa  297  4e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  35.44 
 
 		 596 aa  296  8e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  30.42 
 
 		 797 aa  292  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  32.51 
 
 		 1415 aa  289  1e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  35.42 
 
 		 717 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.38 
 
 		 739 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  35.24 
 
 		 717 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.28 
 
 		 740 aa  285  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  30.47 
 
 		 699 aa  284  6.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  33.61 
 
 		 627 aa  283  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 		 3560 aa  282  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 		 750 aa  281  4e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 693 aa  276  8e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.55 
 
 		 739 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  30.81 
 
 		 937 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.11 
 
 		 742 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 		 700 aa  273  7e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.05 
 
 		 723 aa  272  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.65 
 
 		 667 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  30.13 
 
 		 796 aa  270  8e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  28.66 
 
 		 1085 aa  266  7e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.06 
 
 		 529 aa  262  2e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  30.09 
 
 		 974 aa  257  7e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  31.73 
 
 		 1143 aa  251  5e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  32.58 
 
 		 1116 aa  248  3e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  31.53 
 
 		 921 aa  248  3e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  33.79 
 
 		 667 aa  247  6.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0103  TPR repeat-containing protein  32.45 
 
 		 733 aa  245  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467133  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 		 739 aa  244  5e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 		 727 aa  241  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  25.47 
 
 		 761 aa  241  5e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  38.38 
 
 		 878 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.86 
 
 		 810 aa  239  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 		 822 aa  239  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 		 706 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  36.1 
 
 		 633 aa  228  3e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 		 647 aa  226  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 		 732 aa  224  4e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1874  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.67 
 
 		 793 aa  224  4.9999999999999996e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  25.78 
 
 		 1154 aa  223  9e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  32.07 
 
 		 1144 aa  221  3.9999999999999997e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  31.16 
 
 		 750 aa  216  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  31.14 
 
 		 654 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  35.47 
 
 		 552 aa  212  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  30.74 
 
 		 647 aa  210  7e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  31.26 
 
 		 574 aa  208  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  20.92 
 
 		 632 aa  208  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  36.04 
 
 		 630 aa  206  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  27.82 
 
 		 740 aa  204  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0605  tetratricopeptide domain-containing protein  28.15 
 
 		 553 aa  204  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.335277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  27.29 
 
 		 618 aa  201  5e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>