More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5235 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  47.25 
 
 		 821 aa  710    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  47.25 
 
 		 776 aa  709    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  47.13 
 
 		 776 aa  707    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  47.25 
 
 		 776 aa  710    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  49.15 
 
 		 780 aa  734    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  47.25 
 
 		 821 aa  708    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  47.25 
 
 		 776 aa  710    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  51.1 
 
 		 781 aa  762    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  47.13 
 
 		 790 aa  691    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  48.11 
 
 		 779 aa  731    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  100 
 
 		 797 aa  1639    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  49.15 
 
 		 780 aa  734    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  47.25 
 
 		 776 aa  710    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  46.01 
 
 		 790 aa  687    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 1143 aa  345  1e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  35.47 
 
 		 1144 aa  334  4e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  35.82 
 
 		 1116 aa  321  3e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  33.6 
 
 		 754 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  33.84 
 
 		 754 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 		 974 aa  303  9e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  37.03 
 
 		 708 aa  299  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  33.28 
 
 		 627 aa  298  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  34.71 
 
 		 828 aa  298  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  33.97 
 
 		 828 aa  296  7e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  34.71 
 
 		 828 aa  296  8e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  31.44 
 
 		 824 aa  296  8e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  36.46 
 
 		 585 aa  294  5e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  31.56 
 
 		 1714 aa  293  9e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  34.7 
 
 		 633 aa  291  3e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 		 789 aa  289  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.65 
 
 		 1106 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  34.67 
 
 		 822 aa  283  6.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 		 732 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  34.68 
 
 		 789 aa  282  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.55 
 
 		 589 aa  280  8e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  34.21 
 
 		 1106 aa  277  6e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  33.1 
 
 		 598 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 		 619 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  29.12 
 
 		 717 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 		 717 aa  273  6e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  33.01 
 
 		 699 aa  273  9e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  34.14 
 
 		 937 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.97 
 
 		 589 aa  270  8e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  31.95 
 
 		 647 aa  265  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 		 968 aa  265  4e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 		 626 aa  261  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.99 
 
 		 529 aa  259  1e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  29.13 
 
 		 1221 aa  258  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  33.46 
 
 		 796 aa  257  7e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  33.1 
 
 		 595 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.27 
 
 		 667 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  32.79 
 
 		 833 aa  253  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  29.31 
 
 		 715 aa  250  8e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  31.28 
 
 		 713 aa  246  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 734 aa  243  1e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  29.73 
 
 		 708 aa  241  5e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  29.31 
 
 		 596 aa  234  6e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  29.49 
 
 		 921 aa  228  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.28 
 
 		 723 aa  228  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.84 
 
 		 739 aa  228  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  30.29 
 
 		 693 aa  226  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 727 aa  224  4.9999999999999996e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  29.48 
 
 		 718 aa  223  8e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  29.93 
 
 		 1415 aa  221  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  33.12 
 
 		 739 aa  219  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0605  tetratricopeptide domain-containing protein  31.16 
 
 		 553 aa  215  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.335277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  27.35 
 
 		 633 aa  210  9e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.63 
 
 		 739 aa  209  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.86 
 
 		 740 aa  207  9e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  29.16 
 
 		 1085 aa  206  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0103  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 		 733 aa  202  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467133  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  30.66 
 
 		 552 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 		 750 aa  195  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  26.37 
 
 		 739 aa  195  4e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  25.82 
 
 		 816 aa  194  4e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  30.62 
 
 		 667 aa  192  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  27.47 
 
 		 700 aa  190  9e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  28 
 
 		 742 aa  188  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  23.02 
 
 		 909 aa  187  6e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 		 3560 aa  187  6e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 		 808 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 		 3035 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  28.9 
 
 		 654 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  30.12 
 
 		 672 aa  179  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  25.43 
 
 		 4489 aa  178  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  29.78 
 
 		 568 aa  177  7e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 		 632 aa  177  9e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  33.68 
 
 		 630 aa  174  6.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 		 740 aa  171  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  24.29 
 
 		 1094 aa  171  5e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 		 569 aa  163  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  32.16 
 
 		 633 aa  163  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  24.12 
 
 		 618 aa  159  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 		 647 aa  158  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 574 aa  157  5.0000000000000005e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2410  hypothetical protein  30.61 
 
 		 624 aa  156  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  26.15 
 
 		 680 aa  155  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 		 611 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2411  hypothetical protein  31.51 
 
 		 582 aa  155  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100681  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  26.48 
 
 		 750 aa  154  7e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>