More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3801 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  71.25 
 
 		 715 aa  1058    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 713 aa  1455    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  42.26 
 
 		 739 aa  555  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  43.02 
 
 		 739 aa  542  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  41.58 
 
 		 742 aa  535  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  41.55 
 
 		 740 aa  515  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  39.86 
 
 		 739 aa  513  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  34.17 
 
 		 708 aa  353  4e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.78 
 
 		 1106 aa  335  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  31.3 
 
 		 699 aa  330  4e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  35.99 
 
 		 1106 aa  330  4e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 		 828 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 		 732 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  34.26 
 
 		 754 aa  313  9e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  30.52 
 
 		 718 aa  310  5e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  29.53 
 
 		 789 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  29.88 
 
 		 3560 aa  303  1e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  31.72 
 
 		 754 aa  302  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.34 
 
 		 667 aa  296  7e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.39 
 
 		 3035 aa  295  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 		 4489 aa  295  2e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  30.17 
 
 		 824 aa  294  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 		 1094 aa  291  4e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  36.23 
 
 		 585 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  32.1 
 
 		 937 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 		 828 aa  289  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  29.54 
 
 		 828 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 		 968 aa  283  8.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 717 aa  280  7e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 717 aa  279  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 		 1714 aa  277  4e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  27.57 
 
 		 708 aa  276  1.0000000000000001e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.4 
 
 		 790 aa  272  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  32.72 
 
 		 790 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 		 693 aa  270  5e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 		 734 aa  270  8.999999999999999e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 		 627 aa  269  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  30.29 
 
 		 647 aa  269  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.39 
 
 		 529 aa  267  5.999999999999999e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  32.23 
 
 		 780 aa  266  8e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  32.23 
 
 		 780 aa  266  8e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  31.22 
 
 		 833 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  30.44 
 
 		 833 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.97 
 
 		 589 aa  265  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  35.08 
 
 		 633 aa  264  4.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  30.15 
 
 		 626 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.28 
 
 		 589 aa  262  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  32.13 
 
 		 779 aa  260  6e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  29.56 
 
 		 789 aa  257  5e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  30.04 
 
 		 796 aa  256  8e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  27.09 
 
 		 808 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  27 
 
 		 761 aa  255  2.0000000000000002e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  31.16 
 
 		 822 aa  251  4e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 		 776 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  31.02 
 
 		 1116 aa  246  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  30.28 
 
 		 781 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  30.64 
 
 		 1415 aa  246  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 		 776 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  29.07 
 
 		 821 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  31.01 
 
 		 797 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  30.96 
 
 		 1221 aa  245  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  29.07 
 
 		 821 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  29.07 
 
 		 776 aa  244  5e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  29.07 
 
 		 776 aa  244  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  29.07 
 
 		 776 aa  244  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 740 aa  238  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  25.59 
 
 		 732 aa  237  5.0000000000000005e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  30.89 
 
 		 921 aa  237  5.0000000000000005e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  31.83 
 
 		 598 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 		 619 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  27.96 
 
 		 596 aa  230  7e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 974 aa  228  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.01 
 
 		 723 aa  228  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  24.93 
 
 		 816 aa  228  3e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  28.03 
 
 		 1143 aa  223  7e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 		 1085 aa  223  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  35.28 
 
 		 633 aa  219  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  29.26 
 
 		 595 aa  217  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0605  tetratricopeptide domain-containing protein  31.39 
 
 		 553 aa  215  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.335277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  24.96 
 
 		 739 aa  214  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  23.71 
 
 		 909 aa  214  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 		 667 aa  209  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  23.9 
 
 		 750 aa  209  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 		 647 aa  205  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  29.31 
 
 		 1144 aa  203  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  33.15 
 
 		 727 aa  201  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  29.14 
 
 		 552 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1874  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.19 
 
 		 793 aa  194  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  25.92 
 
 		 706 aa  194  4e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  27.65 
 
 		 660 aa  191  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 		 700 aa  189  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 		 618 aa  187  6e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0114  TPR repeat-containing protein  24.71 
 
 		 724 aa  178  4e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.029745  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  22.43 
 
 		 632 aa  177  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0103  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 		 733 aa  177  5e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467133  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 654 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  31.1 
 
 		 566 aa  169  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 616 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 		 750 aa  166  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 		 569 aa  163  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>