More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0166 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  47.55 
 
 		 833 aa  637    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  46.4 
 
 		 824 aa  656    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  49.45 
 
 		 828 aa  697    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  96.42 
 
 		 754 aa  1434    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  51.47 
 
 		 732 aa  687    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  47.46 
 
 		 828 aa  655    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 754 aa  1502    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  49.45 
 
 		 828 aa  697    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  47.22 
 
 		 789 aa  659    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  42.69 
 
 		 833 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  50.08 
 
 		 708 aa  537  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  42.15 
 
 		 626 aa  456  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  45.12 
 
 		 595 aa  443  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  44.68 
 
 		 619 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  36.55 
 
 		 789 aa  441  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  44.15 
 
 		 598 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  32.28 
 
 		 718 aa  355  1e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 909 aa  335  2e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 		 713 aa  327  7e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  33.72 
 
 		 715 aa  325  2e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  33.95 
 
 		 717 aa  325  3e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  33.6 
 
 		 717 aa  323  9.999999999999999e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.97 
 
 		 739 aa  319  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  34.59 
 
 		 937 aa  317  4e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.36 
 
 		 1106 aa  317  4e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  29.3 
 
 		 816 aa  315  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  33.03 
 
 		 821 aa  314  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  33.03 
 
 		 776 aa  313  9e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  33.03 
 
 		 776 aa  313  9e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  33.03 
 
 		 776 aa  313  9e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  32.11 
 
 		 968 aa  312  1e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  32.66 
 
 		 797 aa  312  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  31.85 
 
 		 708 aa  311  2e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.75 
 
 		 667 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  37.98 
 
 		 585 aa  307  4.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  32.63 
 
 		 821 aa  306  7e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  33.22 
 
 		 1221 aa  306  8.000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 		 776 aa  306  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  30.64 
 
 		 3035 aa  306  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 		 776 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  35.22 
 
 		 1106 aa  305  3.0000000000000004e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.22 
 
 		 589 aa  303  7.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  33.51 
 
 		 781 aa  303  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.01 
 
 		 589 aa  301  3e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.54 
 
 		 739 aa  301  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  28.84 
 
 		 750 aa  300  6e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.54 
 
 		 742 aa  296  8e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  32.87 
 
 		 699 aa  293  1e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  33.27 
 
 		 1714 aa  289  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 		 1085 aa  289  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 3560 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  33.1 
 
 		 596 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.77 
 
 		 740 aa  287  5.999999999999999e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.45 
 
 		 739 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 		 734 aa  285  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  29.4 
 
 		 1094 aa  283  9e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.42 
 
 		 723 aa  283  9e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28.54 
 
 		 4489 aa  279  1e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.28 
 
 		 790 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 		 633 aa  275  3e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  31.05 
 
 		 790 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 		 796 aa  273  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  34.35 
 
 		 627 aa  271  2.9999999999999997e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 		 808 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  30.92 
 
 		 780 aa  266  8e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  30.92 
 
 		 780 aa  266  8e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  30.53 
 
 		 1415 aa  266  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 		 779 aa  265  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  32.81 
 
 		 822 aa  264  4e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  30.27 
 
 		 693 aa  263  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  35.16 
 
 		 633 aa  258  4e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  30.68 
 
 		 1144 aa  256  7e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.53 
 
 		 529 aa  255  3e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  31.66 
 
 		 700 aa  249  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 		 974 aa  247  4.9999999999999997e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  32.87 
 
 		 1143 aa  246  8e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 		 739 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  30.82 
 
 		 1116 aa  238  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  38.21 
 
 		 727 aa  236  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1874  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.01 
 
 		 793 aa  233  7.000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  34.86 
 
 		 654 aa  231  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  30.96 
 
 		 921 aa  231  4e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0103  TPR repeat-containing protein  33.47 
 
 		 733 aa  223  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467133  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  25.39 
 
 		 761 aa  219  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  29.97 
 
 		 750 aa  219  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 		 732 aa  219  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  33.05 
 
 		 667 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 647 aa  216  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  28.01 
 
 		 706 aa  216  1.9999999999999998e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  29.8 
 
 		 680 aa  211  5e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  35 
 
 		 552 aa  207  8e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  23.06 
 
 		 632 aa  201  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 		 611 aa  200  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0114  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 724 aa  198  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.029745  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 		 740 aa  198  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.81 
 
 		 810 aa  197  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  23.53 
 
 		 1154 aa  197  7e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  33.58 
 
 		 633 aa  196  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2410  hypothetical protein  30.59 
 
 		 624 aa  195  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2579  hypothetical protein  34.88 
 
 		 588 aa  192  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>