More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2093 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1714 aa  3571    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 		 3560 aa  422  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  41.77 
 
 		 585 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.04 
 
 		 589 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 		 3035 aa  399  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.48 
 
 		 589 aa  384  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.62 
 
 		 1106 aa  351  9e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  36.24 
 
 		 627 aa  350  1e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  24.95 
 
 		 4489 aa  347  1e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  37.75 
 
 		 1106 aa  333  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  35.78 
 
 		 828 aa  331  9e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 		 968 aa  329  3e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  33.46 
 
 		 789 aa  328  7e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  34.54 
 
 		 633 aa  324  9.000000000000001e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  34.66 
 
 		 708 aa  324  9.999999999999999e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  34.5 
 
 		 828 aa  320  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  34.32 
 
 		 828 aa  318  6e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  36.85 
 
 		 937 aa  317  1.9999999999999998e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  33.27 
 
 		 626 aa  313  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.14 
 
 		 667 aa  306  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  33.39 
 
 		 708 aa  304  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  33.52 
 
 		 789 aa  303  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  33.83 
 
 		 732 aa  302  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  32.9 
 
 		 833 aa  302  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  32.9 
 
 		 833 aa  301  7e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  30.63 
 
 		 699 aa  300  1e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 619 aa  295  4e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  31.56 
 
 		 797 aa  293  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 		 598 aa  293  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 		 754 aa  290  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  33.27 
 
 		 754 aa  289  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  29.76 
 
 		 1221 aa  286  3.0000000000000004e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.5 
 
 		 739 aa  286  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  31.18 
 
 		 790 aa  283  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  31.56 
 
 		 822 aa  281  6e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 		 776 aa  280  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  30.19 
 
 		 821 aa  280  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 		 776 aa  280  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  30.19 
 
 		 821 aa  279  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.73 
 
 		 529 aa  280  3e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.05 
 
 		 790 aa  279  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  30.19 
 
 		 776 aa  279  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  30.19 
 
 		 776 aa  279  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  30.19 
 
 		 776 aa  279  4e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  29.6 
 
 		 596 aa  279  4e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 		 713 aa  277  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 		 717 aa  276  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 		 595 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  32.64 
 
 		 824 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  31.21 
 
 		 717 aa  276  3e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 		 693 aa  276  4.0000000000000004e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  30.54 
 
 		 1415 aa  274  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  30.86 
 
 		 779 aa  272  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  30.84 
 
 		 780 aa  271  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 		 780 aa  271  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  30.04 
 
 		 1143 aa  269  4e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 		 718 aa  268  8.999999999999999e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  29.85 
 
 		 734 aa  266  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  29.7 
 
 		 1116 aa  266  3e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.16 
 
 		 739 aa  265  4.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  31.82 
 
 		 715 aa  265  6e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.32 
 
 		 740 aa  263  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  30.17 
 
 		 781 aa  261  9e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  31.16 
 
 		 921 aa  261  1e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 		 909 aa  258  9e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  29.44 
 
 		 1144 aa  257  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  31.98 
 
 		 633 aa  254  1e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 		 750 aa  252  4e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.67 
 
 		 742 aa  250  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  36.77 
 
 		 647 aa  249  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  32.91 
 
 		 796 aa  246  3e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  28.88 
 
 		 816 aa  244  9e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.7 
 
 		 723 aa  241  5.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 		 727 aa  239  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.49 
 
 		 739 aa  238  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 		 1085 aa  236  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0103  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 		 733 aa  233  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467133  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  28.62 
 
 		 739 aa  228  7e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0605  tetratricopeptide domain-containing protein  30.22 
 
 		 553 aa  226  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.335277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  30.2 
 
 		 667 aa  224  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  29.12 
 
 		 808 aa  223  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  29.34 
 
 		 1094 aa  221  7e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  28.9 
 
 		 700 aa  220  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  25.08 
 
 		 632 aa  218  7e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 		 672 aa  217  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  28.94 
 
 		 552 aa  216  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  27.53 
 
 		 618 aa  209  4e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  34.12 
 
 		 566 aa  207  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  27.87 
 
 		 974 aa  207  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  34.75 
 
 		 633 aa  204  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  29.28 
 
 		 616 aa  203  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 		 750 aa  200  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1874  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.61 
 
 		 793 aa  200  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 		 611 aa  199  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  33.79 
 
 		 632 aa  198  6e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  28.6 
 
 		 654 aa  194  9e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  27.32 
 
 		 706 aa  193  2.9999999999999997e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 574 aa  193  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  34.15 
 
 		 657 aa  193  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  33.97 
 
 		 630 aa  191  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>