More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0772 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 611 aa  1266    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  42.75 
 
 		 3035 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  40.32 
 
 		 3560 aa  402  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  41.85 
 
 		 4489 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  39.09 
 
 		 1094 aa  379  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  40.04 
 
 		 700 aa  379  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  40.18 
 
 		 1085 aa  378  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  38.25 
 
 		 654 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  37.05 
 
 		 680 aa  372  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  38.99 
 
 		 761 aa  371  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  38.96 
 
 		 647 aa  356  7.999999999999999e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  36.68 
 
 		 816 aa  354  2e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3853  O-linked acetylglucosamine transferase  45.9 
 
 		 590 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4069  TPR repeat-containing protein  45.9 
 
 		 590 aa  352  8e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00017793  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  41.54 
 
 		 732 aa  349  1e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  35.4 
 
 		 750 aa  348  2e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 909 aa  340  5e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  35.99 
 
 		 618 aa  337  2.9999999999999997e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  43.44 
 
 		 569 aa  337  3.9999999999999995e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  37.29 
 
 		 667 aa  335  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  35.22 
 
 		 739 aa  328  3e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  36.52 
 
 		 660 aa  325  1e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  36.96 
 
 		 574 aa  312  1e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  33.02 
 
 		 740 aa  311  2.9999999999999997e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  47.01 
 
 		 459 aa  310  5e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  46.02 
 
 		 492 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  37.79 
 
 		 616 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20301  hypothetical protein  41.88 
 
 		 395 aa  296  8e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.236649 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  34.58 
 
 		 672 aa  288  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  35.26 
 
 		 560 aa  280  8e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  36.46 
 
 		 568 aa  275  2.0000000000000002e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7846  hypothetical protein  43.5 
 
 		 452 aa  274  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346388 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 		 632 aa  273  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.53 
 
 		 570 aa  270  5e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0359  hypothetical protein  41.74 
 
 		 657 aa  270  8e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224796  normal  0.0716049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  41.85 
 
 		 657 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  33.28 
 
 		 706 aa  265  2e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  35.41 
 
 		 632 aa  259  8e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  33.22 
 
 		 808 aa  256  9e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  38.95 
 
 		 566 aa  250  4e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1319  TPR repeat-containing protein  46.4 
 
 		 295 aa  246  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000490816  hitchhiker  8.5993e-22 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  30.37 
 
 		 750 aa  243  5e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  35.79 
 
 		 633 aa  232  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  35.43 
 
 		 637 aa  231  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  31.22 
 
 		 708 aa  230  7e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2411  hypothetical protein  34.25 
 
 		 582 aa  226  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100681  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  36.64 
 
 		 630 aa  226  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2410  hypothetical protein  35.61 
 
 		 624 aa  225  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.68 
 
 		 1106 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2579  hypothetical protein  34.13 
 
 		 588 aa  221  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385383  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  29.72 
 
 		 1106 aa  211  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  32.26 
 
 		 585 aa  207  4e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 		 717 aa  206  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 		 968 aa  203  9e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 		 717 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 754 aa  200  7e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 		 754 aa  200  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 		 1714 aa  199  9e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0256  hypothetical protein  32.09 
 
 		 719 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 		 824 aa  195  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  29.16 
 
 		 789 aa  194  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  28.52 
 
 		 619 aa  194  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 598 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.36 
 
 		 589 aa  191  5e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00265  UDP-N-acetylglucosaminyltransferase (AFU_orthologue; AFUA_1G03380)  32.54 
 
 		 1596 aa  189  1e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0115382 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 		 626 aa  189  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 		 796 aa  189  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0346  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 739 aa  188  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110262  normal  0.110805 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 789 aa  188  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  28.98 
 
 		 833 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2387  tetratricopeptide TPR_2  30.92 
 
 		 745 aa  186  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.625245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  29.39 
 
 		 833 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  28.29 
 
 		 718 aa  182  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  28.52 
 
 		 595 aa  182  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0934  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 739 aa  181  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.897718 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 		 732 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.96 
 
 		 589 aa  179  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.23 
 
 		 529 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 647 aa  175  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4067  hypothetical protein  30 
 
 		 747 aa  175  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  29 
 
 		 1143 aa  173  7.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  29.33 
 
 		 1116 aa  172  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  27.72 
 
 		 1221 aa  171  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2394  hypothetical protein  29.97 
 
 		 740 aa  170  7e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000509541  hitchhiker  0.0000624153 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0933  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 		 738 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.450791  normal  0.93664 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 828 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 828 aa  169  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  31.27 
 
 		 633 aa  168  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 		 828 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  25.98 
 
 		 596 aa  166  9e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1874  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.55 
 
 		 793 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  30.83 
 
 		 699 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 		 727 aa  164  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  26.07 
 
 		 776 aa  162  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  28.07 
 
 		 1144 aa  162  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  34.36 
 
 		 937 aa  162  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  26.07 
 
 		 776 aa  162  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  26.07 
 
 		 776 aa  162  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  26.26 
 
 		 821 aa  161  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  28.52 
 
 		 822 aa  161  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>