More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0637 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 4489 aa  9215    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  48 
 
 		 732 aa  674    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  44.99 
 
 		 761 aa  674    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  63.17 
 
 		 1094 aa  1030    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  54.96 
 
 		 3560 aa  2939    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  55.02 
 
 		 3035 aa  3196    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  41.76 
 
 		 909 aa  599  1e-169  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  43.8 
 
 		 1085 aa  584  1e-164  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  42.6 
 
 		 740 aa  552  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  47.7 
 
 		 618 aa  552  1e-155  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  47.45 
 
 		 654 aa  540  1e-151  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  38.81 
 
 		 816 aa  516  1e-144  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  40.69 
 
 		 750 aa  497  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  43.22 
 
 		 660 aa  472  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 700 aa  472  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  41.16 
 
 		 739 aa  471  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  40.35 
 
 		 647 aa  469  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  39.43 
 
 		 667 aa  436  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 808 aa  411  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  38.74 
 
 		 616 aa  409  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  41.85 
 
 		 611 aa  400  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  42.94 
 
 		 569 aa  399  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  46.49 
 
 		 459 aa  385  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  45.56 
 
 		 492 aa  385  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  41.45 
 
 		 574 aa  379  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7846  hypothetical protein  44.72 
 
 		 452 aa  363  3e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346388 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  34.85 
 
 		 706 aa  360  2.9999999999999997e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  32.8 
 
 		 750 aa  350  4e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  24.95 
 
 		 1714 aa  347  2.9999999999999997e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1319  TPR repeat-containing protein  56.1 
 
 		 295 aa  341  1.9999999999999998e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000490816  hitchhiker  8.5993e-22 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20301  hypothetical protein  49.58 
 
 		 395 aa  338  2e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.236649 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  38.49 
 
 		 560 aa  334  2e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  42.82 
 
 		 657 aa  328  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0359  hypothetical protein  43.32 
 
 		 657 aa  328  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224796  normal  0.0716049 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 		 789 aa  322  7e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  37.18 
 
 		 568 aa  322  2e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  29.36 
 
 		 828 aa  318  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  37.7 
 
 		 632 aa  315  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  29.24 
 
 		 828 aa  315  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  28.39 
 
 		 824 aa  311  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  36.73 
 
 		 1694 aa  311  2.0000000000000002e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  30.18 
 
 		 828 aa  306  6.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  39.35 
 
 		 1276 aa  299  9e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 		 713 aa  295  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  40.99 
 
 		 637 aa  293  4e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  41.71 
 
 		 566 aa  292  9e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  32.09 
 
 		 680 aa  291  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  39.26 
 
 		 633 aa  291  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.97 
 
 		 570 aa  291  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 		 718 aa  291  2.9999999999999996e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3853  O-linked acetylglucosamine transferase  40.42 
 
 		 590 aa  290  5.999999999999999e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4069  TPR repeat-containing protein  41.9 
 
 		 590 aa  288  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00017793  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  36.01 
 
 		 672 aa  286  5.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 		 632 aa  285  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 		 732 aa  277  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 		 754 aa  276  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  27.9 
 
 		 754 aa  275  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  39.13 
 
 		 630 aa  273  7e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 708 aa  272  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 		 833 aa  271  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2411  hypothetical protein  39.76 
 
 		 582 aa  270  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100681  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  28.09 
 
 		 833 aa  269  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  27.95 
 
 		 715 aa  267  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.73 
 
 		 1106 aa  265  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2410  hypothetical protein  38.03 
 
 		 624 aa  263  5.0000000000000005e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  25.46 
 
 		 1252 aa  263  8e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.23 
 
 		 739 aa  262  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  34.21 
 
 		 585 aa  261  3e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2579  hypothetical protein  36.29 
 
 		 588 aa  261  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385383  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  25.36 
 
 		 1252 aa  260  6e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.28 
 
 		 742 aa  259  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 1106 aa  254  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  37.33 
 
 		 543 aa  251  2e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  36.09 
 
 		 878 aa  249  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  28.73 
 
 		 595 aa  247  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  38.17 
 
 		 573 aa  244  2.9999999999999997e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  27.59 
 
 		 708 aa  242  1e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  28.9 
 
 		 598 aa  240  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  37.46 
 
 		 711 aa  238  1.0000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  26.75 
 
 		 968 aa  236  6e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.17 
 
 		 667 aa  236  9e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  29.97 
 
 		 627 aa  236  9e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 		 619 aa  233  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  39.23 
 
 		 740 aa  233  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  29.45 
 
 		 937 aa  232  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.68 
 
 		 739 aa  231  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.15 
 
 		 810 aa  229  7e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 717 aa  225  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  40.95 
 
 		 681 aa  224  3e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 717 aa  224  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.37 
 
 		 739 aa  224  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  26.17 
 
 		 1154 aa  222  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  36 
 
 		 562 aa  219  7e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  34.64 
 
 		 955 aa  219  8e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 		 734 aa  218  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  36.54 
 
 		 602 aa  218  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.85 
 
 		 790 aa  217  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  27.88 
 
 		 699 aa  215  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  27.82 
 
 		 626 aa  216  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  34.36 
 
 		 764 aa  214  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>