188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3853 on replicon NC_009007
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009007  RSP_3853  O-linked acetylglucosamine transferase  100 
 
 		 590 aa  1150    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4069  TPR repeat-containing protein  99.32 
 
 		 590 aa  1145    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00017793  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  41.71 
 
 		 611 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  35.91 
 
 		 700 aa  318  1e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  37.1 
 
 		 3035 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  35.88 
 
 		 3560 aa  306  6e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  34 
 
 		 761 aa  301  2e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  36.15 
 
 		 1085 aa  298  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  35.29 
 
 		 680 aa  296  7e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  36.12 
 
 		 4489 aa  294  4e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  35.05 
 
 		 1094 aa  290  4e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  37.01 
 
 		 654 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  39.05 
 
 		 667 aa  270  5e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  44.72 
 
 		 574 aa  270  7e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  33.27 
 
 		 732 aa  268  2e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 		 750 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  34.19 
 
 		 647 aa  258  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  38.86 
 
 		 672 aa  256  9e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  43.38 
 
 		 459 aa  253  6e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  42.9 
 
 		 492 aa  253  7e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  38.2 
 
 		 569 aa  253  9.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 		 660 aa  251  2e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 		 909 aa  251  4e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  36.64 
 
 		 740 aa  250  6e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  31.69 
 
 		 618 aa  247  4e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 739 aa  246  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  35.26 
 
 		 560 aa  244  3.9999999999999997e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  32.91 
 
 		 616 aa  244  3.9999999999999997e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  27.92 
 
 		 816 aa  243  5e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  41.23 
 
 		 637 aa  239  6.999999999999999e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7846  hypothetical protein  43.57 
 
 		 452 aa  229  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346388 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0359  hypothetical protein  37.81 
 
 		 657 aa  228  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224796  normal  0.0716049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  36.84 
 
 		 657 aa  225  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  37.06 
 
 		 566 aa  224  4e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  39.78 
 
 		 632 aa  222  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 		 808 aa  221  3.9999999999999997e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 		 706 aa  219  1e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20301  hypothetical protein  36.41 
 
 		 395 aa  219  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.236649 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  33.21 
 
 		 708 aa  217  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.13 
 
 		 570 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  36.99 
 
 		 633 aa  214  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  32.37 
 
 		 568 aa  213  7.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  39.83 
 
 		 750 aa  211  4e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2411  hypothetical protein  35.18 
 
 		 582 aa  203  8e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100681  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2410  hypothetical protein  33.61 
 
 		 624 aa  198  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1319  TPR repeat-containing protein  38.99 
 
 		 295 aa  195  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000490816  hitchhiker  8.5993e-22 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  33.96 
 
 		 630 aa  194  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  22.52 
 
 		 632 aa  189  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2579  hypothetical protein  34.06 
 
 		 588 aa  184  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385383  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 		 968 aa  181  4e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 732 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  28.98 
 
 		 718 aa  178  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.38 
 
 		 589 aa  177  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 		 626 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.06 
 
 		 589 aa  173  7.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  30.76 
 
 		 633 aa  173  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  31.64 
 
 		 595 aa  170  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  31.12 
 
 		 585 aa  169  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0256  hypothetical protein  29.1 
 
 		 719 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.29 
 
 		 1106 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 		 754 aa  166  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  30.02 
 
 		 619 aa  166  9e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0346  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 		 739 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110262  normal  0.110805 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  31.6 
 
 		 754 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 717 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  33.97 
 
 		 647 aa  163  9e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 717 aa  161  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 		 598 aa  161  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 		 776 aa  160  6e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  29.63 
 
 		 821 aa  160  7e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  29.44 
 
 		 821 aa  160  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  31.24 
 
 		 833 aa  160  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 		 776 aa  159  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  29.63 
 
 		 776 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  29.68 
 
 		 833 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  29.63 
 
 		 776 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  29.63 
 
 		 776 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4067  hypothetical protein  29.36 
 
 		 747 aa  159  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 796 aa  157  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  28.31 
 
 		 699 aa  156  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.91 
 
 		 742 aa  156  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  29.77 
 
 		 824 aa  155  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  28.6 
 
 		 789 aa  153  8.999999999999999e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0933  TPR repeat-containing protein  32.05 
 
 		 738 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.450791  normal  0.93664 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  26.66 
 
 		 1221 aa  152  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  35.8 
 
 		 937 aa  152  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  31.2 
 
 		 1106 aa  153  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0114  TPR repeat-containing protein  28.27 
 
 		 724 aa  152  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.029745  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0934  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 		 739 aa  151  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.897718 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  33.03 
 
 		 727 aa  150  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 1714 aa  150  7e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  31.77 
 
 		 789 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 		 828 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.93 
 
 		 739 aa  146  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.68 
 
 		 723 aa  144  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2387  tetratricopeptide TPR_2  28.25 
 
 		 745 aa  144  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.625245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  26.73 
 
 		 708 aa  144  5e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  27.98 
 
 		 552 aa  143  9e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 633 aa  142  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 734 aa  142  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>