193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0114 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0114  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 724 aa  1467    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.029745  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.34 
 
 		 589 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.54 
 
 		 589 aa  208  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  25.12 
 
 		 699 aa  207  5e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 		 708 aa  205  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.42 
 
 		 529 aa  204  4e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.92 
 
 		 1106 aa  200  7.999999999999999e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  25.9 
 
 		 828 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 754 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  23.57 
 
 		 968 aa  197  4.0000000000000005e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 754 aa  196  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  24.6 
 
 		 732 aa  195  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 633 aa  195  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  23 
 
 		 824 aa  194  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 		 789 aa  194  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  29.83 
 
 		 833 aa  193  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  29.56 
 
 		 1106 aa  193  9e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  24.14 
 
 		 718 aa  192  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 		 833 aa  192  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  23.16 
 
 		 789 aa  192  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  32.77 
 
 		 1714 aa  189  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  24.28 
 
 		 627 aa  187  5e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.13 
 
 		 739 aa  187  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  24.56 
 
 		 585 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 		 626 aa  183  9.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  27.22 
 
 		 708 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  28.27 
 
 		 633 aa  181  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  24.02 
 
 		 828 aa  180  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0113  O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.78 
 
 		 726 aa  179  2e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0423432  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  24.37 
 
 		 828 aa  179  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.95 
 
 		 739 aa  179  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  24.71 
 
 		 713 aa  178  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 		 595 aa  177  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  24.33 
 
 		 717 aa  177  7e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  30.08 
 
 		 937 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  23.97 
 
 		 717 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.17 
 
 		 742 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.89 
 
 		 667 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  23.5 
 
 		 739 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 		 619 aa  173  9e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  26.41 
 
 		 598 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  25.63 
 
 		 822 aa  171  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  23.54 
 
 		 596 aa  169  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  22.93 
 
 		 796 aa  168  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  23.84 
 
 		 715 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 		 693 aa  165  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.2 
 
 		 740 aa  165  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  28.92 
 
 		 1221 aa  165  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 		 734 aa  164  6e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  24.27 
 
 		 790 aa  163  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  22.86 
 
 		 776 aa  163  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  22.85 
 
 		 700 aa  162  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  23.22 
 
 		 647 aa  162  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  22.7 
 
 		 821 aa  161  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  22.7 
 
 		 776 aa  160  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  22.53 
 
 		 821 aa  160  7e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  22.53 
 
 		 776 aa  160  7e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  22.53 
 
 		 776 aa  160  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  22.53 
 
 		 776 aa  160  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  23.7 
 
 		 1094 aa  158  3e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.72 
 
 		 790 aa  157  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  25.12 
 
 		 3560 aa  156  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4069  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 590 aa  152  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00017793  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  27.15 
 
 		 1415 aa  152  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3853  O-linked acetylglucosamine transferase  28.27 
 
 		 590 aa  151  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  28.09 
 
 		 781 aa  150  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  24.71 
 
 		 816 aa  150  8e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  24.6 
 
 		 750 aa  150  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  26.46 
 
 		 492 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 3035 aa  148  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.05 
 
 		 723 aa  147  9e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0103  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 		 733 aa  145  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467133  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  24.96 
 
 		 761 aa  144  7e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  28.1 
 
 		 632 aa  143  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 		 727 aa  143  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  25.4 
 
 		 680 aa  142  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  28.3 
 
 		 1144 aa  141  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  23.32 
 
 		 779 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  23.51 
 
 		 780 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  23.51 
 
 		 780 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  24.17 
 
 		 4489 aa  140  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  24.26 
 
 		 1143 aa  140  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1874  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.74 
 
 		 793 aa  139  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 		 660 aa  138  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  27.79 
 
 		 611 aa  137  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  24.37 
 
 		 732 aa  137  7.000000000000001e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  23.96 
 
 		 909 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  28.46 
 
 		 630 aa  135  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 		 706 aa  136  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  26.59 
 
 		 657 aa  136  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  24.16 
 
 		 647 aa  135  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0359  hypothetical protein  26.59 
 
 		 657 aa  135  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224796  normal  0.0716049 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 		 1085 aa  135  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  26.22 
 
 		 667 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  25.58 
 
 		 637 aa  134  9e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  27.07 
 
 		 566 aa  132  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  25.07 
 
 		 632 aa  131  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  27.27 
 
 		 1116 aa  130  7.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0605  tetratricopeptide domain-containing protein  22.29 
 
 		 553 aa  130  9.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.335277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  24.36 
 
 		 552 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>