More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0732 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 706 aa  1449    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  38.19 
 
 		 808 aa  449  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  35.62 
 
 		 3035 aa  379  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  35.59 
 
 		 1085 aa  374  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  33.97 
 
 		 3560 aa  375  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  35.15 
 
 		 4489 aa  364  2e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  30.88 
 
 		 816 aa  363  5.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  31.38 
 
 		 909 aa  353  8.999999999999999e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  34.45 
 
 		 1094 aa  350  7e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  34.42 
 
 		 700 aa  346  8e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  30.72 
 
 		 750 aa  335  2e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  32.81 
 
 		 647 aa  328  3e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 		 740 aa  324  4e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  35.78 
 
 		 654 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 739 aa  319  1e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 761 aa  303  6.000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  33.65 
 
 		 667 aa  299  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  30.75 
 
 		 732 aa  298  3e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  28.94 
 
 		 660 aa  295  1e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  31.94 
 
 		 618 aa  281  3e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  36.72 
 
 		 492 aa  279  1e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  33.88 
 
 		 611 aa  272  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  29.61 
 
 		 680 aa  263  6e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  38.68 
 
 		 459 aa  259  8e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 		 750 aa  259  9e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  36.04 
 
 		 569 aa  259  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 		 632 aa  255  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 		 616 aa  254  5.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7846  hypothetical protein  36.18 
 
 		 452 aa  254  6e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346388 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.89 
 
 		 570 aa  246  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  32.72 
 
 		 574 aa  244  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 		 828 aa  238  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 		 828 aa  238  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  35.76 
 
 		 568 aa  234  4.0000000000000004e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0256  hypothetical protein  31.38 
 
 		 719 aa  233  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  27.3 
 
 		 789 aa  232  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20301  hypothetical protein  37.82 
 
 		 395 aa  231  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.236649 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  27.3 
 
 		 828 aa  231  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  29.4 
 
 		 585 aa  228  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  28.85 
 
 		 699 aa  226  1e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  26.84 
 
 		 968 aa  223  9e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 		 708 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 		 754 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  26.62 
 
 		 708 aa  218  4e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  26.16 
 
 		 833 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1319  TPR repeat-containing protein  40.85 
 
 		 295 aa  216  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000490816  hitchhiker  8.5993e-22 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  27.53 
 
 		 732 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 1106 aa  214  4.9999999999999996e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 		 824 aa  213  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.81 
 
 		 589 aa  212  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  27.26 
 
 		 789 aa  212  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  34.56 
 
 		 632 aa  211  6e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  27.47 
 
 		 1106 aa  210  7e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.64 
 
 		 589 aa  209  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3853  O-linked acetylglucosamine transferase  33.86 
 
 		 590 aa  207  7e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4069  TPR repeat-containing protein  38.96 
 
 		 590 aa  206  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00017793  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  34.52 
 
 		 633 aa  205  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  24.71 
 
 		 718 aa  204  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  29.72 
 
 		 672 aa  203  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 833 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 		 734 aa  201  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0934  TPR repeat-containing protein  35.77 
 
 		 739 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.897718 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  33.89 
 
 		 630 aa  201  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  33.43 
 
 		 657 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  27.55 
 
 		 1154 aa  201  6e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  29.77 
 
 		 560 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0359  hypothetical protein  32.32 
 
 		 657 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224796  normal  0.0716049 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 		 750 aa  196  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  33.99 
 
 		 637 aa  195  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  27.51 
 
 		 1714 aa  195  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  25.92 
 
 		 713 aa  195  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 		 754 aa  193  7e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  24.76 
 
 		 715 aa  193  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 		 693 aa  192  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  27.02 
 
 		 796 aa  189  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31 
 
 		 529 aa  189  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2387  tetratricopeptide TPR_2  31.54 
 
 		 745 aa  189  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.625245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0346  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 		 739 aa  188  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110262  normal  0.110805 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.07 
 
 		 742 aa  186  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 717 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  25.99 
 
 		 937 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  31.51 
 
 		 566 aa  184  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  27.44 
 
 		 717 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0933  TPR repeat-containing protein  32.75 
 
 		 738 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.450791  normal  0.93664 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4067  hypothetical protein  30.42 
 
 		 747 aa  183  9.000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2394  hypothetical protein  32.62 
 
 		 740 aa  183  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000509541  hitchhiker  0.0000624153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.3 
 
 		 739 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 		 647 aa  182  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2167  tetratricopeptide TPR_2  25.46 
 
 		 1014 aa  182  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  32.24 
 
 		 727 aa  181  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  24.69 
 
 		 626 aa  179  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  25.36 
 
 		 627 aa  178  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  31.15 
 
 		 1221 aa  177  6e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  24.85 
 
 		 837 aa  177  9e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2578  O-linked N-acetylglucosamine transferase SPINDLY family-like protein  32.43 
 
 		 731 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3536  hypothetical protein  32.15 
 
 		 731 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2579  hypothetical protein  30.56 
 
 		 588 aa  175  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385383  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.36 
 
 		 667 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2410  hypothetical protein  30.49 
 
 		 624 aa  174  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 		 822 aa  173  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>