More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0489 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 618 aa  1276    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  46.43 
 
 		 3035 aa  566  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  47.7 
 
 		 4489 aa  552  1e-156  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  45.72 
 
 		 3560 aa  546  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  46.46 
 
 		 1094 aa  530  1e-149  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1319  TPR repeat-containing protein  81.57 
 
 		 295 aa  508  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000490816  hitchhiker  8.5993e-22 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  43.42 
 
 		 761 aa  486  1e-136  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  40.16 
 
 		 1085 aa  452  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  39.31 
 
 		 732 aa  438  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  38.29 
 
 		 647 aa  423  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  36.02 
 
 		 700 aa  409  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  38.37 
 
 		 660 aa  408  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  39.97 
 
 		 654 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  35.47 
 
 		 909 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  35.18 
 
 		 667 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  35.42 
 
 		 740 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  35.35 
 
 		 750 aa  365  1e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  44.87 
 
 		 492 aa  364  2e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  36.26 
 
 		 574 aa  359  9e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  43.24 
 
 		 459 aa  357  2.9999999999999997e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  33.96 
 
 		 739 aa  352  1e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  36.22 
 
 		 816 aa  352  1e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  37.25 
 
 		 569 aa  350  5e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  38.77 
 
 		 616 aa  342  1e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  35.96 
 
 		 568 aa  338  1.9999999999999998e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  35.99 
 
 		 611 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7846  hypothetical protein  46.88 
 
 		 452 aa  327  5e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346388 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  32.62 
 
 		 808 aa  326  6e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.44 
 
 		 570 aa  321  3e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  39.24 
 
 		 632 aa  315  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20301  hypothetical protein  47.25 
 
 		 395 aa  313  6.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.236649 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  36.29 
 
 		 750 aa  293  5e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  39.9 
 
 		 657 aa  280  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 		 672 aa  280  6e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  32.1 
 
 		 706 aa  279  9e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  40.98 
 
 		 566 aa  278  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0359  hypothetical protein  39.11 
 
 		 657 aa  276  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224796  normal  0.0716049 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 		 632 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  38.42 
 
 		 633 aa  274  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  38.4 
 
 		 637 aa  270  5.9999999999999995e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  32.55 
 
 		 680 aa  267  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  38.13 
 
 		 560 aa  265  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2579  hypothetical protein  37.72 
 
 		 588 aa  259  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385383  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  35.73 
 
 		 630 aa  252  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2410  hypothetical protein  32.7 
 
 		 624 aa  248  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4069  TPR repeat-containing protein  33.4 
 
 		 590 aa  240  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00017793  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3853  O-linked acetylglucosamine transferase  33.19 
 
 		 590 aa  239  9e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2411  hypothetical protein  37.63 
 
 		 582 aa  239  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100681  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1320  TPR repeat-containing protein  84.55 
 
 		 123 aa  230  5e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000153469  hitchhiker  2.74516e-22 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 		 968 aa  229  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.89 
 
 		 1106 aa  211  4e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  27.53 
 
 		 1714 aa  209  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 		 718 aa  201  3.9999999999999996e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  28.25 
 
 		 585 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  28.9 
 
 		 1106 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 619 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.94 
 
 		 589 aa  198  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 		 789 aa  198  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  27.79 
 
 		 708 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 		 717 aa  194  6e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 		 627 aa  193  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 		 598 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 		 647 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  27.29 
 
 		 789 aa  192  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  25.36 
 
 		 626 aa  189  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 		 717 aa  188  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 		 713 aa  187  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.32 
 
 		 589 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00265  UDP-N-acetylglucosaminyltransferase (AFU_orthologue; AFUA_1G03380)  30.81 
 
 		 1596 aa  185  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0115382 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.66 
 
 		 529 aa  184  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  25.56 
 
 		 708 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  25.65 
 
 		 828 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.56 
 
 		 667 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  27.3 
 
 		 1415 aa  180  4.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  24.47 
 
 		 699 aa  178  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  26.25 
 
 		 715 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  25.16 
 
 		 828 aa  178  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 734 aa  176  9e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  24.92 
 
 		 780 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  24.92 
 
 		 780 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 		 633 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  26 
 
 		 754 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  25.81 
 
 		 596 aa  173  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  26.1 
 
 		 790 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 		 754 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  26.08 
 
 		 828 aa  171  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 595 aa  170  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  24.6 
 
 		 781 aa  169  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  24.23 
 
 		 779 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4222  glycosyltransferase TPR domain-containing protein  29.07 
 
 		 594 aa  168  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  26.3 
 
 		 833 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  25.9 
 
 		 824 aa  167  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  25.3 
 
 		 732 aa  166  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  25.3 
 
 		 776 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  24.96 
 
 		 776 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  24.96 
 
 		 776 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 		 633 aa  165  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  24.96 
 
 		 776 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.13 
 
 		 739 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2387  tetratricopeptide TPR_2  29.87 
 
 		 745 aa  165  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.625245  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>