More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1087 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 808 aa  1662    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  38.16 
 
 		 706 aa  461  9.999999999999999e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  35.07 
 
 		 3035 aa  443  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  33.29 
 
 		 4489 aa  424  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  33.91 
 
 		 1094 aa  413  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  31.8 
 
 		 3560 aa  404  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 		 1085 aa  391  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  30.59 
 
 		 909 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  29.74 
 
 		 816 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  28.96 
 
 		 732 aa  341  2.9999999999999998e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  32.62 
 
 		 618 aa  333  8e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 		 700 aa  332  2e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 		 750 aa  329  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  30.94 
 
 		 740 aa  327  7e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  29.62 
 
 		 761 aa  318  2e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 		 828 aa  316  9e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  29.04 
 
 		 789 aa  313  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 828 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  29.5 
 
 		 828 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  28.54 
 
 		 824 aa  307  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  33.28 
 
 		 654 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 		 667 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  29.64 
 
 		 739 aa  296  7e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  34.61 
 
 		 647 aa  290  6e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 833 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  28.52 
 
 		 732 aa  281  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  29.78 
 
 		 750 aa  280  5e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 		 754 aa  278  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  31.48 
 
 		 680 aa  275  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 660 aa  273  7e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 		 833 aa  272  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 		 754 aa  271  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  33.22 
 
 		 611 aa  266  8.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  39.17 
 
 		 492 aa  264  4.999999999999999e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  32.79 
 
 		 574 aa  263  6.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  34.84 
 
 		 569 aa  262  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  32.5 
 
 		 560 aa  258  3e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 		 632 aa  257  5e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.86 
 
 		 739 aa  254  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  40.11 
 
 		 459 aa  252  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  27.47 
 
 		 616 aa  250  7e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 		 708 aa  243  9e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7846  hypothetical protein  35.14 
 
 		 452 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346388 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.23 
 
 		 589 aa  242  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  28.67 
 
 		 708 aa  239  1e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 		 713 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.67 
 
 		 570 aa  238  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.11 
 
 		 739 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  26.99 
 
 		 968 aa  234  6e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20301  hypothetical protein  37.46 
 
 		 395 aa  230  6e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.236649 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 		 647 aa  230  7e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.29 
 
 		 742 aa  230  7e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  29.12 
 
 		 1714 aa  228  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  29.5 
 
 		 568 aa  228  4e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  25.73 
 
 		 789 aa  224  4e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  26.39 
 
 		 937 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  26.1 
 
 		 718 aa  221  5e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  33.74 
 
 		 637 aa  221  5e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4069  TPR repeat-containing protein  33.94 
 
 		 590 aa  220  6e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00017793  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3853  O-linked acetylglucosamine transferase  33.53 
 
 		 590 aa  219  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.05 
 
 		 1106 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 		 1106 aa  218  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  33.16 
 
 		 633 aa  218  5e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  31.29 
 
 		 598 aa  217  8e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  30.7 
 
 		 585 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 		 619 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.66 
 
 		 739 aa  214  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 672 aa  214  7.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  25.31 
 
 		 715 aa  212  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  28.55 
 
 		 627 aa  212  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.62 
 
 		 740 aa  211  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.33 
 
 		 589 aa  211  6e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  33.33 
 
 		 630 aa  210  8e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  33.86 
 
 		 566 aa  210  8e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 		 595 aa  209  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  25.93 
 
 		 790 aa  208  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  36.06 
 
 		 632 aa  208  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0359  hypothetical protein  32.21 
 
 		 657 aa  207  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224796  normal  0.0716049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  32.23 
 
 		 657 aa  203  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  27.39 
 
 		 699 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0256  hypothetical protein  31.58 
 
 		 719 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 		 796 aa  201  5e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2167  tetratricopeptide TPR_2  24.1 
 
 		 1014 aa  200  9e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1319  TPR repeat-containing protein  37.05 
 
 		 295 aa  200  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000490816  hitchhiker  8.5993e-22 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  27.26 
 
 		 626 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.75 
 
 		 790 aa  198  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 		 717 aa  197  7e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  26.44 
 
 		 717 aa  195  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  24.61 
 
 		 822 aa  192  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  27.4 
 
 		 797 aa  192  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 		 734 aa  191  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 		 779 aa  191  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  24.15 
 
 		 693 aa  190  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 		 780 aa  189  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  26.01 
 
 		 780 aa  189  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  26.19 
 
 		 1221 aa  188  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 		 750 aa  187  7e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  26.17 
 
 		 781 aa  183  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  23.8 
 
 		 837 aa  182  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  32.94 
 
 		 878 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>