More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3742 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  92.53 
 
 		 589 aa  1106    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 589 aa  1195    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  46.58 
 
 		 1106 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  47.76 
 
 		 1106 aa  463  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  46.53 
 
 		 585 aa  449  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  40.53 
 
 		 627 aa  400  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  37.41 
 
 		 1714 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  40.38 
 
 		 633 aa  384  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.62 
 
 		 667 aa  375  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  37.16 
 
 		 968 aa  366  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  36.96 
 
 		 708 aa  355  1e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  40.14 
 
 		 708 aa  351  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  38.75 
 
 		 937 aa  348  1e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  37.1 
 
 		 626 aa  346  8e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  38.64 
 
 		 789 aa  345  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  36.13 
 
 		 828 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  37.48 
 
 		 828 aa  332  8e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  37.48 
 
 		 828 aa  332  9e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 789 aa  329  8e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.31 
 
 		 529 aa  327  5e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  35.51 
 
 		 718 aa  325  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  35.57 
 
 		 754 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  33.92 
 
 		 717 aa  319  7.999999999999999e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  36.56 
 
 		 699 aa  318  1e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  34.58 
 
 		 1221 aa  318  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  34.1 
 
 		 717 aa  318  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  35.22 
 
 		 754 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.84 
 
 		 723 aa  313  7.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  34.81 
 
 		 790 aa  310  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  36.22 
 
 		 595 aa  310  5e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  34.18 
 
 		 732 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.98 
 
 		 790 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  36.05 
 
 		 833 aa  300  5e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  35.69 
 
 		 619 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  35.87 
 
 		 598 aa  298  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  35.65 
 
 		 833 aa  297  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  34.63 
 
 		 596 aa  295  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  34.34 
 
 		 824 aa  286  7e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  32.87 
 
 		 776 aa  286  7e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  32.87 
 
 		 776 aa  286  7e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  32.87 
 
 		 776 aa  286  7e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  32.87 
 
 		 821 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 		 633 aa  286  1.0000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  32.7 
 
 		 821 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  32.7 
 
 		 776 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  32.7 
 
 		 776 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  34.27 
 
 		 693 aa  283  9e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  31.03 
 
 		 797 aa  282  9e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 		 713 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 		 780 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  32.99 
 
 		 781 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  32.89 
 
 		 780 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  30.72 
 
 		 1143 aa  273  9e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 727 aa  272  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  33.21 
 
 		 822 aa  271  2.9999999999999997e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  32.34 
 
 		 647 aa  269  8.999999999999999e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  29.87 
 
 		 1116 aa  266  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 796 aa  264  3e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  31.16 
 
 		 779 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  36.24 
 
 		 734 aa  261  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.89 
 
 		 739 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 		 750 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  31.27 
 
 		 1415 aa  254  3e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  29.55 
 
 		 1144 aa  251  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 		 909 aa  249  1e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  33.63 
 
 		 700 aa  248  1e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  41.29 
 
 		 740 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0103  TPR repeat-containing protein  34.68 
 
 		 733 aa  246  9e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467133  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  35.19 
 
 		 552 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  31.54 
 
 		 715 aa  243  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  33.61 
 
 		 742 aa  238  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0605  tetratricopeptide domain-containing protein  30.46 
 
 		 553 aa  238  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.335277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 808 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  32.98 
 
 		 921 aa  234  5e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  35.45 
 
 		 739 aa  232  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  35.26 
 
 		 667 aa  232  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  26.66 
 
 		 816 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 		 647 aa  231  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 616 aa  230  5e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 739 aa  230  6e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.16 
 
 		 739 aa  229  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 		 974 aa  228  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 		 3035 aa  228  3e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  31.09 
 
 		 750 aa  226  7e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 		 3560 aa  224  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 		 1085 aa  219  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  30.42 
 
 		 654 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0114  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 724 aa  218  2e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.029745  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  29.58 
 
 		 1094 aa  218  4e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  30.87 
 
 		 680 aa  216  8e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  30.09 
 
 		 706 aa  216  9.999999999999999e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  22.47 
 
 		 632 aa  212  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  29.12 
 
 		 4489 aa  212  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  31.88 
 
 		 560 aa  209  9e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  35.42 
 
 		 632 aa  209  9e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2410  hypothetical protein  35.68 
 
 		 624 aa  209  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1874  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.35 
 
 		 793 aa  205  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  34.42 
 
 		 657 aa  205  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  35.41 
 
 		 633 aa  201  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  34.97 
 
 		 566 aa  199  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>