More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3854 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  68.28 
 
 		 717 aa  978    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 723 aa  1444    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  68.46 
 
 		 717 aa  983    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.86 
 
 		 1106 aa  386  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  40.34 
 
 		 1106 aa  357  5.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  38.28 
 
 		 626 aa  351  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  36.6 
 
 		 627 aa  350  6e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.42 
 
 		 589 aa  349  1e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  40 
 
 		 585 aa  336  7.999999999999999e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  40.27 
 
 		 796 aa  329  1.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.59 
 
 		 589 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  37.76 
 
 		 633 aa  325  3e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  37.11 
 
 		 619 aa  324  4e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  33.14 
 
 		 718 aa  323  9.000000000000001e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  36.89 
 
 		 598 aa  321  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  39.21 
 
 		 708 aa  319  9e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  32.7 
 
 		 821 aa  319  1e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  32.7 
 
 		 776 aa  319  1e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  32.7 
 
 		 776 aa  319  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  32.7 
 
 		 776 aa  319  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  32.56 
 
 		 821 aa  318  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 		 776 aa  317  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 		 776 aa  317  6e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  36.73 
 
 		 754 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  34 
 
 		 732 aa  313  7.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  31.59 
 
 		 790 aa  311  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  34.05 
 
 		 828 aa  310  5e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.56 
 
 		 667 aa  310  5.9999999999999995e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  36.5 
 
 		 595 aa  310  8e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  35.81 
 
 		 824 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  33.91 
 
 		 828 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  34.76 
 
 		 754 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  32.4 
 
 		 828 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  31.59 
 
 		 779 aa  302  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  35.24 
 
 		 789 aa  301  2e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  33.56 
 
 		 708 aa  301  4e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.04 
 
 		 790 aa  298  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 		 833 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  31.56 
 
 		 699 aa  298  3e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  38.15 
 
 		 833 aa  298  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.25 
 
 		 529 aa  292  1e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  36.86 
 
 		 789 aa  292  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  33.14 
 
 		 739 aa  292  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  30.44 
 
 		 780 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  30.44 
 
 		 780 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  34.75 
 
 		 822 aa  286  7e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  31.99 
 
 		 968 aa  283  9e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  34.27 
 
 		 781 aa  277  6e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  31.33 
 
 		 715 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  31.16 
 
 		 713 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  34.06 
 
 		 739 aa  275  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  33.87 
 
 		 727 aa  274  4.0000000000000004e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  30.85 
 
 		 1143 aa  271  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.76 
 
 		 739 aa  270  7e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  37.68 
 
 		 552 aa  268  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.94 
 
 		 742 aa  266  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  33.45 
 
 		 1221 aa  265  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  32.02 
 
 		 1415 aa  265  3e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  32.25 
 
 		 1714 aa  264  4e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  35.44 
 
 		 937 aa  263  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  32.42 
 
 		 797 aa  261  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  32.25 
 
 		 647 aa  259  9e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 		 734 aa  259  1e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.51 
 
 		 740 aa  257  7e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0605  tetratricopeptide domain-containing protein  31.62 
 
 		 553 aa  251  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.335277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  29.4 
 
 		 693 aa  247  6e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  34.82 
 
 		 1116 aa  242  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 1085 aa  240  8e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  35.04 
 
 		 921 aa  231  3e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  27.26 
 
 		 4489 aa  226  8e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  32.98 
 
 		 1144 aa  226  8e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  31.63 
 
 		 596 aa  226  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 3560 aa  222  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 		 1094 aa  220  7e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  29.53 
 
 		 974 aa  219  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 		 3035 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 		 633 aa  211  4e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  29.4 
 
 		 700 aa  210  8e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  25.92 
 
 		 909 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  25.93 
 
 		 816 aa  202  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 750 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  26.82 
 
 		 739 aa  193  8e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  25.61 
 
 		 761 aa  193  8e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  30.5 
 
 		 654 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  30.73 
 
 		 667 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  26.81 
 
 		 808 aa  184  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0103  TPR repeat-containing protein  30.12 
 
 		 733 aa  182  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467133  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 		 611 aa  182  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 		 706 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  28.47 
 
 		 680 aa  181  5.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  33.16 
 
 		 492 aa  179  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 		 750 aa  178  4e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 		 574 aa  176  9e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0114  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 		 724 aa  174  5e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.029745  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 		 616 aa  171  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 		 740 aa  171  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 		 647 aa  169  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 		 618 aa  169  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1874  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.75 
 
 		 793 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  29 
 
 		 560 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>