More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0825 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 739 aa  1506    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  49.48 
 
 		 750 aa  684    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  50.44 
 
 		 909 aa  639    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  44.88 
 
 		 816 aa  640    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  40.98 
 
 		 1094 aa  500  1e-140  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  41.16 
 
 		 4489 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  37.91 
 
 		 3035 aa  427  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  37.11 
 
 		 3560 aa  422  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  32.55 
 
 		 1085 aa  402  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  36.2 
 
 		 761 aa  397  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  33.14 
 
 		 700 aa  395  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  33.39 
 
 		 654 aa  382  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  33.84 
 
 		 732 aa  376  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  61.87 
 
 		 685 aa  366  1e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  61.26 
 
 		 637 aa  360  4e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  33.96 
 
 		 618 aa  352  2e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  59.34 
 
 		 681 aa  346  8e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 		 667 aa  340  7e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  56.48 
 
 		 362 aa  340  8e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  35.85 
 
 		 660 aa  332  1e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  51.45 
 
 		 612 aa  328  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  58.08 
 
 		 865 aa  328  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  35.22 
 
 		 611 aa  328  3e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 740 aa  323  7e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  30.42 
 
 		 706 aa  318  2e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  53.23 
 
 		 603 aa  318  3e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  59.21 
 
 		 583 aa  315  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 		 647 aa  309  1.0000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 616 aa  302  1e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20301  hypothetical protein  45.04 
 
 		 395 aa  300  5e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.236649 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  29.04 
 
 		 808 aa  298  2e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.55 
 
 		 1106 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 		 750 aa  281  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 		 968 aa  282  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  29.64 
 
 		 680 aa  278  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 		 632 aa  277  5e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 		 1106 aa  275  3e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  31.6 
 
 		 569 aa  268  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  34.75 
 
 		 459 aa  263  6e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  30.06 
 
 		 560 aa  263  8e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  34.17 
 
 		 492 aa  261  3e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  26.66 
 
 		 718 aa  261  5.0000000000000005e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 754 aa  249  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1319  TPR repeat-containing protein  45.2 
 
 		 295 aa  248  4e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000490816  hitchhiker  8.5993e-22 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 		 574 aa  247  4.9999999999999997e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 		 789 aa  244  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  27.06 
 
 		 708 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 		 754 aa  238  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4069  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 590 aa  237  6e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00017793  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  24.75 
 
 		 732 aa  237  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  25.88 
 
 		 708 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3853  O-linked acetylglucosamine transferase  29.59 
 
 		 590 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  29.6 
 
 		 585 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.92 
 
 		 589 aa  231  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 		 824 aa  230  8e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 		 627 aa  230  8e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  26.1 
 
 		 828 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  63.58 
 
 		 430 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  26.03 
 
 		 568 aa  228  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  25.96 
 
 		 715 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 828 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  28.62 
 
 		 1714 aa  228  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  26.68 
 
 		 828 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  26.86 
 
 		 626 aa  224  6e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  30.39 
 
 		 657 aa  223  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0359  hypothetical protein  31.5 
 
 		 657 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224796  normal  0.0716049 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  56.57 
 
 		 437 aa  223  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.3 
 
 		 589 aa  221  5e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0815  TPR repeat-containing protein  55.67 
 
 		 235 aa  218  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0605859  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  24.47 
 
 		 833 aa  217  7e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7846  hypothetical protein  31.46 
 
 		 452 aa  216  9e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346388 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 		 672 aa  216  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  27.98 
 
 		 632 aa  216  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  44.23 
 
 		 780 aa  215  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  24.96 
 
 		 713 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 		 647 aa  212  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 		 633 aa  212  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.64 
 
 		 570 aa  211  5e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 		 598 aa  209  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  32.77 
 
 		 566 aa  209  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  27.59 
 
 		 790 aa  209  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 		 619 aa  208  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  24.81 
 
 		 734 aa  207  7e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.26 
 
 		 790 aa  206  9e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.56 
 
 		 667 aa  205  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 		 750 aa  205  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  45.88 
 
 		 594 aa  205  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  30.34 
 
 		 630 aa  204  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 		 595 aa  204  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  25.58 
 
 		 1154 aa  202  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.05 
 
 		 529 aa  201  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  46.26 
 
 		 529 aa  201  3e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  48.9 
 
 		 878 aa  201  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  23.41 
 
 		 789 aa  201  6e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  31.94 
 
 		 637 aa  200  7e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 796 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18191  hypothetical protein  49.75 
 
 		 425 aa  197  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.888115 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  24.11 
 
 		 699 aa  197  6e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  48.02 
 
 		 810 aa  197  7e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  24.71 
 
 		 937 aa  196  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>