More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0815 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0815  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
235 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0605859  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  61.62 
 
 
681 aa  239  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  62.63 
 
 
637 aa  236  2e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  60.48 
 
 
685 aa  231  9e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  54.76 
 
 
739 aa  228  9e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  51.95 
 
 
909 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  59.11 
 
 
437 aa  224  6e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  57.62 
 
 
865 aa  221  6e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  51.82 
 
 
362 aa  214  7e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  49.24 
 
 
603 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  56.06 
 
 
612 aa  209  3e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  58.2 
 
 
583 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  52.53 
 
 
750 aa  206  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  63.27 
 
 
529 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  54.04 
 
 
816 aa  202  5e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  63.47 
 
 
430 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  61.64 
 
 
514 aa  175  6e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18191  hypothetical protein  55.77 
 
 
425 aa  169  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.888115 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16741  hypothetical protein  57.05 
 
 
467 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00431  hypothetical protein  53.66 
 
 
435 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00421  hypothetical protein  52.53 
 
 
484 aa  158  8e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.391795  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  41.78 
 
 
780 aa  156  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  43.78 
 
 
594 aa  146  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  45.56 
 
 
502 aa  137  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1366  TPR repeat-containing protein  45.91 
 
 
402 aa  133  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.104941  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0817  TPR repeat-containing protein  62.86 
 
 
661 aa  132  5e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.975986  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  32.87 
 
 
323 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.78 
 
 
810 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  36.62 
 
 
594 aa  128  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  42.6 
 
 
494 aa  128  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  42.22 
 
 
878 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15821  hypothetical protein  54.24 
 
 
482 aa  122  5e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  37.62 
 
 
864 aa  122  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  34.74 
 
 
1094 aa  118  7e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  38.92 
 
 
622 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  35.2 
 
 
725 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 
646 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  34.58 
 
 
837 aa  112  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  36.09 
 
 
649 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  36.09 
 
 
649 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  35.59 
 
 
714 aa  111  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  34.16 
 
 
750 aa  109  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  34.66 
 
 
714 aa  108  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  32.63 
 
 
875 aa  108  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  34.08 
 
 
764 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  37.97 
 
 
833 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  37.29 
 
 
1676 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.63 
 
 
632 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  35.98 
 
 
828 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  35.98 
 
 
828 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  35.1 
 
 
1737 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  32.16 
 
 
732 aa  102  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16401  hypothetical protein  35.82 
 
 
779 aa  102  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  37.82 
 
 
833 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  40.28 
 
 
754 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  39.39 
 
 
1486 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  33.99 
 
 
3301 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  32.6 
 
 
795 aa  99.4  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  39.58 
 
 
754 aa  98.6  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  35.5 
 
 
3172 aa  98.6  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 
3145 aa  98.2  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  36.71 
 
 
4489 aa  98.2  9e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  42.58 
 
 
936 aa  98.2  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00441  hypothetical protein  48.96 
 
 
653 aa  96.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  34.78 
 
 
587 aa  95.9  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  32.22 
 
 
654 aa  95.9  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 
3035 aa  95.1  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  30.1 
 
 
733 aa  94.4  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  32.62 
 
 
448 aa  94.4  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 
608 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  34.24 
 
 
927 aa  94  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  32.93 
 
 
395 aa  93.6  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  30.34 
 
 
887 aa  93.6  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 
639 aa  93.2  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  34.21 
 
 
573 aa  93.6  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  34.67 
 
 
472 aa  92.4  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  34.76 
 
 
217 aa  92.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  33.12 
 
 
542 aa  91.7  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  38.3 
 
 
545 aa  91.7  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  36.96 
 
 
824 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  31.82 
 
 
1007 aa  90.5  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 
620 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  40.15 
 
 
3560 aa  90.9  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  30.98 
 
 
615 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 
1827 aa  90.1  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  28.11 
 
 
718 aa  89.7  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 
601 aa  89.7  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  33.12 
 
 
1694 aa  89.4  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 
602 aa  88.6  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  28.38 
 
 
620 aa  88.6  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0788  TPR repeat-containing protein  34.83 
 
 
779 aa  88.2  9e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.156743  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  35.37 
 
 
828 aa  88.2  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  31.89 
 
 
535 aa  88.2  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  33.92 
 
 
847 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  36.5 
 
 
697 aa  87  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  31.45 
 
 
762 aa  86.7  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  37.86 
 
 
732 aa  85.9  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  27.51 
 
 
543 aa  86.3  4e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 
635 aa  85.9  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  41.67 
 
 
661 aa  85.9  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>