More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_16401 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_16401  hypothetical protein  100 
 
 
779 aa  1536    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0788  TPR repeat-containing protein  96.79 
 
 
779 aa  1438    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.156743  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  41.44 
 
 
780 aa  616  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  37.33 
 
 
865 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  33.59 
 
 
1676 aa  388  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0817  TPR repeat-containing protein  36.27 
 
 
661 aa  376  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.975986  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1364  SAM-binding motif-containing protein  41.46 
 
 
580 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.460424  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02771  hypothetical protein  36.19 
 
 
704 aa  362  2e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.608629 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00441  hypothetical protein  36.77 
 
 
653 aa  347  4e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2293  hypothetical protein  34.07 
 
 
631 aa  337  5e-91  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0853546 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  29.16 
 
 
875 aa  260  6e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  31.01 
 
 
594 aa  129  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
685 aa  124  7e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 
739 aa  119  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  32.2 
 
 
816 aa  118  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  33.2 
 
 
594 aa  118  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 
909 aa  116  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  31.8 
 
 
362 aa  115  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  32.06 
 
 
612 aa  111  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 
323 aa  110  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  32.6 
 
 
637 aa  110  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  33.47 
 
 
681 aa  108  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.91 
 
 
402 aa  107  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  0.0000000000741696 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 
750 aa  105  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1413  methyltransferase type 11  29.07 
 
 
402 aa  102  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195836  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  31.46 
 
 
390 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 
583 aa  100  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  26.17 
 
 
414 aa  100  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.64 
 
 
810 aa  99  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 
878 aa  98.2  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  30.47 
 
 
603 aa  97.4  8e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0372  methyltransferase type 12  29.39 
 
 
441 aa  97.4  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  26.61 
 
 
626 aa  95.9  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 
614 aa  95.9  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  25.4 
 
 
626 aa  93.6  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 
3560 aa  93.6  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  26.21 
 
 
614 aa  92.8  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  26.21 
 
 
626 aa  93.2  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 
614 aa  92.8  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  26.71 
 
 
399 aa  92.8  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  26.21 
 
 
614 aa  92.8  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25.62 
 
 
725 aa  92.4  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3000  Methyltransferase type 12  25.28 
 
 
370 aa  91.7  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0815  TPR repeat-containing protein  35.82 
 
 
235 aa  91.3  6e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0605859  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  33.85 
 
 
437 aa  90.9  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
4489 aa  90.9  9e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.84 
 
 
1022 aa  90.5  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3879  Methyltransferase type 12  31.72 
 
 
359 aa  90.1  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1065  methyltransferase type 12  32.24 
 
 
360 aa  89.7  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18191  hypothetical protein  31.95 
 
 
425 aa  89.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.888115 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  26.79 
 
 
837 aa  89.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.2 
 
 
818 aa  89.7  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2206  methyltransferase type 12  30.66 
 
 
403 aa  89.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  36.31 
 
 
529 aa  88.6  4e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1462  Methyltransferase type 12  26.89 
 
 
434 aa  88.6  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3967  Methyltransferase type 12  31.18 
 
 
359 aa  88.2  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000336938 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  27.27 
 
 
395 aa  88.2  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1999  Methyltransferase type 11  29.71 
 
 
444 aa  87.8  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  30.88 
 
 
400 aa  87.8  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  30.88 
 
 
400 aa  87  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
3035 aa  87.4  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4260  methyltransferase type 12  32.07 
 
 
441 aa  87.4  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12103  hypothetical protein  26.92 
 
 
407 aa  86.3  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00110715  normal  0.946541 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.76 
 
 
784 aa  86.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  29.63 
 
 
399 aa  86.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25 
 
 
1056 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.39 
 
 
632 aa  85.1  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  30.39 
 
 
795 aa  85.1  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 
649 aa  84.7  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  28.14 
 
 
833 aa  84.7  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 
615 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1047  hypothetical protein  23.41 
 
 
360 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  29.74 
 
 
936 aa  83.2  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0481  hypothetical protein  28.23 
 
 
398 aa  83.2  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.874719  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 
614 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 
1827 aa  81.6  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  23.23 
 
 
573 aa  81.6  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27 
 
 
3145 aa  81.6  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  33.08 
 
 
542 aa  81.3  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.51 
 
 
1737 aa  80.9  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  32.24 
 
 
514 aa  80.5  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  24.51 
 
 
1094 aa  80.5  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  25 
 
 
715 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  28.51 
 
 
430 aa  79.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 
670 aa  79.7  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 
1085 aa  79.7  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.12 
 
 
988 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  23.97 
 
 
637 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2195  hypothetical protein  25.93 
 
 
400 aa  79.3  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04751  methyltransferase  25.93 
 
 
407 aa  77.8  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  27.78 
 
 
622 aa  77.8  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  25.12 
 
 
636 aa  77.4  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  29.89 
 
 
764 aa  76.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0046  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  21.04 
 
 
447 aa  77  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.404725  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  27.78 
 
 
653 aa  76.6  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
653 aa  76.6  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  30.81 
 
 
864 aa  76.6  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  25.12 
 
 
612 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 
635 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  24.65 
 
 
639 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>