More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_16741 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_16741  hypothetical protein  100 
 
 
467 aa  954    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  57.73 
 
 
637 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  55.84 
 
 
681 aa  219  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  55.67 
 
 
603 aa  216  5e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  29.74 
 
 
573 aa  207  3e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  53.3 
 
 
612 aa  205  2e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  53.27 
 
 
816 aa  204  3e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  55.05 
 
 
430 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  53.81 
 
 
685 aa  197  3e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  49.3 
 
 
583 aa  196  7e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  49.75 
 
 
362 aa  196  8.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  52.08 
 
 
865 aa  196  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  51.03 
 
 
750 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  41.9 
 
 
739 aa  185  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  27.85 
 
 
535 aa  184  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  46.12 
 
 
909 aa  183  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18191  hypothetical protein  50.54 
 
 
425 aa  180  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.888115 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  52.1 
 
 
514 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0815  TPR repeat-containing protein  57.93 
 
 
235 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0605859  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00431  hypothetical protein  48.3 
 
 
435 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  42.13 
 
 
437 aa  152  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00421  hypothetical protein  42.72 
 
 
484 aa  149  9e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.391795  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15821  hypothetical protein  50 
 
 
482 aa  147  5e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2678  TPR repeat-containing protein  25.92 
 
 
480 aa  142  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  27.95 
 
 
594 aa  139  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0817  TPR repeat-containing protein  51.37 
 
 
661 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.975986  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1366  TPR repeat-containing protein  40 
 
 
402 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.104941  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  52.56 
 
 
529 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  28.84 
 
 
936 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  39.63 
 
 
780 aa  129  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00441  hypothetical protein  51.22 
 
 
653 aa  127  6e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  45.64 
 
 
502 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  23.55 
 
 
597 aa  121  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  41.25 
 
 
594 aa  117  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  44.3 
 
 
494 aa  116  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  42.06 
 
 
864 aa  107  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  32.9 
 
 
875 aa  99.8  9e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  33.99 
 
 
3145 aa  99.8  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  35.09 
 
 
789 aa  99.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.48 
 
 
3035 aa  97.4  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 
503 aa  96.7  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  39.47 
 
 
878 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.41 
 
 
810 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 
732 aa  94.7  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 
323 aa  93.6  7e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  29.09 
 
 
1676 aa  92.8  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  38.93 
 
 
566 aa  92.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  38.21 
 
 
622 aa  93.2  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  30.24 
 
 
725 aa  92.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  36.48 
 
 
217 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 
833 aa  91.3  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 
363 aa  90.9  5e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0817  hypothetical protein  29 
 
 
467 aa  89.7  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00165108  unclonable  0.0000072103 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  32.79 
 
 
714 aa  89.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  38.21 
 
 
764 aa  89.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  42.2 
 
 
828 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  30.32 
 
 
828 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  38.18 
 
 
714 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 
754 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  39.82 
 
 
754 aa  88.2  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  30.87 
 
 
718 aa  87.8  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.05 
 
 
632 aa  87.4  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 
595 aa  87.4  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  33.75 
 
 
4489 aa  87.4  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  30.29 
 
 
833 aa  87  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 
1005 aa  86.7  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  31.1 
 
 
542 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 
3560 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  30.52 
 
 
732 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  36.11 
 
 
1094 aa  85.5  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  29.44 
 
 
837 aa  85.1  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  27.56 
 
 
733 aa  84.7  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  32.72 
 
 
715 aa  84.7  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  35.76 
 
 
661 aa  84.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  29.68 
 
 
523 aa  84  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 
667 aa  83.6  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 
608 aa  83.2  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  30.9 
 
 
824 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3268  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 
441 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
505 aa  83.2  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2853  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.19 
 
 
441 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0260503 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1736  glycosyl transferase family 2  38.46 
 
 
392 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  29.56 
 
 
725 aa  82  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 
828 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 
1827 aa  82.4  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  34.17 
 
 
649 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  30.73 
 
 
561 aa  82.4  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  34.17 
 
 
649 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  31.69 
 
 
646 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02816  TPR domain protein  25.69 
 
 
604 aa  82.4  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.36083  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  37.7 
 
 
452 aa  81.6  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.67 
 
 
1034 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  34.62 
 
 
739 aa  80.5  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  30.24 
 
 
561 aa  80.5  0.00000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  30.99 
 
 
795 aa  80.1  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1760  glycosyl transferase family 2  37.61 
 
 
392 aa  80.1  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 
654 aa  80.1  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  30.59 
 
 
619 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  34.62 
 
 
739 aa  79.7  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  33.6 
 
 
1486 aa  79.7  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>