More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_24081 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  100 
 
 
764 aa  1564    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  94.95 
 
 
622 aa  572  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  44.86 
 
 
725 aa  312  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  39.26 
 
 
878 aa  270  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  43.11 
 
 
681 aa  265  2e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.99 
 
 
810 aa  266  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  41.67 
 
 
909 aa  255  3e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  39.07 
 
 
685 aa  233  9e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  45.74 
 
 
637 aa  229  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  34.99 
 
 
3145 aa  228  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  37.21 
 
 
3035 aa  225  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  35.65 
 
 
1094 aa  223  9e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.87 
 
 
632 aa  221  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  35.52 
 
 
816 aa  221  3e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  33.97 
 
 
4489 aa  220  7e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  34.54 
 
 
1694 aa  218  2.9999999999999998e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  45.08 
 
 
865 aa  216  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  38.06 
 
 
3560 aa  210  7e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  37.97 
 
 
362 aa  207  7e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  33.7 
 
 
828 aa  204  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  33.06 
 
 
733 aa  204  7e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  33.42 
 
 
828 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  39.03 
 
 
875 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  35.33 
 
 
505 aa  198  4.0000000000000005e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  29.89 
 
 
1676 aa  194  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  31.68 
 
 
1737 aa  192  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  43.81 
 
 
603 aa  191  4e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.71 
 
 
1022 aa  191  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  39.15 
 
 
750 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  31.78 
 
 
3301 aa  189  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  32.79 
 
 
3172 aa  189  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  33.94 
 
 
649 aa  186  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  33.72 
 
 
462 aa  183  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  38.99 
 
 
587 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  35.97 
 
 
739 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  30.12 
 
 
833 aa  181  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  31.44 
 
 
824 aa  180  9e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  30.52 
 
 
828 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.46 
 
 
818 aa  179  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.62 
 
 
1056 aa  178  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  31.44 
 
 
714 aa  177  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
789 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.54 
 
 
689 aa  175  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  31.23 
 
 
543 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.16 
 
 
988 aa  175  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.27 
 
 
784 aa  174  7.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.04 
 
 
1056 aa  173  9e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  31.59 
 
 
732 aa  172  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  31.09 
 
 
626 aa  172  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  32.64 
 
 
714 aa  171  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 
1276 aa  171  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  28.38 
 
 
676 aa  170  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  34.12 
 
 
718 aa  169  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  32.93 
 
 
1486 aa  169  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 
754 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  36.04 
 
 
612 aa  168  4e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  30.79 
 
 
626 aa  168  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  30.79 
 
 
614 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  28.53 
 
 
936 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 
955 aa  166  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  29.75 
 
 
887 aa  166  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 
597 aa  166  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  30.5 
 
 
626 aa  165  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  30.5 
 
 
614 aa  165  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  46.84 
 
 
583 aa  165  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  31.39 
 
 
927 aa  165  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 
573 aa  165  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  30.5 
 
 
614 aa  165  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  30.5 
 
 
614 aa  165  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  33.71 
 
 
661 aa  164  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.66 
 
 
397 aa  162  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  32.15 
 
 
761 aa  162  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  28.93 
 
 
832 aa  161  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  38.25 
 
 
750 aa  161  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 
615 aa  160  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 
639 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  32.45 
 
 
935 aa  159  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 
847 aa  158  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0116  TPR repeat-containing protein  35.51 
 
 
289 aa  158  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  27.81 
 
 
837 aa  157  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  30.5 
 
 
614 aa  157  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 
602 aa  157  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  31.83 
 
 
706 aa  157  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  28.61 
 
 
620 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  28.79 
 
 
594 aa  155  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.92 
 
 
707 aa  154  7e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  36.16 
 
 
340 aa  154  8e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  29.58 
 
 
620 aa  154  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  31.52 
 
 
1252 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  31.52 
 
 
1252 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  30.94 
 
 
4079 aa  152  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 
754 aa  150  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  34.41 
 
 
594 aa  151  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  34.51 
 
 
535 aa  150  7e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  30.09 
 
 
601 aa  150  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 
637 aa  150  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 
612 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 
636 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  31.37 
 
 
321 aa  150  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 
448 aa  149  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>