More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1172 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  27.55 
 
 
1979 aa  727    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
4079 aa  8217    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  37.4 
 
 
1694 aa  907    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  34.14 
 
 
927 aa  499  1e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  37.11 
 
 
1276 aa  456  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 
1069 aa  419  9.999999999999999e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.27 
 
 
2240 aa  394  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  27.7 
 
 
1138 aa  391  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 
1049 aa  380  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 
543 aa  322  1e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.81 
 
 
1056 aa  320  3e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  32.28 
 
 
878 aa  314  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  32.72 
 
 
602 aa  313  2.9999999999999997e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  25.58 
 
 
1056 aa  311  2.0000000000000002e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.51 
 
 
1056 aa  308  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25.54 
 
 
1676 aa  306  6.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.65 
 
 
1022 aa  299  7e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  25.37 
 
 
1067 aa  295  2e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  32.16 
 
 
562 aa  292  1e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.31 
 
 
988 aa  277  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  27.67 
 
 
1737 aa  276  5.000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.1 
 
 
810 aa  275  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  27.59 
 
 
1013 aa  261  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0626  tetratricopeptide TPR_2  21.93 
 
 
2059 aa  259  1.0000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00762464 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  30.37 
 
 
564 aa  257  3e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  23.99 
 
 
1297 aa  250  4.9999999999999997e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  29.24 
 
 
634 aa  235  1e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 
617 aa  234  3e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.5 
 
 
818 aa  233  7e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  24.3 
 
 
804 aa  226  8e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 
750 aa  225  9.999999999999999e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.6 
 
 
784 aa  226  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  30.71 
 
 
576 aa  221  2.9999999999999998e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.02 
 
 
784 aa  220  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  20.72 
 
 
3172 aa  216  5.999999999999999e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  26.62 
 
 
635 aa  215  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  29.72 
 
 
605 aa  214  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  33.84 
 
 
465 aa  212  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  24.39 
 
 
2262 aa  212  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.25 
 
 
707 aa  211  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 
687 aa  210  4e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  29.4 
 
 
591 aa  208  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 
711 aa  207  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  29.32 
 
 
462 aa  207  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  35.36 
 
 
1094 aa  204  1.9999999999999998e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  21.3 
 
 
3301 aa  204  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 
955 aa  204  3.9999999999999996e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  33.25 
 
 
740 aa  202  9e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  32.71 
 
 
4489 aa  202  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  33.73 
 
 
730 aa  199  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0678  extracellular ligand-binding receptor  23.1 
 
 
1073 aa  199  1e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  33.99 
 
 
1276 aa  198  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 
486 aa  197  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0420  TPR-domain containing protein  22.82 
 
 
791 aa  197  5e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  31.43 
 
 
573 aa  196  6e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  35.8 
 
 
397 aa  195  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 
366 aa  194  4e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  31.4 
 
 
706 aa  191  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  31.02 
 
 
935 aa  187  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  30.12 
 
 
467 aa  184  2.9999999999999997e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  31.58 
 
 
706 aa  183  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.81 
 
 
632 aa  183  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 
425 aa  182  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 
594 aa  181  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 
3035 aa  181  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  30.05 
 
 
745 aa  180  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  25.04 
 
 
1421 aa  179  8e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 
1192 aa  179  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  37.72 
 
 
344 aa  177  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  25.71 
 
 
643 aa  177  3.9999999999999995e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  29.05 
 
 
436 aa  177  5e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  24.01 
 
 
887 aa  174  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 
450 aa  173  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  34.93 
 
 
1007 aa  172  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 
414 aa  171  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  23.05 
 
 
2262 aa  170  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  29.55 
 
 
725 aa  170  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  28.08 
 
 
649 aa  169  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  22.93 
 
 
1486 aa  168  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  43.98 
 
 
560 aa  167  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 
505 aa  164  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  31.72 
 
 
329 aa  164  2e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 
589 aa  164  3e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  34.15 
 
 
292 aa  164  4e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  37.4 
 
 
512 aa  164  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  30.72 
 
 
3560 aa  163  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  28.13 
 
 
909 aa  162  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  23.2 
 
 
1213 aa  161  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  23.5 
 
 
1154 aa  160  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 
747 aa  160  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  27.24 
 
 
391 aa  160  5.0000000000000005e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  28.99 
 
 
626 aa  160  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  25.47 
 
 
565 aa  159  7e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2796  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 
621 aa  159  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  33.45 
 
 
623 aa  159  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 
446 aa  159  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
402 aa  158  2e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  31.98 
 
 
662 aa  157  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1733  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.36 
 
 
538 aa  154  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.020269 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.23 
 
 
466 aa  154  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>