More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0675 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
344 aa  685    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  78.25 
 
 
602 aa  544  1e-154  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  54.46 
 
 
543 aa  325  9e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  41.58 
 
 
1276 aa  235  6e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  43.84 
 
 
1694 aa  232  8.000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  47.18 
 
 
573 aa  231  1e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  39.93 
 
 
4489 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  50 
 
 
512 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  36.39 
 
 
562 aa  199  5e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  38.62 
 
 
927 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.52 
 
 
707 aa  193  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  34.81 
 
 
711 aa  189  5e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.49 
 
 
784 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  35.19 
 
 
397 aa  182  6e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 
4079 aa  179  8e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  38.68 
 
 
1138 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  35.37 
 
 
329 aa  177  2e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  35.71 
 
 
1007 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  34.47 
 
 
1979 aa  170  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  30.59 
 
 
740 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  34.42 
 
 
3035 aa  167  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  35.32 
 
 
3560 aa  163  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  31.83 
 
 
576 aa  162  6e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 
366 aa  159  5e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  33.21 
 
 
1094 aa  159  9e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  32.86 
 
 
1276 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.43 
 
 
730 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 
1192 aa  155  9e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  44.69 
 
 
560 aa  153  5e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  33.11 
 
 
745 aa  151  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  35.19 
 
 
279 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  30.74 
 
 
465 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 
955 aa  145  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.96 
 
 
292 aa  144  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 
617 aa  143  5e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  31.29 
 
 
564 aa  142  7e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.62 
 
 
784 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  33.74 
 
 
409 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 
750 aa  140  3e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  30.38 
 
 
409 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.21 
 
 
818 aa  139  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  29.17 
 
 
635 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 
662 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  29.18 
 
 
1069 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  30.84 
 
 
436 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.62 
 
 
810 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 
1049 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  36.24 
 
 
523 aa  134  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.62 
 
 
878 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  33.7 
 
 
409 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.18 
 
 
632 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 
414 aa  132  9e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 
591 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  36.27 
 
 
244 aa  130  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  29.37 
 
 
648 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  30.26 
 
 
833 aa  130  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  33.6 
 
 
398 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  36.13 
 
 
352 aa  129  9.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.39 
 
 
1056 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.25 
 
 
296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 
761 aa  127  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  37.91 
 
 
202 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 
935 aa  126  5e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1476  TPR repeat-containing protein  36.02 
 
 
226 aa  125  9e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818932  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  33.18 
 
 
417 aa  124  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  29.3 
 
 
1013 aa  122  7e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 
634 aa  122  7e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 
393 aa  122  7e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.55 
 
 
988 aa  122  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  28.42 
 
 
1737 aa  122  9e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  29 
 
 
314 aa  122  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 
395 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.68 
 
 
1022 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.63 
 
 
297 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.63 
 
 
297 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  36 
 
 
623 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  28.62 
 
 
375 aa  119  6e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  32.59 
 
 
245 aa  119  7e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.78 
 
 
1056 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  35.21 
 
 
523 aa  118  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 
804 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 
1121 aa  117  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  31.03 
 
 
615 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
356 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 
747 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 
574 aa  116  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.71 
 
 
471 aa  116  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 
1827 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  27.96 
 
 
706 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  28.43 
 
 
1056 aa  114  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  28.09 
 
 
393 aa  113  5e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  25.49 
 
 
626 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 
713 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0216  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 
296 aa  112  9e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  25.55 
 
 
462 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 
466 aa  110  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  29.39 
 
 
687 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1311  hypothetical protein  29.08 
 
 
331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  26.33 
 
 
620 aa  109  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>