More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3643 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 		 4079 aa  694    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 1979 aa  3980    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  32.02 
 
 		 1694 aa  653    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  35.24 
 
 		 1276 aa  426  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  28.84 
 
 		 927 aa  388  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  26.48 
 
 		 1138 aa  329  4.0000000000000003e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  37.68 
 
 		 543 aa  321  7e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 		 1069 aa  307  2.0000000000000002e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  34.81 
 
 		 602 aa  306  3.0000000000000004e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  25.11 
 
 		 1049 aa  287  1.0000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  30.07 
 
 		 562 aa  284  2e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 		 878 aa  259  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.01 
 
 		 2240 aa  246  3e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  28.79 
 
 		 564 aa  244  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  26.24 
 
 		 1056 aa  237  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  23.38 
 
 		 1067 aa  236  3e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.72 
 
 		 1056 aa  235  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.32 
 
 		 1056 aa  231  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  27.49 
 
 		 1013 aa  230  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.03 
 
 		 988 aa  230  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 784 aa  228  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.52 
 
 		 810 aa  227  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.29 
 
 		 1022 aa  221  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  32.75 
 
 		 573 aa  219  5e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  30.07 
 
 		 635 aa  216  3.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0626  tetratricopeptide TPR_2  21.27 
 
 		 2059 aa  215  5.999999999999999e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00762464 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  22.75 
 
 		 1297 aa  209  5e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.11 
 
 		 818 aa  207  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  31.74 
 
 		 4489 aa  204  9.999999999999999e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.22 
 
 		 730 aa  201  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.56 
 
 		 397 aa  201  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  27.39 
 
 		 617 aa  201  2.0000000000000003e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 750 aa  199  3e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 		 591 aa  200  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 465 aa  197  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 		 711 aa  196  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  27.06 
 
 		 576 aa  195  7e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.52 
 
 		 1737 aa  194  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  24.57 
 
 		 1676 aa  194  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  25.12 
 
 		 687 aa  193  4e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  29.02 
 
 		 634 aa  191  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 		 935 aa  187  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.71 
 
 		 3035 aa  187  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 		 804 aa  187  2.0000000000000003e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  27.86 
 
 		 462 aa  185  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.73 
 
 		 784 aa  185  7e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 		 3172 aa  185  7e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 366 aa  184  1e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 955 aa  182  5.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.13 
 
 		 707 aa  180  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  23.51 
 
 		 1421 aa  181  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 1192 aa  176  3.9999999999999995e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  34.33 
 
 		 329 aa  176  5e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  22.73 
 
 		 605 aa  174  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 1094 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  29.37 
 
 		 745 aa  168  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  35.86 
 
 		 344 aa  166  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  29.53 
 
 		 1276 aa  166  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  27.9 
 
 		 740 aa  165  8.000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  33.21 
 
 		 1007 aa  162  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.21 
 
 		 292 aa  156  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.05 
 
 		 632 aa  156  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  27.29 
 
 		 436 aa  155  7e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  36.02 
 
 		 417 aa  155  8e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 		 467 aa  153  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  30.72 
 
 		 626 aa  153  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 		 450 aa  152  6e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  31.73 
 
 		 398 aa  151  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  26.4 
 
 		 936 aa  150  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 		 3560 aa  150  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  24.01 
 
 		 887 aa  149  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  26.22 
 
 		 425 aa  149  4.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  23.52 
 
 		 643 aa  149  6e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 		 505 aa  148  9e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  29.34 
 
 		 356 aa  147  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  23.91 
 
 		 486 aa  146  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 		 649 aa  145  7e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  30.27 
 
 		 314 aa  144  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  29.12 
 
 		 409 aa  143  3e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  29.15 
 
 		 626 aa  143  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 		 747 aa  142  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  29.15 
 
 		 614 aa  142  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  29 
 
 		 761 aa  141  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  28.84 
 
 		 615 aa  141  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  28.84 
 
 		 626 aa  140  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 		 523 aa  140  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  24.13 
 
 		 594 aa  140  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  28.84 
 
 		 614 aa  139  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  26.17 
 
 		 519 aa  139  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  28.84 
 
 		 614 aa  139  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  28.84 
 
 		 614 aa  139  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  26.68 
 
 		 414 aa  139  5e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  28.21 
 
 		 620 aa  139  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  31.6 
 
 		 623 aa  139  8e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 512 aa  138  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  35.68 
 
 		 699 aa  137  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0420  TPR-domain containing protein  22.07 
 
 		 791 aa  136  3.9999999999999996e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  29.39 
 
 		 612 aa  135  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 		 409 aa  135  6e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  24.88 
 
 		 1213 aa  135  6.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>