More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0157 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 465 aa  931    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.95 
 
 		 465 aa  317  3e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2065  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.58 
 
 		 465 aa  310  4e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.145613  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  37.47 
 
 		 465 aa  310  4e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  38.34 
 
 		 435 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  38.13 
 
 		 471 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.32 
 
 		 466 aa  300  4e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  34.63 
 
 		 466 aa  286  7e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  37.6 
 
 		 1694 aa  269  7e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  35.38 
 
 		 1276 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  31.45 
 
 		 927 aa  249  9e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4159  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 		 467 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004642 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 		 543 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  31 
 
 		 468 aa  239  8e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 		 878 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.41 
 
 		 810 aa  227  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0003  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 		 466 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  33.84 
 
 		 4079 aa  212  1e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 		 562 aa  212  1e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1475  TPR repeat-containing protein  31.41 
 
 		 467 aa  207  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  31.56 
 
 		 602 aa  204  4e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  28.97 
 
 		 1979 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  29.58 
 
 		 1049 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  28.26 
 
 		 576 aa  196  6e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.72 
 
 		 397 aa  196  7e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 		 955 aa  196  7e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.34 
 
 		 707 aa  192  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  32.96 
 
 		 4489 aa  192  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 711 aa  191  2.9999999999999997e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.4 
 
 		 784 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  28.07 
 
 		 1138 aa  186  5e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.08 
 
 		 632 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  27.88 
 
 		 564 aa  182  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  27.44 
 
 		 462 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  34.83 
 
 		 935 aa  177  4e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  31.1 
 
 		 573 aa  177  4e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.15 
 
 		 730 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 		 617 aa  176  7e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.65 
 
 		 1737 aa  176  8e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  36.88 
 
 		 3035 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  35.2 
 
 		 1094 aa  173  5e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 		 740 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  29.4 
 
 		 909 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  29.83 
 
 		 1013 aa  171  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1276 aa  168  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  35.46 
 
 		 1007 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  26.32 
 
 		 635 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 		 605 aa  166  9e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.19 
 
 		 818 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.54 
 
 		 1022 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.83 
 
 		 292 aa  161  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 		 366 aa  160  3e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  27.48 
 
 		 733 aa  160  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  28.66 
 
 		 706 aa  159  7e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 		 685 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  26.75 
 
 		 750 aa  158  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  24.21 
 
 		 1297 aa  158  2e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  33.55 
 
 		 3560 aa  157  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.27 
 
 		 784 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 		 1069 aa  155  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  29.51 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  33.21 
 
 		 1192 aa  153  5e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  25.94 
 
 		 687 aa  153  5.9999999999999996e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  33.58 
 
 		 623 aa  153  7e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 594 aa  153  7e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  32.52 
 
 		 523 aa  153  8e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  25.72 
 
 		 1067 aa  152  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 		 3145 aa  152  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  25.94 
 
 		 745 aa  151  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 		 486 aa  152  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  34.03 
 
 		 512 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.01 
 
 		 2240 aa  150  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  34.18 
 
 		 681 aa  150  5e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  27.25 
 
 		 1676 aa  150  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.78 
 
 		 1056 aa  150  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  28.65 
 
 		 725 aa  150  7e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 		 3172 aa  149  9e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.2 
 
 		 1056 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  25.3 
 
 		 706 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  31.6 
 
 		 363 aa  148  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 649 aa  147  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 		 467 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  32.59 
 
 		 639 aa  146  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.19 
 
 		 988 aa  147  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  30.72 
 
 		 626 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  30.74 
 
 		 344 aa  145  1e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  23.92 
 
 		 409 aa  145  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.9 
 
 		 689 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  24.25 
 
 		 409 aa  145  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  22.97 
 
 		 1056 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  24.81 
 
 		 3301 aa  145  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  24.69 
 
 		 676 aa  145  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  25.55 
 
 		 393 aa  144  4e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  25.9 
 
 		 393 aa  143  6e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  23.91 
 
 		 391 aa  143  6e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  29.93 
 
 		 334 aa  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 		 425 aa  143  7e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  30.95 
 
 		 620 aa  143  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  28.9 
 
 		 448 aa  143  7e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  34.17 
 
 		 612 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>