More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2954 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 468 aa  965    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1475  TPR repeat-containing protein  55.03 
 
 		 467 aa  543  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0003  TPR repeat-containing protein  38.74 
 
 		 466 aa  388  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4159  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 		 467 aa  323  4e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004642 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  31 
 
 		 465 aa  239  8e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2590  TPR repeat-containing protein  29.72 
 
 		 464 aa  199  6e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1669  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.58 
 
 		 476 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.42993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.08 
 
 		 465 aa  179  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06745  TPR repeat protein  26.67 
 
 		 463 aa  177  4e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.19 
 
 		 466 aa  172  9e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  26.13 
 
 		 465 aa  170  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 471 aa  169  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2065  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.03 
 
 		 465 aa  168  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.145613  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  24.12 
 
 		 435 aa  159  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  26.68 
 
 		 466 aa  157  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.62 
 
 		 449 aa  144  4e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0296562  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 878 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  29.17 
 
 		 1694 aa  130  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  23.82 
 
 		 543 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.61 
 
 		 810 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 927 aa  126  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 512 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.58 
 
 		 397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  24.52 
 
 		 1276 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  23.85 
 
 		 725 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  25.65 
 
 		 620 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 		 955 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  24.91 
 
 		 620 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  24.19 
 
 		 816 aa  110  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 		 909 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.98 
 
 		 3145 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  26.17 
 
 		 564 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.78 
 
 		 632 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  24.7 
 
 		 576 aa  107  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  28.01 
 
 		 1737 aa  107  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 		 362 aa  106  7e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  22.66 
 
 		 750 aa  106  7e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  22.59 
 
 		 4079 aa  106  8e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  22.7 
 
 		 562 aa  105  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  23.02 
 
 		 1069 aa  104  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 		 366 aa  103  5e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 		 3172 aa  103  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  23.1 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  22.65 
 
 		 1297 aa  102  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  26.96 
 
 		 733 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 		 602 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  24.21 
 
 		 936 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  24.61 
 
 		 612 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  24.67 
 
 		 685 aa  99.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  25.06 
 
 		 589 aa  99.4  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.69 
 
 		 707 aa  98.2  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  28.93 
 
 		 1007 aa  98.6  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 		 681 aa  98.2  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  24.56 
 
 		 764 aa  98.2  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 		 636 aa  98.2  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  22.19 
 
 		 1049 aa  98.2  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  23.45 
 
 		 409 aa  97.8  4e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  23.54 
 
 		 626 aa  97.4  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  24.61 
 
 		 745 aa  97.1  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 		 639 aa  96.7  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  26.18 
 
 		 887 aa  96.7  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  22.67 
 
 		 615 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  24.24 
 
 		 2262 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  27.56 
 
 		 622 aa  94.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  24.46 
 
 		 711 aa  94.7  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.73 
 
 		 689 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  24.66 
 
 		 1486 aa  93.6  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  23.56 
 
 		 393 aa  93.6  7e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  28.27 
 
 		 523 aa  93.2  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  23.56 
 
 		 565 aa  93.2  9e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 		 1094 aa  93.2  9e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  22.45 
 
 		 375 aa  92.8  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 		 750 aa  92.8  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 3035 aa  92.8  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.31 
 
 		 730 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  26.73 
 
 		 3301 aa  92.8  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  25.17 
 
 		 614 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  25.17 
 
 		 614 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  25.17 
 
 		 626 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  27.32 
 
 		 739 aa  92  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  22.56 
 
 		 409 aa  92  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.48 
 
 		 586 aa  92  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  23.34 
 
 		 637 aa  92.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 		 614 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  25.17 
 
 		 626 aa  91.3  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 		 614 aa  91.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  24.07 
 
 		 1138 aa  90.9  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  23.08 
 
 		 561 aa  90.5  5e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  23.21 
 
 		 4489 aa  90.9  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  22.59 
 
 		 1676 aa  90.1  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 		 393 aa  90.1  8e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  31.1 
 
 		 243 aa  89.7  9e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.06 
 
 		 2240 aa  89.7  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  27.76 
 
 		 1192 aa  89.7  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  23.27 
 
 		 505 aa  89.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  23.08 
 
 		 561 aa  89.4  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 		 614 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  22.77 
 
 		 402 aa  89  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  23.03 
 
 		 1979 aa  88.6  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  21.36 
 
 		 740 aa  88.6  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>