More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2807 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 
576 aa  1168    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  37.37 
 
 
1694 aa  293  7e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  32.91 
 
 
927 aa  279  1e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  34.87 
 
 
878 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 
1276 aa  263  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.97 
 
 
810 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  29.54 
 
 
543 aa  236  7e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 
562 aa  229  1e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 
4079 aa  223  9.999999999999999e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  28.94 
 
 
602 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.69 
 
 
1056 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  33.61 
 
 
573 aa  208  3e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.99 
 
 
784 aa  206  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.98 
 
 
818 aa  206  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.52 
 
 
707 aa  204  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  27.67 
 
 
564 aa  198  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 
465 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  27.25 
 
 
1979 aa  196  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.72 
 
 
1056 aa  194  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.78 
 
 
730 aa  193  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.22 
 
 
1022 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.54 
 
 
988 aa  190  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.11 
 
 
632 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  29.54 
 
 
711 aa  188  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.39 
 
 
784 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 
617 aa  181  2.9999999999999997e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  28.37 
 
 
635 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 
1737 aa  179  9e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 
1069 aa  179  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  30.28 
 
 
1007 aa  178  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 
414 aa  179  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 
1049 aa  177  4e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.53 
 
 
397 aa  177  5e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  33.85 
 
 
4489 aa  176  7e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  29.53 
 
 
366 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  26.98 
 
 
1013 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  27.76 
 
 
1138 aa  170  7e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  32.07 
 
 
955 aa  170  7e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  30.5 
 
 
1094 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 
3035 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  33.69 
 
 
523 aa  164  5.0000000000000005e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 
740 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  31.83 
 
 
344 aa  162  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  26.49 
 
 
462 aa  160  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  34.33 
 
 
1276 aa  160  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 
1192 aa  157  6e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  27.46 
 
 
795 aa  156  9e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  24.77 
 
 
750 aa  154  4e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 
605 aa  154  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 
591 aa  154  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  36.27 
 
 
3560 aa  154  5.9999999999999996e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 
634 aa  152  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 
467 aa  150  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  25.39 
 
 
3172 aa  150  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  28.1 
 
 
1067 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  29.28 
 
 
649 aa  149  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 
393 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 
935 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  31.91 
 
 
623 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  27.99 
 
 
329 aa  147  6e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 
409 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 
393 aa  145  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.71 
 
 
292 aa  144  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  26.44 
 
 
1056 aa  145  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 
589 aa  145  3e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 
395 aa  144  4e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
3301 aa  144  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  31.86 
 
 
909 aa  143  9e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  33.19 
 
 
279 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 
402 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 
409 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 
409 aa  140  8.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 
512 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  23.53 
 
 
732 aa  137  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  32.58 
 
 
706 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 
847 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 
486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 
597 aa  135  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  31.29 
 
 
626 aa  135  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.13 
 
 
689 aa  135  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  23.67 
 
 
887 aa  134  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  31.23 
 
 
363 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  25.93 
 
 
745 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  25.48 
 
 
833 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  26.02 
 
 
519 aa  131  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 
565 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  35.58 
 
 
244 aa  130  6e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  29.91 
 
 
626 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  29.97 
 
 
614 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  33.07 
 
 
398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  39.8 
 
 
560 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  28.03 
 
 
706 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  31.42 
 
 
750 aa  128  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  27.85 
 
 
391 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  27.84 
 
 
561 aa  128  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  29.5 
 
 
314 aa  128  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  27.84 
 
 
561 aa  127  4.0000000000000003e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  29.6 
 
 
626 aa  127  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 
614 aa  127  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  29.65 
 
 
614 aa  127  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>