More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2318 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  100 
 
 
573 aa  1157    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  46.83 
 
 
1694 aa  361  2e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  47.79 
 
 
602 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  41.95 
 
 
1276 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  43.62 
 
 
543 aa  296  7e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  40.54 
 
 
927 aa  295  2e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  39.54 
 
 
878 aa  253  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  40.25 
 
 
562 aa  249  1e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  38.17 
 
 
4489 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.4 
 
 
810 aa  243  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.39 
 
 
707 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  47.18 
 
 
344 aa  231  2e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  37.54 
 
 
711 aa  229  9e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  39.68 
 
 
397 aa  221  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  36.9 
 
 
3035 aa  220  7e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.08 
 
 
784 aa  219  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  32.75 
 
 
1979 aa  219  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  35 
 
 
730 aa  217  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  33.76 
 
 
576 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  43.23 
 
 
1007 aa  209  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  38.64 
 
 
833 aa  208  3e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  37.83 
 
 
1276 aa  207  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  39.1 
 
 
1192 aa  204  3e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  30.72 
 
 
740 aa  201  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.58 
 
 
632 aa  200  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.92 
 
 
1056 aa  200  7e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  38.73 
 
 
706 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  43.5 
 
 
512 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  29.81 
 
 
564 aa  198  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  33.45 
 
 
1094 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 
4079 aa  196  7e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.17 
 
 
1056 aa  196  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  36.16 
 
 
617 aa  193  8e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  38.89 
 
 
745 aa  191  4e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.61 
 
 
1022 aa  189  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.12 
 
 
784 aa  188  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  32.67 
 
 
1138 aa  187  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.17 
 
 
988 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  36.05 
 
 
329 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  36.51 
 
 
706 aa  184  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.17 
 
 
818 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  30.79 
 
 
955 aa  179  9e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  33.46 
 
 
3560 aa  177  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  31.1 
 
 
465 aa  177  5e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 
3172 aa  176  8e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  36.68 
 
 
591 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  44.1 
 
 
560 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  30.42 
 
 
436 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  33.71 
 
 
462 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  31.31 
 
 
3301 aa  173  5.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
363 aa  172  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  27.06 
 
 
1069 aa  172  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3483  TPR repeat-containing protein  26.91 
 
 
1054 aa  171  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  35.17 
 
 
279 aa  171  4e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 
366 aa  171  4e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.62 
 
 
292 aa  169  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  31.89 
 
 
409 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 
1049 aa  167  5e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  35.42 
 
 
523 aa  167  5.9999999999999996e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 
409 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 
1737 aa  166  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
409 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  35.15 
 
 
681 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  28.67 
 
 
1486 aa  164  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  33.81 
 
 
314 aa  165  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
486 aa  164  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  34.41 
 
 
887 aa  164  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  32.97 
 
 
398 aa  162  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  30.72 
 
 
635 aa  162  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  29.34 
 
 
414 aa  161  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1311  hypothetical protein  33.96 
 
 
331 aa  160  6e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  31.64 
 
 
391 aa  158  3e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  36.97 
 
 
865 aa  157  4e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  33.52 
 
 
1056 aa  156  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  29.69 
 
 
626 aa  155  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  34.71 
 
 
356 aa  155  2.9999999999999998e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 
636 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  38.82 
 
 
352 aa  152  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 
635 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 
635 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 
612 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 
662 aa  151  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
611 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
452 aa  150  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  27.25 
 
 
448 aa  150  9e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  37.83 
 
 
334 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  29.59 
 
 
623 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  32.82 
 
 
761 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 
425 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 
649 aa  149  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  29.3 
 
 
614 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  29.3 
 
 
626 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 
750 aa  149  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  29.3 
 
 
614 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  24.41 
 
 
450 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 
824 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  29.3 
 
 
614 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  29.3 
 
 
614 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  29.3 
 
 
626 aa  148  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  29.3 
 
 
614 aa  148  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>