More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0114 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
602 aa  1176    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  78.44 
 
 
344 aa  499  1e-140  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  50.2 
 
 
543 aa  475  1e-132  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  44.13 
 
 
1694 aa  446  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  40.93 
 
 
1276 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  38.81 
 
 
927 aa  387  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  35.75 
 
 
562 aa  346  8e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  32.72 
 
 
4079 aa  313  4.999999999999999e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  47.79 
 
 
573 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  34.81 
 
 
1979 aa  306  9.000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.66 
 
 
784 aa  267  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  31.02 
 
 
1138 aa  266  7e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  29.86 
 
 
564 aa  259  1e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.29 
 
 
878 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  37.67 
 
 
711 aa  250  6e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.57 
 
 
1056 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.8 
 
 
707 aa  241  4e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.21 
 
 
988 aa  239  9e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.64 
 
 
810 aa  236  8e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 
1069 aa  232  1e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.33 
 
 
1022 aa  229  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  32.15 
 
 
617 aa  227  5.0000000000000005e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 
1049 aa  226  1e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  39.61 
 
 
329 aa  225  2e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  32.75 
 
 
591 aa  225  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.11 
 
 
1056 aa  223  6e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.76 
 
 
730 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  28.94 
 
 
576 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  36.54 
 
 
4489 aa  217  4e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  31.4 
 
 
1013 aa  216  7e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.73 
 
 
1737 aa  215  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  30.62 
 
 
1056 aa  213  5.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 
804 aa  213  7.999999999999999e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  30.87 
 
 
635 aa  213  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  37.79 
 
 
745 aa  211  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.97 
 
 
818 aa  211  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  34.33 
 
 
409 aa  206  1e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  31.56 
 
 
465 aa  204  5e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  36.7 
 
 
397 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  32.6 
 
 
409 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.7 
 
 
784 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  47.52 
 
 
512 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  29.87 
 
 
750 aa  196  7e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  29.77 
 
 
955 aa  195  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 
414 aa  194  4e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
634 aa  190  5.999999999999999e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 
366 aa  190  7e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 
740 aa  190  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  35.34 
 
 
3035 aa  189  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 
687 aa  189  1e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 
409 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  36.44 
 
 
279 aa  182  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  30.29 
 
 
1094 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  32.13 
 
 
425 aa  180  5.999999999999999e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  37.31 
 
 
1007 aa  180  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 
605 aa  179  9e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 
467 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 
833 aa  173  6.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 
1276 aa  173  6.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  27.02 
 
 
887 aa  171  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  44.74 
 
 
560 aa  172  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 
935 aa  171  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.79 
 
 
758 aa  169  9e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  34.64 
 
 
292 aa  167  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 
3560 aa  167  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.61 
 
 
632 aa  167  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  29.45 
 
 
589 aa  166  1.0000000000000001e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  27.38 
 
 
594 aa  166  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 
1192 aa  163  7e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  35.35 
 
 
356 aa  163  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  27.7 
 
 
706 aa  160  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  22.64 
 
 
1067 aa  161  4e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  29.02 
 
 
436 aa  160  6e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  30.09 
 
 
363 aa  159  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 
450 aa  159  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  27.75 
 
 
462 aa  157  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  25.16 
 
 
1297 aa  157  7e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 
761 aa  157  7e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  28.85 
 
 
706 aa  156  9e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 
375 aa  155  2e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  33.73 
 
 
314 aa  155  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0089  TPR repeat-containing protein  29.4 
 
 
388 aa  154  4e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.159552  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0420  TPR-domain containing protein  25.64 
 
 
791 aa  150  5e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.31 
 
 
2240 aa  150  7e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  27.95 
 
 
3301 aa  150  8e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  27.38 
 
 
662 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  39.38 
 
 
244 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 
486 aa  149  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  32.43 
 
 
623 aa  148  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  32.31 
 
 
398 aa  147  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 
393 aa  147  5e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  24.42 
 
 
3172 aa  147  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 
523 aa  147  6e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1311  hypothetical protein  28.48 
 
 
331 aa  145  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  24.35 
 
 
626 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 
349 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 
732 aa  142  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  24.65 
 
 
1486 aa  143  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  31.83 
 
 
393 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.92 
 
 
296 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>