More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0060 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
562 aa  1140    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  37.38 
 
 
1276 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  37.57 
 
 
1694 aa  381  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  38.12 
 
 
543 aa  365  1e-99  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  32.16 
 
 
927 aa  347  4e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  35.75 
 
 
602 aa  346  7e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  30.37 
 
 
1979 aa  290  6e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  29.96 
 
 
4079 aa  286  1.0000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
878 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  28.74 
 
 
564 aa  262  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  29.86 
 
 
1138 aa  259  7e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.04 
 
 
810 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.62 
 
 
988 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.06 
 
 
1056 aa  254  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  40.25 
 
 
573 aa  249  1e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.99 
 
 
1056 aa  246  6e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.51 
 
 
784 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.16 
 
 
1022 aa  239  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.96 
 
 
818 aa  237  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.79 
 
 
784 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  27.33 
 
 
576 aa  229  1e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 
1049 aa  227  4e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  34.17 
 
 
730 aa  226  9e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  29 
 
 
617 aa  226  1e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  30.15 
 
 
711 aa  226  1e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.33 
 
 
707 aa  225  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 
366 aa  223  9e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  28.52 
 
 
1069 aa  221  3e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  36 
 
 
4489 aa  219  8.999999999999998e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.89 
 
 
1737 aa  214  3.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 
465 aa  212  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  29.22 
 
 
635 aa  207  3e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  36.75 
 
 
1192 aa  206  7e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  25.18 
 
 
804 aa  206  9e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  34.42 
 
 
329 aa  206  1e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  28.88 
 
 
605 aa  205  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  35.03 
 
 
3035 aa  204  4e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  28.35 
 
 
1013 aa  203  7e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  36.39 
 
 
344 aa  199  9e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  37.28 
 
 
1276 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 
750 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  29.43 
 
 
409 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 
955 aa  195  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  30.94 
 
 
1094 aa  195  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 
3172 aa  194  5e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.3 
 
 
397 aa  193  7e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  33.42 
 
 
740 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  24.16 
 
 
1067 aa  191  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 
409 aa  190  7e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  30.45 
 
 
935 aa  188  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  27.75 
 
 
462 aa  188  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  25.73 
 
 
1421 aa  187  4e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 
409 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 
591 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 
425 aa  184  3e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  23.35 
 
 
1056 aa  182  9.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  27.79 
 
 
594 aa  183  9.000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  24.01 
 
 
687 aa  177  4e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  24.69 
 
 
634 aa  177  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 
761 aa  177  5e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  29.83 
 
 
467 aa  177  5e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  28.22 
 
 
706 aa  177  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  29.95 
 
 
1007 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  24.08 
 
 
1297 aa  174  3.9999999999999995e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  31.44 
 
 
3560 aa  173  7.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.83 
 
 
292 aa  172  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  28.75 
 
 
706 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 
414 aa  171  4e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  27.02 
 
 
486 aa  171  5e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 
649 aa  170  6e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.56 
 
 
632 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2796  TPR repeat-containing protein  28.39 
 
 
621 aa  167  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  25.41 
 
 
745 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 
523 aa  166  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 
375 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 
512 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  24.55 
 
 
3301 aa  164  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  26.73 
 
 
436 aa  163  6e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  24.51 
 
 
643 aa  163  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.25 
 
 
465 aa  160  7e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  33.61 
 
 
732 aa  159  9e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.6 
 
 
466 aa  159  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  24.36 
 
 
887 aa  158  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  25.23 
 
 
833 aa  158  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 
589 aa  158  3e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.79 
 
 
2240 aa  157  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  30.47 
 
 
314 aa  157  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  22.47 
 
 
1676 aa  157  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 
395 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1311  hypothetical protein  30.45 
 
 
331 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 
435 aa  155  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 
450 aa  155  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 
279 aa  153  7e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  29.39 
 
 
1827 aa  153  8.999999999999999e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  28.08 
 
 
909 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  33.57 
 
 
662 aa  152  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 
465 aa  152  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 
471 aa  152  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2065  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.52 
 
 
465 aa  152  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.145613  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 
371 aa  151  4e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>