More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1840 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  74.31 
 
 		 3035 aa  3525    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  54.49 
 
 		 4489 aa  2904    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  44.62 
 
 		 732 aa  654    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  45.01 
 
 		 761 aa  695    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  58.85 
 
 		 1094 aa  934    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 3560 aa  7312    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  42.33 
 
 		 1085 aa  601  1e-170  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  40.03 
 
 		 909 aa  552  1e-155  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  40.88 
 
 		 740 aa  554  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  45.72 
 
 		 618 aa  546  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  45.55 
 
 		 654 aa  527  1e-147  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  41.9 
 
 		 660 aa  506  1e-141  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  37.74 
 
 		 816 aa  505  1e-141  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  36.16 
 
 		 750 aa  487  1e-135  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  40.06 
 
 		 647 aa  476  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  37.34 
 
 		 700 aa  467  1e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  41.36 
 
 		 667 aa  459  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  37.11 
 
 		 739 aa  422  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 		 1714 aa  422  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  40.32 
 
 		 611 aa  402  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  43.15 
 
 		 569 aa  395  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  31.8 
 
 		 808 aa  392  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  39.6 
 
 		 616 aa  393  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  41.07 
 
 		 574 aa  389  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  46.21 
 
 		 459 aa  377  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  45.68 
 
 		 492 aa  374  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  33.15 
 
 		 706 aa  369  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7846  hypothetical protein  42.95 
 
 		 452 aa  359  5.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346388 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20301  hypothetical protein  48.9 
 
 		 395 aa  347  2e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.236649 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  37.05 
 
 		 560 aa  347  2e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1319  TPR repeat-containing protein  54.01 
 
 		 295 aa  338  9e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000490816  hitchhiker  8.5993e-22 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 		 750 aa  333  5.0000000000000004e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  36.32 
 
 		 680 aa  325  8e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  39.74 
 
 		 568 aa  321  2e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  34.59 
 
 		 632 aa  310  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0359  hypothetical protein  42.11 
 
 		 657 aa  310  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224796  normal  0.0716049 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.13 
 
 		 570 aa  307  3.0000000000000004e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  42.05 
 
 		 633 aa  306  4.0000000000000003e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  41.58 
 
 		 657 aa  305  8.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  30.64 
 
 		 718 aa  305  8.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4069  TPR repeat-containing protein  40.43 
 
 		 590 aa  303  4e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00017793  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3853  O-linked acetylglucosamine transferase  40.22 
 
 		 590 aa  303  5e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  29.88 
 
 		 713 aa  303  5e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  33.28 
 
 		 672 aa  301  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  37.32 
 
 		 566 aa  289  7e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 754 aa  288  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 789 aa  286  7.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  29.93 
 
 		 715 aa  285  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  27.26 
 
 		 632 aa  284  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  30.16 
 
 		 754 aa  283  4e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  40.11 
 
 		 637 aa  282  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  27.99 
 
 		 824 aa  279  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  31.84 
 
 		 708 aa  279  8e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  29.16 
 
 		 732 aa  277  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 		 828 aa  276  6e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 828 aa  273  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2411  hypothetical protein  39.75 
 
 		 582 aa  271  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100681  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2579  hypothetical protein  38.5 
 
 		 588 aa  265  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385383  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  37.38 
 
 		 630 aa  265  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  26.81 
 
 		 833 aa  263  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.69 
 
 		 742 aa  264  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.88 
 
 		 739 aa  262  8e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 		 828 aa  256  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  42.95 
 
 		 1694 aa  254  2e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2410  hypothetical protein  36.63 
 
 		 624 aa  254  3e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.46 
 
 		 1106 aa  253  4e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  24.49 
 
 		 1252 aa  251  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 		 626 aa  249  6e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 968 aa  249  8e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  24.37 
 
 		 1252 aa  248  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  32.25 
 
 		 585 aa  247  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  43.67 
 
 		 1276 aa  246  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 		 1106 aa  245  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.94 
 
 		 667 aa  244  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.6 
 
 		 739 aa  244  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  29.42 
 
 		 595 aa  243  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  28.13 
 
 		 734 aa  242  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  27.98 
 
 		 708 aa  241  2e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 627 aa  234  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 598 aa  234  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.8 
 
 		 589 aa  232  8e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  28.4 
 
 		 699 aa  232  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  28.55 
 
 		 937 aa  231  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 619 aa  227  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 		 717 aa  227  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  28.14 
 
 		 1221 aa  226  4.9999999999999996e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  28.1 
 
 		 1415 aa  226  6e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  28.98 
 
 		 717 aa  224  3e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  27.38 
 
 		 647 aa  224  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  25.55 
 
 		 693 aa  223  3.9999999999999997e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  35.21 
 
 		 878 aa  217  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.17 
 
 		 739 aa  214  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 833 aa  214  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.95 
 
 		 529 aa  214  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 		 789 aa  213  5e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  25.6 
 
 		 1154 aa  213  7e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  39.05 
 
 		 1827 aa  212  8e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.74 
 
 		 740 aa  211  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.73 
 
 		 589 aa  207  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  39.4 
 
 		 681 aa  205  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>