More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0121 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 732 aa  1512    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  47.97 
 
 		 1094 aa  636    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  47.12 
 
 		 3560 aa  671    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  43.71 
 
 		 3035 aa  643    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  48 
 
 		 4489 aa  674    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  41.16 
 
 		 761 aa  566  1e-160  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  36.89 
 
 		 740 aa  468  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  36.45 
 
 		 1085 aa  452  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  39.31 
 
 		 618 aa  438  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  37.33 
 
 		 654 aa  421  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  34.87 
 
 		 909 aa  412  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  37.99 
 
 		 660 aa  409  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  36.77 
 
 		 816 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  33.84 
 
 		 739 aa  376  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 		 750 aa  378  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  36.29 
 
 		 647 aa  378  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  32.05 
 
 		 700 aa  362  2e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 		 667 aa  357  5.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  41.54 
 
 		 611 aa  349  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  42.21 
 
 		 459 aa  348  3e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 		 808 aa  342  2e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  40.95 
 
 		 492 aa  342  2e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  35.87 
 
 		 616 aa  340  5.9999999999999996e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  36.88 
 
 		 569 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1319  TPR repeat-containing protein  54.06 
 
 		 295 aa  316  9.999999999999999e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000490816  hitchhiker  8.5993e-22 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7846  hypothetical protein  40.44 
 
 		 452 aa  313  4.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346388 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  31.04 
 
 		 750 aa  307  5.0000000000000004e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20301  hypothetical protein  45.9 
 
 		 395 aa  304  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.236649 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 		 706 aa  295  3e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  35.25 
 
 		 632 aa  291  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  31.66 
 
 		 574 aa  289  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  29.12 
 
 		 632 aa  287  5.999999999999999e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  34.17 
 
 		 568 aa  286  1.0000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  35.97 
 
 		 560 aa  283  8.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.96 
 
 		 570 aa  283  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 		 672 aa  279  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0359  hypothetical protein  38.52 
 
 		 657 aa  271  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224796  normal  0.0716049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  38.27 
 
 		 657 aa  270  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  36.64 
 
 		 566 aa  263  6e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  36.48 
 
 		 637 aa  261  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4069  TPR repeat-containing protein  34.81 
 
 		 590 aa  259  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00017793  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  33.19 
 
 		 680 aa  254  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3853  O-linked acetylglucosamine transferase  32.68 
 
 		 590 aa  253  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.91 
 
 		 739 aa  247  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  35.2 
 
 		 630 aa  243  6e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2579  hypothetical protein  36.55 
 
 		 588 aa  240  8e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385383  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  37.3 
 
 		 633 aa  239  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  25.59 
 
 		 713 aa  237  6e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.16 
 
 		 742 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 		 754 aa  232  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 		 754 aa  231  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 		 732 aa  231  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  25.38 
 
 		 718 aa  231  4e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  25.63 
 
 		 789 aa  230  7e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2410  hypothetical protein  33.96 
 
 		 624 aa  227  7e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  25.94 
 
 		 715 aa  226  9e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 968 aa  224  4e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.93 
 
 		 739 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  24.45 
 
 		 828 aa  219  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  24.45 
 
 		 828 aa  218  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  26.43 
 
 		 828 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  24.11 
 
 		 824 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  27.74 
 
 		 937 aa  216  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2411  hypothetical protein  29.96 
 
 		 582 aa  210  6e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100681  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  25.65 
 
 		 708 aa  207  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 		 626 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  25.85 
 
 		 734 aa  203  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  28.07 
 
 		 585 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.51 
 
 		 1106 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.35 
 
 		 739 aa  196  9e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  24.7 
 
 		 708 aa  194  3e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 		 627 aa  193  8e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 		 789 aa  193  9e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.16 
 
 		 589 aa  191  5.999999999999999e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  23.23 
 
 		 833 aa  190  9e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  25 
 
 		 699 aa  189  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1874  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.9 
 
 		 793 aa  189  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 		 1714 aa  184  7e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.52 
 
 		 529 aa  182  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  24.69 
 
 		 595 aa  181  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  24.78 
 
 		 1221 aa  181  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.5 
 
 		 740 aa  178  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  24.81 
 
 		 598 aa  177  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.65 
 
 		 589 aa  177  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 633 aa  177  8e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  30.42 
 
 		 1106 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  28.27 
 
 		 596 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.59 
 
 		 667 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  24.57 
 
 		 619 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  25.11 
 
 		 647 aa  174  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00265  UDP-N-acetylglucosaminyltransferase (AFU_orthologue; AFUA_1G03380)  29.86 
 
 		 1596 aa  165  3e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0115382 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  24.01 
 
 		 633 aa  163  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0346  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 		 739 aa  162  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110262  normal  0.110805 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  22.44 
 
 		 833 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  24.05 
 
 		 1415 aa  161  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  33.61 
 
 		 562 aa  159  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  25.07 
 
 		 796 aa  159  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  33.71 
 
 		 1276 aa  156  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  33.45 
 
 		 1827 aa  157  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2387  tetratricopeptide TPR_2  29.71 
 
 		 745 aa  155  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.625245  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>