162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1891 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  100 
 
 		 492 aa  992    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7846  hypothetical protein  65.38 
 
 		 452 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346388 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  55.26 
 
 		 459 aa  499  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  48.87 
 
 		 1085 aa  400  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  45.56 
 
 		 4489 aa  380  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  45.68 
 
 		 3560 aa  374  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  43.39 
 
 		 1094 aa  370  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  44.87 
 
 		 618 aa  364  2e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  45.68 
 
 		 3035 aa  360  3e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  43.21 
 
 		 700 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  46.07 
 
 		 654 aa  347  3e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  40.95 
 
 		 732 aa  342  1e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  47.27 
 
 		 740 aa  323  5e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  40.78 
 
 		 761 aa  322  7e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  45.33 
 
 		 647 aa  318  1e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  43.44 
 
 		 750 aa  313  4.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  46.02 
 
 		 611 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  42.72 
 
 		 574 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  42.57 
 
 		 569 aa  303  4.0000000000000003e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.33 
 
 		 570 aa  302  1e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  44.8 
 
 		 637 aa  298  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  40.83 
 
 		 568 aa  293  5e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  38.2 
 
 		 660 aa  293  6e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  47.54 
 
 		 667 aa  291  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  41.5 
 
 		 616 aa  288  2e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  43.13 
 
 		 566 aa  286  7e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1319  TPR repeat-containing protein  50 
 
 		 295 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000490816  hitchhiker  8.5993e-22 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  41.92 
 
 		 633 aa  278  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  38.83 
 
 		 672 aa  276  4e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  36.72 
 
 		 706 aa  276  8e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  46.07 
 
 		 632 aa  275  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  41.46 
 
 		 680 aa  271  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2579  hypothetical protein  41.1 
 
 		 588 aa  267  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385383  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20301  hypothetical protein  41.18 
 
 		 395 aa  266  5.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.236649 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  38.69 
 
 		 657 aa  264  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  34.12 
 
 		 750 aa  262  8.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0359  hypothetical protein  38.01 
 
 		 657 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224796  normal  0.0716049 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  34.17 
 
 		 739 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  32.91 
 
 		 909 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  38.35 
 
 		 816 aa  256  5e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  41.14 
 
 		 560 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4069  TPR repeat-containing protein  43.59 
 
 		 590 aa  254  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00017793  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3853  O-linked acetylglucosamine transferase  43.59 
 
 		 590 aa  253  7e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  39.17 
 
 		 808 aa  253  7e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2410  hypothetical protein  34.68 
 
 		 624 aa  249  6e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2411  hypothetical protein  39.18 
 
 		 582 aa  243  7e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100681  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  38.69 
 
 		 630 aa  235  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 		 632 aa  225  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 		 633 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 		 828 aa  200  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 		 828 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  32.44 
 
 		 828 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  35.83 
 
 		 708 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.11 
 
 		 1106 aa  196  7e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  33.61 
 
 		 789 aa  194  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  37.77 
 
 		 585 aa  193  6e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.05 
 
 		 589 aa  192  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 		 833 aa  191  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  32.6 
 
 		 833 aa  191  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  33.42 
 
 		 717 aa  189  8e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.28 
 
 		 529 aa  189  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  33.96 
 
 		 1106 aa  187  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  34.81 
 
 		 754 aa  187  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  34.53 
 
 		 754 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  33.51 
 
 		 968 aa  184  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00265  UDP-N-acetylglucosaminyltransferase (AFU_orthologue; AFUA_1G03380)  27.12 
 
 		 1596 aa  184  4.0000000000000006e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0115382 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  32.64 
 
 		 717 aa  183  6e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.88 
 
 		 589 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.04 
 
 		 667 aa  181  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  32.79 
 
 		 1714 aa  179  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  28.68 
 
 		 699 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0346  TPR repeat-containing protein  31.59 
 
 		 739 aa  173  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110262  normal  0.110805 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  30.9 
 
 		 708 aa  173  5.999999999999999e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 		 598 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  34.03 
 
 		 619 aa  171  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 		 789 aa  170  6e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0934  TPR repeat-containing protein  32.6 
 
 		 739 aa  169  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.897718 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 626 aa  167  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 		 734 aa  166  9e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4222  glycosyltransferase TPR domain-containing protein  33.22 
 
 		 594 aa  166  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 		 732 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2387  tetratricopeptide TPR_2  29.22 
 
 		 745 aa  163  7e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.625245  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4067  hypothetical protein  29.19 
 
 		 747 aa  161  3e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  29.84 
 
 		 821 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0256  hypothetical protein  28.49 
 
 		 719 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  29.84 
 
 		 776 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  29.84 
 
 		 776 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  29.84 
 
 		 776 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 		 595 aa  160  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  30.08 
 
 		 1221 aa  160  6e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 		 776 aa  159  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  31.02 
 
 		 796 aa  159  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  29.95 
 
 		 821 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0933  TPR repeat-containing protein  30.94 
 
 		 738 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.450791  normal  0.93664 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 		 776 aa  159  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 		 824 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  30.62 
 
 		 937 aa  156  7e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2394  hypothetical protein  29.27 
 
 		 740 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000509541  hitchhiker  0.0000624153 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 		 633 aa  154  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  30.09 
 
 		 647 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>