158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4222 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4222  glycosyltransferase TPR domain-containing protein  100 
 
 		 594 aa  1222    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2579  hypothetical protein  34.74 
 
 		 588 aa  298  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385383  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  31.26 
 
 		 566 aa  252  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2410  hypothetical protein  34.37 
 
 		 624 aa  233  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  37.17 
 
 		 633 aa  219  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2411  hypothetical protein  35.51 
 
 		 582 aa  218  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100681  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0359  hypothetical protein  31.52 
 
 		 657 aa  211  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224796  normal  0.0716049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  27.21 
 
 		 657 aa  205  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  33.94 
 
 		 630 aa  204  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  32.79 
 
 		 637 aa  202  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  32.77 
 
 		 569 aa  189  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 		 1085 aa  186  8e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 		 4489 aa  177  7e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 1094 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  33.87 
 
 		 654 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 		 3560 aa  171  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  24.82 
 
 		 750 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 		 618 aa  168  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  26.18 
 
 		 632 aa  167  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  29.86 
 
 		 632 aa  167  6.9999999999999995e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  33.22 
 
 		 492 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 3035 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  27.8 
 
 		 574 aa  164  5.0000000000000005e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  23.87 
 
 		 909 aa  163  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  24.78 
 
 		 816 aa  161  4e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  30.33 
 
 		 680 aa  160  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  31.02 
 
 		 647 aa  156  9e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  30.64 
 
 		 706 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 		 700 aa  154  5e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 740 aa  154  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 		 761 aa  150  7e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  31.47 
 
 		 808 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 611 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 		 616 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 750 aa  146  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.24 
 
 		 1106 aa  145  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  29.43 
 
 		 732 aa  144  6e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 		 667 aa  143  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 739 aa  142  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7846  hypothetical protein  32.4 
 
 		 452 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346388 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  33 
 
 		 459 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 		 1106 aa  140  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.6 
 
 		 589 aa  139  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  26.12 
 
 		 568 aa  134  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 		 672 aa  131  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  31.02 
 
 		 828 aa  130  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4069  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 590 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00017793  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 1714 aa  128  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.97 
 
 		 589 aa  128  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 		 828 aa  127  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3853  O-linked acetylglucosamine transferase  30.98 
 
 		 590 aa  127  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  27.69 
 
 		 585 aa  127  8.000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 		 828 aa  126  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20301  hypothetical protein  30.03 
 
 		 395 aa  126  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.236649 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  27.95 
 
 		 633 aa  125  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  29 
 
 		 1221 aa  125  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1319  TPR repeat-containing protein  30.12 
 
 		 295 aa  124  7e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000490816  hitchhiker  8.5993e-22 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 619 aa  123  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 		 598 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  28.62 
 
 		 560 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.63 
 
 		 570 aa  120  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 		 660 aa  120  7.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  27.83 
 
 		 1415 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 		 633 aa  118  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.9 
 
 		 667 aa  118  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 		 626 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  31.27 
 
 		 968 aa  116  8.999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  29.31 
 
 		 699 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  29.27 
 
 		 596 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  28.61 
 
 		 754 aa  115  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  30.59 
 
 		 789 aa  114  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0256  hypothetical protein  25.87 
 
 		 719 aa  114  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0934  TPR repeat-containing protein  28.52 
 
 		 739 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.897718 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2387  tetratricopeptide TPR_2  24.43 
 
 		 745 aa  113  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.625245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  25.14 
 
 		 627 aa  110  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.74 
 
 		 739 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  26.07 
 
 		 713 aa  107  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 595 aa  107  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 		 754 aa  107  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  28.39 
 
 		 789 aa  106  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  28.9 
 
 		 717 aa  106  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2394  hypothetical protein  24.09 
 
 		 740 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000509541  hitchhiker  0.0000624153 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  27.43 
 
 		 715 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  27.27 
 
 		 708 aa  104  5e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  28.3 
 
 		 821 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0933  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 738 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.450791  normal  0.93664 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  28.3 
 
 		 821 aa  103  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 		 776 aa  103  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 		 776 aa  103  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 		 734 aa  103  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  28.3 
 
 		 776 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  28.3 
 
 		 776 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  28.3 
 
 		 776 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0346  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 		 739 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110262  normal  0.110805 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 		 796 aa  102  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 717 aa  101  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 		 833 aa  101  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  29.43 
 
 		 781 aa  100  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 708 aa  100  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 		 833 aa  100  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>