More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0293 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 789 aa  1607    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  36.55 
 
 		 754 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  37.35 
 
 		 754 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  42.78 
 
 		 626 aa  429  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  40.57 
 
 		 708 aa  421  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  35.84 
 
 		 824 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 		 828 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  33.98 
 
 		 828 aa  411  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  38.42 
 
 		 789 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  42.7 
 
 		 619 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 		 828 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  35.78 
 
 		 732 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  40.96 
 
 		 598 aa  405  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  34.79 
 
 		 833 aa  392  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  40.69 
 
 		 833 aa  389  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  40.79 
 
 		 595 aa  386  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.24 
 
 		 589 aa  333  5e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 		 968 aa  328  2.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  33.46 
 
 		 1714 aa  328  3e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.8 
 
 		 589 aa  325  3e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  32.27 
 
 		 1415 aa  316  9.999999999999999e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  33.44 
 
 		 627 aa  310  6.999999999999999e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  31.15 
 
 		 699 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  35.09 
 
 		 1221 aa  306  1.0000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.36 
 
 		 790 aa  300  6e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  30.49 
 
 		 790 aa  299  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  28.76 
 
 		 821 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  28.76 
 
 		 776 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  28.76 
 
 		 776 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  28.76 
 
 		 776 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  30.01 
 
 		 718 aa  293  7e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  35.67 
 
 		 585 aa  291  4e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  30.81 
 
 		 937 aa  290  7e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  32.65 
 
 		 596 aa  290  9e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  32.47 
 
 		 776 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  32.47 
 
 		 821 aa  288  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 		 822 aa  288  4e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.24 
 
 		 667 aa  287  5.999999999999999e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  32.47 
 
 		 776 aa  286  7e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  32.19 
 
 		 717 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 		 734 aa  283  7.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.57 
 
 		 1106 aa  283  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  34.68 
 
 		 797 aa  282  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  32.01 
 
 		 717 aa  280  6e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  29.15 
 
 		 708 aa  278  2e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  32.57 
 
 		 1106 aa  278  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  31.86 
 
 		 1116 aa  277  6e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  31.73 
 
 		 781 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 796 aa  275  3e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.73 
 
 		 529 aa  275  3e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  33.54 
 
 		 1143 aa  273  7e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.26 
 
 		 739 aa  273  7e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.4 
 
 		 723 aa  269  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  30.8 
 
 		 693 aa  269  1e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 974 aa  265  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  30.2 
 
 		 713 aa  262  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 		 727 aa  261  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  31.56 
 
 		 779 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  31.68 
 
 		 921 aa  256  8e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  27.76 
 
 		 780 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  27.76 
 
 		 780 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 		 909 aa  253  7e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 		 633 aa  253  8.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0103  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 		 733 aa  252  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467133  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.07 
 
 		 740 aa  249  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.85 
 
 		 739 aa  247  6e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 750 aa  244  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  29.04 
 
 		 715 aa  244  6e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.24 
 
 		 739 aa  243  9e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  30.33 
 
 		 1144 aa  237  6e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  24.04 
 
 		 816 aa  237  8e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.53 
 
 		 742 aa  229  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  34.31 
 
 		 633 aa  228  3e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 		 667 aa  227  8e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0605  tetratricopeptide domain-containing protein  29.84 
 
 		 553 aa  221  5e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.335277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 		 700 aa  220  7e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  27.26 
 
 		 706 aa  220  8.999999999999998e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 		 1094 aa  219  2e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 		 3035 aa  218  4e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  24.65 
 
 		 808 aa  216  9e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  32 
 
 		 552 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 		 647 aa  214  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  27.95 
 
 		 3560 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 		 1085 aa  211  5e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  24.91 
 
 		 4489 aa  209  1e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1874  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.16 
 
 		 793 aa  209  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  24.45 
 
 		 632 aa  205  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  23.41 
 
 		 739 aa  204  4e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  28.9 
 
 		 750 aa  201  3.9999999999999996e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 		 618 aa  198  4.0000000000000005e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  29.83 
 
 		 574 aa  197  7e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 		 732 aa  195  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  27.9 
 
 		 680 aa  194  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  29.16 
 
 		 611 aa  194  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0114  TPR repeat-containing protein  22.95 
 
 		 724 aa  193  9e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.029745  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  25.94 
 
 		 740 aa  189  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  28.11 
 
 		 654 aa  187  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 616 aa  187  5e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  32.13 
 
 		 633 aa  187  8e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  31.69 
 
 		 761 aa  184  6e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>