223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1582 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  100 
 
 
1144 aa  2385    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  37.41 
 
 
1116 aa  730    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  41.14 
 
 
1143 aa  903    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  35.47 
 
 
797 aa  334  6e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  33.11 
 
 
821 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  33.11 
 
 
776 aa  322  3e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  33.11 
 
 
776 aa  322  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  32.94 
 
 
776 aa  322  3e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  33.11 
 
 
776 aa  322  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  32.94 
 
 
821 aa  322  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  32.94 
 
 
776 aa  321  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  31.11 
 
 
780 aa  317  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 
780 aa  317  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.79 
 
 
790 aa  315  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  32.57 
 
 
790 aa  312  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  31.46 
 
 
781 aa  310  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  31 
 
 
779 aa  305  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1897  Methyltransferase regulatory domain, predicted  37.28 
 
 
564 aa  282  3e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.01 
 
 
1106 aa  260  9e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  36.19 
 
 
974 aa  258  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 
1714 aa  257  9e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 
754 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  34.53 
 
 
796 aa  254  4.0000000000000004e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  31.8 
 
 
585 aa  254  6e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.98 
 
 
589 aa  253  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  35.01 
 
 
1106 aa  250  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 
754 aa  248  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 
626 aa  247  8e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  28.6 
 
 
647 aa  247  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  28.84 
 
 
828 aa  242  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.55 
 
 
589 aa  241  5e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  30.69 
 
 
699 aa  241  9e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  31.86 
 
 
717 aa  239  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  35.04 
 
 
708 aa  238  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  31.86 
 
 
717 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 
789 aa  237  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.97 
 
 
667 aa  237  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 
633 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  29.21 
 
 
1221 aa  233  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 
968 aa  232  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  31.66 
 
 
619 aa  232  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 
828 aa  229  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 
828 aa  227  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  31.45 
 
 
596 aa  226  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  30.98 
 
 
824 aa  226  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 
598 aa  225  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.77 
 
 
529 aa  225  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 
595 aa  223  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  33.41 
 
 
633 aa  219  2.9999999999999998e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1624  Methyltransferase type 12  31.76 
 
 
542 aa  218  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 
833 aa  218  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 
732 aa  218  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 
833 aa  217  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  28.76 
 
 
822 aa  216  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  28.63 
 
 
552 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  31.03 
 
 
1415 aa  215  4.9999999999999996e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 
734 aa  214  7e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 
627 aa  213  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 
789 aa  212  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 
718 aa  211  9e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  27.43 
 
 
708 aa  206  2e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 
713 aa  203  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.98 
 
 
723 aa  203  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  33.96 
 
 
727 aa  201  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  29.47 
 
 
937 aa  201  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.54 
 
 
739 aa  189  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  29.24 
 
 
921 aa  189  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.4 
 
 
740 aa  188  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0605  tetratricopeptide domain-containing protein  28.18 
 
 
553 aa  188  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.335277  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  31.76 
 
 
715 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.96 
 
 
739 aa  182  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.74 
 
 
739 aa  179  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.95 
 
 
742 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  29.74 
 
 
632 aa  173  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  27.65 
 
 
3560 aa  173  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0103  TPR repeat-containing protein  33.78 
 
 
733 aa  172  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467133  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  24.17 
 
 
1085 aa  172  4e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  26.13 
 
 
750 aa  170  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0579  methyltransferase  33.33 
 
 
523 aa  169  2e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.795709  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3960  methyltransferase type 12  35.16 
 
 
535 aa  169  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00884367  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  27.09 
 
 
816 aa  169  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  25.55 
 
 
693 aa  168  5e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 
808 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 
700 aa  163  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 
909 aa  162  4e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 
611 aa  162  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 
616 aa  161  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  26.31 
 
 
574 aa  161  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 
3035 aa  161  9e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
739 aa  157  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  28.65 
 
 
459 aa  157  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  29.38 
 
 
633 aa  155  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 
706 aa  154  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1482  putative methyltransferase  30.54 
 
 
514 aa  152  2e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1637  methyltransferase, putative  30.72 
 
 
521 aa  152  3e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1600  para protein  31.48 
 
 
486 aa  152  4e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  25.49 
 
 
1094 aa  152  5e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  27.8 
 
 
667 aa  151  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 
4489 aa  150  9e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  28.54 
 
 
569 aa  150  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>