198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3960 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3960  methyltransferase type 12  100 
 
 
535 aa  1093    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00884367  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2812  methyltransferase type 12  35.58 
 
 
535 aa  283  6.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1668  methyltransferase type 12  35.61 
 
 
535 aa  281  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1624  Methyltransferase type 12  34.47 
 
 
542 aa  273  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0697  hypothetical protein  35.93 
 
 
509 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1897  Methyltransferase regulatory domain, predicted  33.69 
 
 
564 aa  222  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0579  methyltransferase  33.51 
 
 
523 aa  220  3.9999999999999997e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.795709  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1912  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
419 aa  217  4e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1377  Methyltransferase type 12  33.02 
 
 
494 aa  203  5e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1482  putative methyltransferase  34.5 
 
 
514 aa  198  2.0000000000000003e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1732  hypothetical protein  32.83 
 
 
503 aa  197  3e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.228081  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1678  putative methyltransferase  32.74 
 
 
508 aa  194  2e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1600  para protein  34.94 
 
 
486 aa  190  7e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2284  dimethyladenosine transferase  33.88 
 
 
518 aa  187  3e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1637  methyltransferase, putative  32.8 
 
 
521 aa  171  3e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0277  SAM-dependent methyltransferase  26.35 
 
 
482 aa  171  4e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  35.16 
 
 
1144 aa  168  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  29.43 
 
 
1143 aa  162  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2369  Methyltransferase type 12  36.63 
 
 
252 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631765 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0475  methyltransferase type 12  33.46 
 
 
499 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  25.84 
 
 
1116 aa  121  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0362  methyltransferase type 12  30.56 
 
 
518 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.72532  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0031  hypothetical protein  29.17 
 
 
510 aa  108  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.878298  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1222  hypothetical protein  30.49 
 
 
499 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0351348  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0189  hypothetical protein  30.49 
 
 
499 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0465  hypothetical protein  30.49 
 
 
499 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1110  hypothetical protein  30.49 
 
 
499 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1066  methyltransferase type 11  26.52 
 
 
511 aa  83.2  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1462  hypothetical protein  30.49 
 
 
499 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2605  hypothetical protein  30.04 
 
 
499 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1375  hypothetical protein  30.04 
 
 
499 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.59396  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3839  methyltransferase type 11  25.34 
 
 
511 aa  76.6  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0810259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2227  hypothetical protein  29.57 
 
 
514 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.642129  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1398  hypothetical protein  27.94 
 
 
590 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37000  SAM-dependent methyltransferase  24.58 
 
 
488 aa  72.4  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0432577  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3078  methyltransferase type 12  22.83 
 
 
512 aa  63.9  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0137379  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  30.89 
 
 
268 aa  63.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  35.64 
 
 
267 aa  62  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  34 
 
 
268 aa  59.7  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 
268 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 
268 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3050  methyltransferase type 12  30.19 
 
 
224 aa  55.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  27.07 
 
 
440 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1951  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 
357 aa  55.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.066154 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38159  predicted protein  41.1 
 
 
343 aa  55.1  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  25.76 
 
 
395 aa  54.7  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  34.12 
 
 
268 aa  54.7  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2964  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.54 
 
 
408 aa  54.3  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.151793 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  38.75 
 
 
280 aa  53.9  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01774  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.91 
 
 
356 aa  53.5  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.441761  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0383  Methyltransferase type 11  27.43 
 
 
277 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3432  hypothetical protein  23.22 
 
 
507 aa  52.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468772  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  27.48 
 
 
276 aa  52.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6936  putative cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  41.67 
 
 
343 aa  52.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389274  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  31.58 
 
 
341 aa  52  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  24.06 
 
 
399 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0106  putative methyl transferase  24.4 
 
 
205 aa  51.6  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3928  methyltransferase type 11  36.14 
 
 
363 aa  51.6  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.959556 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  32.93 
 
 
268 aa  51.6  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2730  methyltransferase type 12  34.67 
 
 
422 aa  51.2  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184055  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0119  Trans-aconitate 2-methyltransferase  39.24 
 
 
268 aa  51.2  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.464742  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  33.65 
 
 
258 aa  50.8  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1840  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.43 
 
 
345 aa  50.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000670431 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0358  hypothetical protein  29.17 
 
 
258 aa  50.4  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0503  hypothetical protein  27.34 
 
 
278 aa  50.1  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.61991  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  36 
 
 
366 aa  49.7  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
270 aa  49.7  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1504  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.58 
 
 
409 aa  50.1  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.250201  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0817  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 
661 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.975986  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2022  methyltransferase type 11  28.99 
 
 
220 aa  49.7  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.488297  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  30.19 
 
 
269 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1240  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  39.19 
 
 
362 aa  49.3  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0688232  normal  0.839739 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1109  methyltransferase, putative  26.35 
 
 
234 aa  49.3  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.831137  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  34.59 
 
 
624 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2066  Methyltransferase type 12  29.06 
 
 
441 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2195  hypothetical protein  27.43 
 
 
400 aa  48.5  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2206  methyltransferase type 12  24.04 
 
 
403 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0372  methyltransferase type 12  27.49 
 
 
441 aa  48.5  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  29.25 
 
 
269 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2040  Methyltransferase type 12  29.06 
 
 
441 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1727  methyltransferase type 12  26.71 
 
 
230 aa  48.9  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  37.97 
 
 
256 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4232  methyltransferase type 11  24.56 
 
 
234 aa  48.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  29.7 
 
 
344 aa  48.1  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1275  putative methyltransferase  28.79 
 
 
234 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  29.67 
 
 
286 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4840  methyltransferase type 11  39.44 
 
 
341 aa  47.4  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0531482  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1328  Methyltransferase type 12  38.57 
 
 
365 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.352621 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0517  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  37.5 
 
 
228 aa  47  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2111  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
224 aa  47  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296971 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3171  methyltransferase type 11  31.37 
 
 
204 aa  47  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2318  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  36.36 
 
 
359 aa  46.6  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.300919  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2696  Methyltransferase type 12  39.34 
 
 
358 aa  46.6  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.362393 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 
283 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0334  hypothetical protein  29.9 
 
 
258 aa  46.6  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3419  UbiE/COQ5 methyltransferase  25 
 
 
299 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2643  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.66 
 
 
413 aa  46.6  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  28.83 
 
 
360 aa  46.6  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37510  hypothetical protein  30 
 
 
282 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00412109  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6020  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.73 
 
 
252 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>